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Pathway干貨 | NF-Kb 信號通路簡介

2022-12-19 16:58 作者:小恒學(xué)術(shù)  | 我要投稿


NF-kB信號通路


NF-kB在細(xì)胞因子誘導(dǎo)的基因表達中起關(guān)鍵性的調(diào)控作用,它調(diào)控的基因編碼急性期反應(yīng)蛋白、細(xì)胞因子、細(xì)胞粘附分子、免疫調(diào)節(jié)分子、病毒瘤基因、生長因子、轉(zhuǎn)錄和生長調(diào)控因子等。通過調(diào)控多種基因的表達,NF-kB參與免疫反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡、腫瘤發(fā)生等多種生物進程。


NF-κB信號通路,由受體和受體近端信號銜接蛋白, IκB激酶復(fù)合物, IκB蛋白和NF-κB二聚體構(gòu)成。當(dāng)細(xì)胞受到各種胞內(nèi)外刺激后,IκB激酶被激活,從而導(dǎo)致IκB蛋白磷酸化,泛素化,然后IκB蛋白被降解, NF-κB二聚體得到釋放。NF-κB二聚體通過各種翻譯后的修飾作用而被進一步激活,并轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核中。在細(xì)胞核里,它與目的基因結(jié)合,以促進目的基因的轉(zhuǎn)錄。


NF-κB信號通路包括經(jīng)典信號通路和非經(jīng)典信號通路,其中,經(jīng)典信號通路的活動過程是:靜止?fàn)顟B(tài)時,NF-kB以無活性的潛在狀態(tài)存在于細(xì)胞漿中,它與抑制因子IkB結(jié)合組成一個三聚體p50-p65-IkB,在IkBs激酶(IKK)催化IkBs的兩個保守的絲氨酸殘基磷酸化, IkBs在SCF-E3泛素化酶復(fù)合體的催化作用下多泛素化而被蛋白酶降解,活化的NF-kB轉(zhuǎn)位到核內(nèi)與與其相關(guān)的DNA基序結(jié)合以誘導(dǎo)靶基因轉(zhuǎn)錄;廣泛的IkBs家族也包括P50和P52前體形式的NF-kB1和NF-kB2,分別是P105和P100。除了P50和P52序列外,這些前體還包括IkB樣的錨蛋白區(qū),它抑制與其相關(guān)的NF-kB亞單位的活性。從前體產(chǎn)生P50和P52的過程還沒有被人完全的理解,但他需要翻譯時和翻譯后的蛋白酶的加工處理活動。在翻譯的同時有就會組成性的產(chǎn)生約等量的P50和P105,雖然這時P50還沒有加工完成。P52的產(chǎn)生主要但不完全是由于信號誘導(dǎo)的P100的加工完成的。不像是IkBa、IkBβ、IkBε的降解,信號誘導(dǎo)的磷酸化及加工P100成P52不需要經(jīng)典的IKK-γ依賴的信號途徑。IKK-a和NF-kB誘導(dǎo)激酶(NIK)是必不可少的,但IKK-β和IKK-γ是不需要的。




以上通路中的重要轉(zhuǎn)錄因子及靶點如下:



一、NF-kB家族


NF-κB家族由P50、P52、P65、c-Rel和RelB五個成員組成。它們分別由NFKB1, NFKB2, RELA, REL和RELB基因進行編碼。每個成員都有一個N端Rel同源結(jié)構(gòu)域(RHD),負(fù)責(zé)其與DNA結(jié)合以及二聚化。在P65、c-Rel和RelB中,存在著轉(zhuǎn)錄激活區(qū)域——TAD,對基因表達起正向調(diào)節(jié)的作用。P50和P52不存在轉(zhuǎn)錄激活區(qū)域,它們的同型二聚體可以抑制轉(zhuǎn)錄。


?

二、IκB蛋白家族


IκB蛋白家族包括八個成員:IκBα、IκBβ、IκBγ、 IκBζ(zeta) 、IκBε、Bcl-3、p100和p105 。主要是在細(xì)胞質(zhì)中與NF-κB二聚體結(jié)合,并對信號應(yīng)答具有重要作用。這些蛋白存在錨蛋白重復(fù)區(qū)域(即多個緊密相連的鉤狀重復(fù)序列,每個重復(fù)序列含有33個氨基酸 )。

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三、IκB激酶復(fù)合物


主要包括IKKα/IKK1 (CHUK) 、IKKβ/IKK2(IKBKB) ,調(diào)節(jié)亞基是NEMO,在某些特定的NF-κB ?信號通路中,IKKα和IKKβ是選擇性需求的。

?


四、IKK復(fù)合物的上游信號


?? 很多胞外刺激信號都可以引起NF-κB 信號通路的激活:

①前炎性細(xì)胞因子,如TNFα、IL-1;

②與細(xì)胞分裂、增殖有關(guān)的因素,如抗原、植物血凝素(PHA)、刀豆素A(ConA)和佛波酯(PMA);

③細(xì)菌毒性產(chǎn)物L(fēng)PS、病毒、雙鏈RNA等;

④物理化學(xué)因子,如紫外線、吐根堿、放線菌酮等;

⑤致凋亡因子,如離子射線、化療藥物。???


