利用ORCA在天河二號上并行計算
(本文使用的orca版本為4.2.0;openmpi版本為3.1.4;廣州超算)
1. 準備算例,如下:
%pal nprocs 4
end
! HF SVP
* xyz 0 1
C 0 0 0
O 0 0 1.13
*

2. 進入算例目錄,輸入vi orca.sh并回車,進入腳本編寫頁面;按i進入編輯模式,輸入以下內(nèi)容,確認無誤后按esc退出編輯模式,輸入:wq保存內(nèi)容并退出腳本編寫頁面
#!/bin/bash
source /WORK/app/toolshs/cnmodule.sh
module purge
module load openmpi/3.1.4
export PATH=/orca安裝路徑/:$PATH
/orca絕對路徑/orca CO.inp > CO.out
3. 輸入sinfo查看分區(qū)及節(jié)點,如下圖;可用分區(qū)名為work

4. 輸入yhbatch -N 1 -p work orca.sh命令提交作業(yè)腳本,其中-N用于指定節(jié)點數(shù),默認為1;-p用于指定分區(qū),work是分區(qū)名稱;orca.sh是上面建立的腳本名稱

5. 輸入squeue并回車,查看任務運行狀態(tài)

6. 計算完成會生成如下幾個文件,用記事本打開out文件,最下面出現(xiàn)ORCA TERMINATED NORMALLY說明計算完成,沒有出錯


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