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單基因文章?;騅REMEN2上調(diào)預測結腸癌(cc)預后較差

2023-08-23 08:59 作者:275276  | 我要投稿





背景:結腸癌(CC)是全球第五大常見癌癥,對人類健康構成重大風險。盡管Kremen2可作為惡性腫瘤個體的預后指標,但其在評估結腸癌個體預后中的作用尚未得到證實。

方法:在這里,我們通過免疫組織化學 (IHC) 檢查了 CC 組織和配對的鄰近正常組織中 Kremen2 的蛋白表達,然后分析了癌癥基因組圖譜 (TCGA) 數(shù)據(jù)庫中提供的臨床和 RNA-seq 數(shù)據(jù),以確認 Kremen2 之間的關系級別和 CC。此外,還檢查了 Kremen2 mRNA 表達與浸潤免疫細胞之間的關聯(lián)。

結果:研究顯示CC組織中Kremen2的mRNA表達量和蛋白水平較癌旁正常組織升高。根據(jù) Kaplan-Meier 分析,CC 中 Kremen2 的高表達與總生存期和無進展生存期較差有關。臨床相關分析強調(diào),高水平的 Kremen2 表達與腫瘤進展,特別是淋巴結轉移密切相關。Cox 回歸分析強調(diào) Kremen2 是 CC 的獨立預后指標。生物信息學研究強調(diào) Kremen2 可能與 CC 的免疫狀態(tài)有關。

結論:?Kremen2 升高可作為潛在的 CC 預后生物標志物。

結果

Kremen2 在 結腸癌中過度表達

根據(jù) TIMER 數(shù)據(jù),我們觀察到 Kremen2 mRNA 在多種腫瘤中過度表達,TCGA 數(shù)據(jù)分析顯示,CC 組織中 Kremen2 mRNA 水平顯著升高。我們分析了 113 個腫瘤組織和 46 個配對的鄰近正常組織中的 IS,以驗證 CC 中 Kremen2 蛋白的表達。使用非參數(shù)檢驗,我們觀察到 CC 中的 Kremen2 蛋白表達顯著高于鄰近正常組織 (?p?< 0.001)。

Kremen2在不同腫瘤中的mRNA表達基于TIMER數(shù)據(jù)庫,COAD中的mRNA表達基于TCGA數(shù)據(jù)庫。(A) Kremen2 mRNA 在不同種類腫瘤中的表達。(B)未配對比較:與鄰近正常組織相比,COAD 組織中 Kremen2 mRNA 表達升高。(C)配對比較:與鄰近正常組織相比,COAD 組織中 Kremen2 mRNA 表達升高。*:p < 0.05,**:p < 0.01,***:p < 0.001。
通過 IHC 分析 Kremen2 在結腸癌和癌旁正常組織中的蛋白表達。(A)鄰近正常組織 InS = 0。(B)高分化 (G1),腫瘤組織 InS = 0。(C)高分化 (G1),腫瘤組織 InS = 1。(D)中度分化 (G2),腫瘤組織InS = 2。(E)中度分化(G2),腫瘤組織InS = 3。(F)腫瘤組織中Kremen2蛋白的IHC評分升高。放大倍數(shù) × 200,比例尺 = 50 μm。InS:強度評分,IHC:免疫組織化學,CC:結腸癌。

Kremen2蛋白表達與CC個體臨床病理特征的關系

根據(jù)年齡、性別、腫瘤部位、TNM分期、CEA、腫瘤大小、分化、周圍神經(jīng)侵犯、淋巴血管侵犯和MMR進行亞組分析,以確定Kremen2蛋白表達與臨床病理參數(shù)的關聯(lián)。與沒有淋巴結轉移的 CC 個體相比,有淋巴結轉移的 CC 個體的 Kremen2 蛋白表達水平顯著更高 (?p?= 0.036)。此外,我們觀察到 Kremen2 蛋白與 CC 患者的性別和年齡相關。女性患者 (?p?= 0.025) 和年齡 <55 歲的患者 (?p= 0.013)往往具有較高的 Kremen2 蛋白表達。然而,CC 中 Kremen2 蛋白表達與其他臨床病理參數(shù)之間沒有顯著相關性 (?p?> 0.05)?

