生物化學(xué) 藥立波 b站視頻配套 第十七章:蛋白質(zhì)的生物合成
第十七章:蛋白質(zhì)的生物合成
翻譯:生物體內(nèi)的蛋白質(zhì)以mrna為模板而合成,在這一過程中,mrna上來自DNA基因編碼的核苷酸序列信息轉(zhuǎn)換為蛋白質(zhì)中的氨基酸序列,故稱為翻譯。
第一節(jié):蛋白質(zhì)的生物合成體系
一:mrna是蛋白質(zhì)合成的信息模板
1.方向性:組成密碼子的各堿基在mrna序列中的排列具有方向性。翻譯時(shí)的閱讀方向只能從5;-3;,即從mrna的起始密碼子aug開始,按5;-3;的方向逐一閱讀,直至終止密碼子的出現(xiàn)
2.連續(xù)性:mrna的密碼子之間沒有間隔核苷酸。從起始密碼子開始,密碼子被連續(xù)閱讀,直至終止密碼子出現(xiàn)。
3.簡并性:64個(gè)密碼子中有61個(gè)編碼氨基酸,而氨基酸只有20種,因此有的氨基酸可由多個(gè)密碼子編碼,這種現(xiàn)象稱為簡并性。
4.擺動性:密碼子的翻譯通過與trna的反密碼子配對而實(shí)現(xiàn)。這種配對有時(shí)并不嚴(yán)格遵循堿基配對原則。
5.通用性:從細(xì)菌到人類都使用著同一套遺傳密碼。
二:氨基酰-trna通過其反密碼子與mrna中對應(yīng)的密碼子互補(bǔ)結(jié)合
三:核糖體是肽鏈裝配廠
核糖體的活性部位:
A位=氨基酰位:結(jié)合氨基酰-tRNA
P位=肽酰位:結(jié)合肽酰tRNA
E位=出口位:釋放已經(jīng)卸載了氨基酸的tRNA
四:肽鏈生物合成需要酶類和蛋白質(zhì)因子
起始因子,延長因子,釋放因子
原核生物的起始因子:
If-1:占據(jù)核糖體a位,防止a位結(jié)合其他tRNA
If-2:促使甲酰甲硫氨酰-tRNA與小亞基結(jié)合
If-3:促進(jìn)大小亞基分離;提高p位對結(jié)合甲酰甲硫氨酰-tRNA的敏感性
原核生物的延長因子:
Ef-tu:促進(jìn)氨基酰-tRNA進(jìn)入a位,結(jié)合并分解gtp
Ef-ts:ef-tu的調(diào)節(jié)亞基
Ef-g:有轉(zhuǎn)位酶活性,促進(jìn)mrna-肽酰-tRNA由a位移到p位;促進(jìn)tRNA卸載與釋放
原核生物的釋放因子:
Rf-1:特異識別終止密碼子uaa,uag;誘導(dǎo)轉(zhuǎn)肽酶轉(zhuǎn)變?yōu)轷ッ?/p>
Rf-2:特異識別終止密碼子uaa,uga;誘導(dǎo)轉(zhuǎn)肽酶轉(zhuǎn)變?yōu)轷ッ?/p>
Rf-3:具有g(shù)tp酶活性,介導(dǎo)rf-1及rf-2與核糖體的相互作用
第二節(jié):氨基酸與tRNA的連接
氨基酰-tRNA合成酶:催化氨基酸與相應(yīng)的tRNA的結(jié)合。
一:氨基酰-tRNA合成酶識別特定氨基酸和tRNA
二:肽鏈合成的起始需要特殊的起始氨基酰-tRNA
原核生物:甲酰甲硫氨酰-trna
真核生物:甲硫氨酰-trna
第三節(jié):肽鏈的生物合成過程
一:翻譯起始復(fù)合物的裝配啟動肽鏈的合成
(一)原核生物翻譯起始復(fù)合物的形成
1.核糖體大小亞基分離:
2.核糖體小亞基結(jié)合于mrna的起始密碼子附近
3.甲酰甲硫氨酰-tRNA結(jié)合在核糖體p位上
4.核糖體大亞基結(jié)合形成起始復(fù)合物
(二)真核生物翻譯起始復(fù)合物的形成
1.核糖體大小亞基分離
2.甲硫氨酰-tRNA定位結(jié)合于小亞基p位
3.mrna與核糖體小亞基定位結(jié)合(順序不同)
4.核糖體大亞基結(jié)合
二:在核糖體上重復(fù)進(jìn)行的三步反應(yīng)延長肽鏈
翻譯起始復(fù)合物形成后,核糖體從mrna的5;端向3;端移動,根據(jù)密碼子順序,從n端開始向c端合成多肽鏈。這是一個(gè)在核糖體上重復(fù)進(jìn)行的進(jìn)位,成肽和轉(zhuǎn)位的循環(huán)過程。
1.進(jìn)位:是指一個(gè)氨基酰tRNA按照mrna模板的指令進(jìn)入并結(jié)合到核糖體a位的過程。
