CUT＆RUN技術(shù)提供了一種檢測(cè)細(xì)胞中蛋白-DNA相互作用的快速、可靠且真正的低細(xì)胞數(shù)測(cè)定法。與ChIP實(shí)驗(yàn)不同，CUT＆RUN不存在甲醛交聯(lián)、染色質(zhì)碎裂和免疫沉淀，使之成為一種使蛋白-DNA相互作用富集和檢測(cè)靶基因的更快且更有效的方法。

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CUT＆RUN可在一天之內(nèi)完成從活細(xì)胞到純化DNA的過(guò)程，且經(jīng)證明每次檢測(cè)只需使用少至500-1000個(gè)細(xì)胞。和ChIP中碎裂所有細(xì)胞染色質(zhì)不同，CUT＆RUN利用一種染色質(zhì)抗體靶向消化方法，從而使背景信號(hào)比ChIP實(shí)驗(yàn)低得多。

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因此CUT＆RUN僅需ChIP-seq檢測(cè)所需測(cè)序深度的1/10.zui后，加入簡(jiǎn)單的Spike-in DNA即可準(zhǔn)確定量和標(biāo)準(zhǔn)化靶標(biāo)蛋白結(jié)合，而這是ChIP方法無(wú)法實(shí)現(xiàn)的，這種方法可有效標(biāo)準(zhǔn)化樣品間和實(shí)驗(yàn)間的信號(hào)。

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艾美捷?EpiGentek EpiNext CUT＆RUN快速套件,以優(yōu)惠價(jià)格從低輸入提供無(wú)超聲破碎，以可靠地識(shí)別真正的目標(biāo)蛋白質(zhì)富集區(qū)域并實(shí)現(xiàn)高分辨率定位。可滿足用戶快速富集蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA并繪制全基因組蛋白質(zhì)/DNA相互作用的圖譜的需求。

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EpiNext CUT＆RUN快速套件用于快速富集特定DNA，并與來(lái)自低輸入細(xì)胞/染色質(zhì)的蛋白質(zhì)（組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子），并在體內(nèi)識(shí)別或定位使用Illumina平臺(tái)或其他方法通過(guò)下一代測(cè)序進(jìn)行蛋白質(zhì)-DNA相互作用，如作為qPCR。創(chuàng)新的工作原理、優(yōu)化的協(xié)議和套件組件允許以zui小化的非特異性背景水平捕獲目標(biāo)蛋白質(zhì)/DNA復(fù)合物。這個(gè)捕獲的DNA特別適合于構(gòu)建非條形碼（單復(fù)合）和條形碼（多路復(fù)用）文庫(kù)以較少的偏差和較高的速度映射目標(biāo)蛋白質(zhì)-DNA相互作用區(qū)域高分辨率。

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圖：使用EpiNext? 切斷并運(yùn)行快速試劑盒，對(duì)照抗體捕獲組蛋白DNA復(fù)合物（H3K9me3）來(lái)自從Hela細(xì)胞分離的1 ug染色質(zhì)，用于DNA文庫(kù)制備。290 bps左右的峰值反映了單核小體（150 bps）。

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來(lái)源：https://www.amyjet.com/featured/cutrun-2.shtml