Kremen2 mRNA表達與臨床特征的關系

當我們基于 TCGA 檢查 CC 患者的臨床病理參數(shù)與 Kremen2 mRNA 表達之間的關系時,我們觀察到高 Kremen2 mRNA 表達與腫瘤 N 分期(從 N0 到 N2 和從 N1 到 N2)相關(p = 0.005?,?0.012 ) 。就 T 階段而言,從 T2 進展到 T3 與 Kremen2 mRNA 表達水平升高相關 (?p?= 0.032)。然而,Kremen2 mRNA 表達與性別、年齡或 M 期無關

基于TCGA的CC患者Kremen2 mRNA表達與臨床病理特征的關系 顯示 Kremen2 mRNA 與(A) N 期、(B) T 期、(C)性別、(D)年齡和(E) M 期的關系的箱線圖。

CC 中高 Kremen2 表達與不良預后相關

采用 K-M 生存曲線來確定 Kremen2 表達與 CC 中生存的關聯(lián)。根據(jù) K-M 圖,Kremen2 mRNA 表達升高的 CC 病例 OS 較短(TCGA,p?= 0.043)和無進展生存期(TCGA,p?= 0.041)。K-M 生存曲線還顯示,高 Kremen2 蛋白表達與不良預后相關(IHC,p?= 0.013)。隨后,采用 ROC 曲線分析來分析 Kremen2 蛋白表達的預測價值,有望預測 CC 的預后價值。在 ROC 曲線上觀察到 1 年、3 年和 5 年的曲線下面積得分(分別為 0.769、0.636 和 0.651)(圖4D)。

Kremen2 高表達水平和低表達水平的 CC 患者的 Kaplan-Meier 生存曲線。(A) Kremen2 mRNA 表達差異的 CC 患者的 OS。(B) Kremen2 mRNA 表達差異的 CC 患者的無進展生存期。(C) Kremen2 蛋白表達差異的 CC 患者的 OS。(D) Kremen2 蛋白表達 1、3、5 年時的 AUC 評分。AUC,ROC 曲線下面積。

Kremen2蛋白表達是CC患者的獨立預后因素

使用 TCGA 的臨床數(shù)據(jù),我們觀察到年齡 (?p?= 0.014)、T 分期 (?p?= 0.007)、N 分期 (?p?= 0.012) 和 M 分期 (?p?< 0.001) 是預后的獨立危險因素患有 CC 的個人。根據(jù)單變量分析結果,Kremen2 mRNA 高表達與不良預后密切相關(p?= 0.001),而在多變量分析中則不相關(p?= 0.107)。此外,單變量 Cox 回歸分析顯示 Kremen2 蛋白高表達與不良預后之間存在顯著相關性 (?p?= 0.017)。其他臨床參數(shù),包括 N 分期 (?p?= 0.009)、M 分期 (?p?= 0.000) 和周圍神經(jīng)侵犯 (?p?= 0.018),與不良預后相關。表3)。此外,多變量分析顯示,Kremen2 蛋白高表達 (?p?= 0.036) 和 M 期 (?p?= 0.001) 與不良預后獨立相關(表3)。

TCGA 中 CC 患者 OS 的單變量和多變量 Cox 回歸分析。(A)單變量 Cox 分析。(B)多變量 Cox 分析。

Kremen2 mRNA水平與免疫細胞浸潤水平的相關性

腫瘤浸潤淋巴細胞可以獨立反映癌癥的生存情況。在此,我們評估了 TCGA-COAD 中 Kremen2 mRNA 表達與 22 種免疫細胞亞型浸潤之間的聯(lián)系。調(diào)節(jié)性T細胞(Treg)(p?= 0.034)和活化的自然殺傷(NK)細胞(p?= 0.020)是高表達組中浸潤水平顯著較高的免疫細胞。低表達組的CD4?+記憶靜息 T 細胞浸潤水平顯著高于高表達組 (?p?= 0.031)。根據(jù)相關性分析,CD8?+?T細胞和活化的NK細胞浸潤與Kremen2 mRNA表達呈正相關

Kremen2 mRNA 水平與免疫細胞浸潤水平之間的關聯(lián)分析。(A)高表達組和低表達組之間的免疫細胞;* p < 0.05。(B) CD8 T 細胞與 Kremen2 mRNA 水平之間的相關性。(C)活化的 NK 細胞與 Kremen2 mRNA 水平之間的相關性。


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