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利用ORCA在天河二號上并行計算

2021-05-16 23:22 作者:光聲電子  | 我要投稿

(本文使用的orca版本為4.2.0;openmpi版本為3.1.4;廣州超算)

1. 準備算例,如下:

%pal nprocs 4

end

! HF SVP

* xyz 0 1

C 0 0 0

O 0 0 1.13

*


2. 進入算例目錄,輸入vi orca.sh并回車,進入腳本編寫頁面;按i進入編輯模式,輸入以下內(nèi)容,確認無誤后按esc退出編輯模式,輸入:wq保存內(nèi)容并退出腳本編寫頁面

#!/bin/bash

source /WORK/app/toolshs/cnmodule.sh

module purge

module load openmpi/3.1.4

export PATH=/orca安裝路徑/:$PATH

/orca絕對路徑/orca CO.inp > CO.out


3. 輸入sinfo查看分區(qū)及節(jié)點,如下圖;可用分區(qū)名為work



4. 輸入yhbatch -N 1 -p work orca.sh命令提交作業(yè)腳本,其中-N用于指定節(jié)點數(shù),默認為1;-p用于指定分區(qū),work是分區(qū)名稱;orca.sh是上面建立的腳本名稱



5. 輸入squeue并回車,查看任務運行狀態(tài)



6. 計算完成會生成如下幾個文件,用記事本打開out文件,最下面出現(xiàn)ORCA TERMINATED NORMALLY說明計算完成,沒有出錯







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