IKK復(fù)合物的上游信號銜接蛋白包括TRAFs即TNF受體相關(guān)因子,RIPs即受體作用蛋白;IKK復(fù)合物的激酶包括TAK1即TGFβ-激活性激酶1,NIK即NF-κB誘導(dǎo)激酶。




TNF受體相關(guān)因子TRAFs家族成員是一大類胞內(nèi)接頭蛋白,能直接或間接與多種TNF 和IL-1/Toll-like 受體家族成員結(jié)合。介導(dǎo)多種下游信號通路的信號傳導(dǎo) ,其中包括NF-κB 信號通路。從而影響細(xì)胞的生存、增殖、分化和死亡,并參與多個生物學(xué)過程的調(diào)控。TRAF蛋白家族一共有7個成員,分別是TRAF1、 TRAF2、 TRAF3、TRAF4、 TRAF5、 TRAF6、 TRAF7。


TRAF3是既可以介導(dǎo)NF-κB經(jīng)典信號通路,也可以介導(dǎo)非經(jīng)典信號通路。在經(jīng)典信號通路中,? 其可以與受體直接作用激活I(lǐng)KK復(fù)合物。而在非經(jīng)典信號通路中, TRAF3通過NIK(NF-κB誘導(dǎo)激酶)激活I(lǐng)KKα,從而激活信號通路。



RIPs是經(jīng)典NF-κB信號途徑中的關(guān)鍵的銜接蛋白。RIPs既可以通過蛋白結(jié)合區(qū)域直接作用于信號通路的上游,也可以通過與NEMO結(jié)合激活I(lǐng)KK復(fù)合物。并且,在大多數(shù)的TRAF依賴型信號通路中, RIPs都被牽涉其中。RIP蛋白家族一共有7個成員,分別為RIP1-7。RIP1(作為一個死亡結(jié)構(gòu)域和NEMO的銜接蛋白)與RIP2(作為一個CARD到NEMO的銜接蛋白),在一些NF-κB經(jīng)典信號通路中扮演著類似的角色。通過與NEMO結(jié)合,RIP蛋白招募IKK復(fù)合物。通過NEMO的寡聚化或泛素化依賴機制直接介導(dǎo)IKK復(fù)合物的激活。



TAK1和NIK作為IKK激酶出現(xiàn)在NF-κB信號通路中。其中,在經(jīng)典信號通路中, TAK1被涉及。而在非經(jīng)典信號通路中, NIK有誘導(dǎo)IKKα激活和P100磷酸化的作用。


五、IKK復(fù)合物



IKKα、 IKKβ和 NEMO共同組成了IKK復(fù)合物


IKKα:在經(jīng)典的NF-κB信號途徑中, IKKα并不是必需的。它在NF-κB 受體活化因子( RANK) 引起NF-κB 活化轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑及NF-κB 活化變更途徑中是必需的。IKKα的缺失可導(dǎo)致許多發(fā)育上的缺陷。


?IKKβ:IKKβ是促炎癥反應(yīng)因子刺激誘導(dǎo)NF-κB 的激活的主要激酶。IKKβ缺陷的細(xì)胞對TNFα和IL-1 等刺激不會引起NF-κB 的活化。IKKβ的活化是避免因局部缺血或充血引起嚴(yán)重炎癥反應(yīng)而導(dǎo)致多組織功能喪失所必需的。


NEMO:在經(jīng)典的NF-κB信號通路中, NEMO是必需的。NEMO可能通過與IKKβ和IKKα的直接作用而介導(dǎo)IKK復(fù)合物的組裝, 并且還能促進IκB 蛋白與IKK激酶復(fù)合物的相互作用。


IKK的酶作用底物: IKKα、IKKβ可磷酸化IκBα絲氨酸32、36和 IκBβ的絲氨酸19、23。其中,作為IKK的酶作用底物, IκBα要優(yōu)于IκBβ。大多數(shù)情況下,IκBβ降解速度比IκBα慢。IKKα可以磷酸化P100的絲氨酸672。


六、IκB蛋白

IκB蛋白的主要作用是掩蓋NF-κB的核定位信號,阻止其入核,及其與DNA的結(jié)合,使NF-κB以非活化形式存在于細(xì)胞的胞質(zhì)中 。典型的IκB蛋白包括:IκBα, IκBε和IκBβ;前體IκB蛋白包括:p100 和 p105;非典型的IκB蛋白包括:IκBζ 和? Bcl-3。



七、NF-κB的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)作用

包括P65的磷酸化調(diào)節(jié)和P65的乙酰化調(diào)節(jié)、P53對轉(zhuǎn)錄的競爭性調(diào)節(jié),GSK3β對轉(zhuǎn)錄的間接調(diào)節(jié);NF-κB轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)中的常見的激酶:PKA(蛋白激酶A),MSK1和MSK2(分裂素和壓力激活激酶 )。



八、NF-κB二聚體

一般, NF-κB是以二聚體的形式存在的,而它的二聚體又有兩種存在方式。NF-κB二聚體與IκB蛋白結(jié)合;NF-κB二聚體與DNA結(jié)合。






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