LAMMPS教程(1):VMware虛擬機Ubuntu系統(tǒng)安裝
最近入門基于分子動力學(xué)(Molecular?dynamics,MD)的LAMMPS計算軟件,深感網(wǎng)上教程雜亂,因此邊學(xué)邊將一些操作過程整理為教程。老規(guī)矩,先從安裝軟件開始。本文為第一篇,講解安裝Linux系統(tǒng),其實這部分內(nèi)容改自舊文,不過為了完整性,依舊放在這里。下一篇正式講解LAMMPS軟件的安裝。
1. 在Windows系統(tǒng)中安裝VMware虛擬機
VMware Workstation Player虛擬機官方下載地址:
https://www.vmware.com/cn/products/workstation-player/workstation-player-evaluation.html
2. 在VMware虛擬機中安裝Ubuntu系統(tǒng)
Ubuntu系統(tǒng)(https://ubuntu.com/download/desktop)是一款非商業(yè)用途可免費使用的Linux系統(tǒng)。Ubuntu公司每季度會發(fā)布一個新版本,每偶數(shù)年4月發(fā)布正式穩(wěn)定版(LTS,long-term supported),如2022年4月發(fā)布的Ubuntu 22.04 LTS。如果想學(xué)習(xí)Linux系統(tǒng),推薦中國科大的《Linux 101》在線講義(https://101.ustclug.org/)。不過對于學(xué)習(xí)LAMMPS軟件,無需專門學(xué)習(xí)該系統(tǒng),只需熟悉一些基礎(chǔ)指令即可。
3. 配置虛擬機
內(nèi)存建議:略小于最大建議值,至少為Windows系統(tǒng)留1~2G。
線程建議:設(shè)為電腦CPU線程數(shù)。
磁盤建議:若無其他需求,可設(shè)為系統(tǒng)默認(rèn)的20 GB,后續(xù)可擴展。
4. 在Ubuntu系統(tǒng)中安裝net-tools和SSH服務(wù)(用于文件傳輸)
(1) 打開Ubuntu系統(tǒng)的終端(ctrl+alt+T),安裝net-tools:
(2) 安裝SSH服務(wù):
(3) 查看并記住虛擬機的IP地址:
5. 在Windows系統(tǒng)中安裝和配置Xftp軟件(用于文件傳輸)
去Xshell官網(wǎng)(https://www.xshellcn.com/)下載安裝Xftp軟件。打開后新建連接配置如下:
類似地,可以下載Xshell軟件,用類似配置連接。Xshell可用于代替虛擬機Linux系統(tǒng)自帶的終端。(這一步并非必須操作,僅看個人習(xí)慣。)