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原創(chuàng)?xg?生信果

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一文搞定TSS富集熱圖

?今天小果有點(diǎn)憂傷，為什么論文里面的TSS富集圖那么美觀，小果的卻略顯丑陋呢

下面是論文中的TSS富集圖，大家欣賞一下

下面呢則是相比起來略顯不行的小果做的TSS富集圖，大家欣賞一下

?

不比不知道，一比嚇一跳！

小果做的圖里面有很多的”黑線”，十分影響美觀!

這可怎么辦呢，小果趕緊又去仔細(xì)閱讀了deeptools的幫助文檔

上面幾個(gè)參數(shù)是小果仔細(xì)閱讀之后發(fā)現(xiàn)有可能影響“黑線”的關(guān)鍵參數(shù)，不過小果感覺一個(gè)一個(gè)去實(shí)驗(yàn)太麻煩了，只能去求助萬能的度娘，里面有小伙伴說出現(xiàn)黑線是因?yàn)樵谑褂胏omputeMatrix形成矩陣文件沒有添加參數(shù)--missingDataAsZero！小果沒有想到是因?yàn)樾纬删仃囄募膯栴}，幸虧小果沒有一個(gè)個(gè)參數(shù)實(shí)驗(yàn)，那怕不是白白浪費(fèi)時(shí)間！

在了解到了問題所在之后，小果快馬加鞭去實(shí)驗(yàn)了一下，下面是小果的使用computeMatrix命令形成矩陣文件的參數(shù)：

下面是參數(shù)的解釋：

下面是missingDataAsZero 參數(shù)的官方解釋，大家可以試著理解一下嗷

下面來欣賞一下小果新的TSS富集熱圖吧

果然沒有了黑線，是不是比之前更美觀了呢？

今天的關(guān)于TSS富集熱圖的小細(xì)節(jié)學(xué)習(xí)就到這里啦，感興趣的小伙伴可以找小果討論哦，我們明天見咯~

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