2.成肽:是指轉(zhuǎn)肽酶催化兩個(gè)氨基酸間肽鍵形成的反應(yīng)。在起始復(fù)合物中,轉(zhuǎn)肽酶催化p位上的起始tRNA所攜帶的甲硫氨酰與A位上新進(jìn)位的氨基酰-tRNA結(jié)合,形成二肽。第一個(gè)肽鍵形成后,二肽酰-tRNA占據(jù)著核糖體的a位,而卸載了氨基酸的tRNA還在p位。從第三個(gè)氨基酸開始轉(zhuǎn)肽酶催化的是p位上的tRNA所連接的肽?;ca位氨基酰基之間的肽鍵形成。轉(zhuǎn)肽酶的化學(xué)本質(zhì)是rna
3.轉(zhuǎn)位:指的是核糖體沿著mrna的移位,成肽反應(yīng)后,核糖體需要向mrna的3;端移動一個(gè)密碼子的距離,方可閱讀下一個(gè)密碼子。
移位的過程:成肽后位于p位的trna所攜帶的氨基酸在反應(yīng)中交給了a位上的氨基酸,空載的tRNA從核糖體脫落;成肽后位于a位的帶有合成中的肽鏈的tRNA轉(zhuǎn)到了p位上;a位空出,且準(zhǔn)確定位在mrna的下一個(gè)密碼子,以接受一個(gè)新的對應(yīng)的氨基酰trna進(jìn)位。
三:終止密碼子和釋放因子導(dǎo)致肽鏈合成停止
第四節(jié):肽鏈生物合成后的加工和靶向輸送
蛋白質(zhì)的翻譯后加工:新生肽鏈不具有生物學(xué)活性,他們必須折疊形成具有生物活性的三維空間結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)在翻譯后進(jìn)行加工修飾使之成為有活性的蛋白質(zhì)的過程稱為蛋白質(zhì)的翻譯后加工。
蛋白質(zhì)的靶向輸送=蛋白質(zhì)的分選:蛋白質(zhì)合成后在細(xì)胞內(nèi)被定向輸送到其發(fā)揮作用部位的過程稱為蛋白質(zhì)靶向輸送。
一:肽鏈折疊為功能構(gòu)象需要分子伴侶
1.熱激蛋白
2.伴侶蛋白
二:肽鏈的肽鍵水解生成活性蛋白質(zhì)或功能肽
(一)合成后肽鏈的末端被水解加工
(二)肽鏈中肽鍵水解產(chǎn)生多種功能肽
三:肽鏈中氨基酸殘基的化學(xué)修飾增加蛋白質(zhì)功能多樣性
四:亞基聚合形成功能性蛋白質(zhì)復(fù)合物
五:蛋白質(zhì)合成后被靶向輸送至細(xì)胞特定部位
(一)分泌型蛋白在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)加工轉(zhuǎn)運(yùn)
(二)定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的蛋白質(zhì)c-端含有滯留信號序列
(三)大部分線粒體蛋白質(zhì)在細(xì)胞質(zhì)合成后靶向輸入線粒體
(四)質(zhì)膜蛋白質(zhì)由囊泡靶向轉(zhuǎn)運(yùn)至細(xì)胞膜
(五)細(xì)胞核蛋白質(zhì)由核輸入因子運(yùn)載經(jīng)核孔入核
第五節(jié):蛋白質(zhì)生物合成的干擾與抑制
一:許多抗生素通過抑制肽鏈生物合成發(fā)揮作用
抗生素:可以抑制細(xì)胞的蛋白質(zhì)合成,僅作用于原核細(xì)胞蛋白質(zhì)合成的抗生素可作為抗菌藥,抑制細(xì)菌生長和繁殖,預(yù)防和治療感染性疾病。作用于真核細(xì)胞的蛋白質(zhì)合成的抗生素可作為抗腫瘤藥
(一)抑制肽鏈合成起始的抗生素
伊短菌素和蜜旋霉素引起mrna在核糖體上錯位而阻礙翻譯起始復(fù)合物的形成
(二)抑制肽鏈延長的抗生素
1.干擾進(jìn)位的抗生素:四環(huán)素,粉霉素,黃色霉素
2.引起讀碼錯誤的抗生素:氨基糖苷類抗生素,鏈霉素,潮霉素b,新霉素
3.影響成肽的抗生素:氯霉素,林可霉素,大環(huán)內(nèi)酯類如紅霉素,嘌呤霉素,放線菌酮
4.影響轉(zhuǎn)位的抗生素:夫西地酸,硫鏈絲菌肽,微球菌素,大觀霉素
二:干擾素經(jīng)抑制蛋白質(zhì)生物合成而呈現(xiàn)抗病毒作用
干擾素:是真核細(xì)胞被病毒感染后分泌的一類具有抗病毒作用的蛋白質(zhì),可抑制病毒的繁殖。