聚焦用戶需求，持續(xù)迭代更新。全新升級(jí)的時(shí)空云平臺(tái)STOmics Cloud已上線。近期主要更新內(nèi)容如下，詳細(xì)更新內(nèi)容可點(diǎn)擊文末閱讀原文解鎖。

項(xiàng)目管理

項(xiàng)目工具

1.【新增】工作流工具授權(quán)

該功能用于項(xiàng)目間共享工作流。

• 在項(xiàng)目?jī)?nèi)選擇工作流，點(diǎn)擊操作按鈕【授權(quán)】，進(jìn)入授權(quán)版本和授權(quán)項(xiàng)目選擇界面；

• 選擇需要授權(quán)的項(xiàng)目，支持多選項(xiàng)目，確認(rèn)后被授權(quán)的工作流出現(xiàn)在目標(biāo)項(xiàng)目的“引用工作流”分類下，并通過(guò)標(biāo)簽顯示來(lái)源。

2.【新增】批量導(dǎo)入導(dǎo)出工具、工作流

該功能用于導(dǎo)入、導(dǎo)出整個(gè)工具或者工作流的壓縮包，方便跨環(huán)境遷移。

• 工作流、工具管理界面新增【導(dǎo)入】、【導(dǎo)出】按鈕。在系統(tǒng)中選擇要導(dǎo)出的工作流，支持復(fù)選，點(diǎn)擊【導(dǎo)出】按鈕，選擇的工作流會(huì)導(dǎo)出該工作流的所有版本。批量導(dǎo)出的工作流為1個(gè)壓縮包，目錄層級(jí)結(jié)構(gòu)如下：

• 當(dāng)要將工作流導(dǎo)入到項(xiàng)目中時(shí)，點(diǎn)擊【導(dǎo)入】按鈕，從本地選擇文件壓縮包導(dǎo)入，如果有重名工作流，系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)重命名，即在原名稱后增加標(biāo)號(hào)后綴；

• 工具和工作流導(dǎo)入后，需要將鏡像遷移到相應(yīng)的環(huán)境。

3.【新增】工具運(yùn)行

該功能用于工具運(yùn)行。

• 在工具管理界面，工具卡片新增【運(yùn)行】按鈕，點(diǎn)擊【運(yùn)行】按鈕，進(jìn)入運(yùn)行界面。

4.【優(yōu)化】運(yùn)行界面

該功能優(yōu)化了工作流的運(yùn)行界面，支持更復(fù)雜變量的參數(shù)配置。運(yùn)行界面優(yōu)化后包含任務(wù)信息、輸入設(shè)置、輸出設(shè)置。

• 任務(wù)信息為任務(wù)名稱、創(chuàng)建時(shí)間、工作流，任務(wù)名稱可支持修改，工作流可鏈接至工作流詳情；

• 輸入設(shè)置為工作流中定義的參數(shù)，新增二維數(shù)組類型變量錄入，通過(guò)點(diǎn)擊取值框在二維表格中填寫多組元素；

• 輸出設(shè)置為輸出的結(jié)果目錄。

項(xiàng)目任務(wù)

1.【新增】SAW任務(wù)生成的html文件下載

2.【新增】workflow任務(wù)詳情展示

該功能用于查看workflow所運(yùn)行任務(wù)詳情及結(jié)果文件。

• 項(xiàng)目任務(wù)列表、任務(wù)管理列表新增workflow詳情，點(diǎn)擊【詳情】按鈕，展示任務(wù)基本信息、輸入、輸出，?基本信息顯示任務(wù)名稱、流程名稱（版本）、狀態(tài)、創(chuàng)建時(shí)間、完成時(shí)間；

• 點(diǎn)擊輸出文件可跳轉(zhuǎn)至數(shù)據(jù)管理指定文件的位置，在數(shù)據(jù)管理操作文件。

3.【新增】失敗任務(wù)日志

該功能用于查看失敗任務(wù)的錯(cuò)誤日志。

• 在項(xiàng)目芯片、項(xiàng)目任務(wù)管理、任務(wù)管理及首頁(yè)的任務(wù)管理列表中，當(dāng)任務(wù)失敗時(shí)，點(diǎn)擊任務(wù)狀態(tài)【失敗】，展示失敗日志。

4.【新增】任務(wù)取消、啟動(dòng)功能

該功能用于用戶啟用、取消任務(wù)。

• 針對(duì)待分析、運(yùn)行中的任務(wù)，點(diǎn)擊【取消】按鈕，可中止分析，任務(wù)狀態(tài)更新為“取消”；

• 針對(duì)狀態(tài)為“取消”的任務(wù)，可點(diǎn)擊【啟動(dòng)】按鈕，繼續(xù)運(yùn)行中止的分析，狀態(tài)更新為“待分析”。

5.【優(yōu)化】任務(wù)狀態(tài)

該功能優(yōu)化了任務(wù)列表的任務(wù)狀態(tài)。

• 在任務(wù)管理列表中，除圖像預(yù)覽任務(wù)，任務(wù)狀態(tài)統(tǒng)一為待分析、運(yùn)行中、取消、失敗、完成，新增“取消”狀態(tài)。針對(duì)歷史存在的“暫?！睜顟B(tài)，仍保留歷史數(shù)據(jù)，新增任務(wù)無(wú)“暫?！睜顟B(tài)。

6.【優(yōu)化】任務(wù)通知郵箱變更為華大時(shí)空云平臺(tái)：cloud@stomics.tech

數(shù)據(jù)分析

【新增】支持掛載項(xiàng)目數(shù)據(jù)

• 掛載數(shù)據(jù)時(shí)，可選擇數(shù)據(jù)管理掛載方式；

• 掛載后，容器中input目錄掛載數(shù)據(jù)，將掛載本次選擇的數(shù)據(jù)，input目錄之前掛載的數(shù)據(jù)將會(huì)被更新。

項(xiàng)目成員管理

【新增】支持用戶名或郵箱搜索成員

項(xiàng)目數(shù)據(jù)

1.【新增】圖像元數(shù)據(jù)自動(dòng)取值

studio圖像入倉(cāng)后，系統(tǒng)將解析路徑或ipr文件內(nèi)容，從而自動(dòng)取到圖像的以下信息：是否用于分析、染色類型、實(shí)驗(yàn)過(guò)程、QC Resultfile、圖像工具類型。

2.【優(yōu)化】篩選條件及列設(shè)置優(yōu)化

列設(shè)置優(yōu)化，增加了是否用于分析、實(shí)驗(yàn)過(guò)程、QC Resultfile、圖像工具類型等信息，以方便用戶查詢及查看文件信息。

3.【優(yōu)化】元數(shù)據(jù)編輯優(yōu)化

元數(shù)據(jù)編輯界面字段調(diào)整。測(cè)序信息模塊增加字段：CB length、CB start等信息。

流程更新

1.【新增】spatialProteinVisualization_reregister_v0，蛋白手動(dòng)配準(zhǔn)

• spatial_Protein_visualization_v0?且?guī)D的任務(wù)，可在可視化中投遞spatialProteinVisualization_reregister_v0（蛋白手動(dòng)配準(zhǔn)流程）。

可視化

1.【新增】自適應(yīng)binsize調(diào)節(jié)

開(kāi)啟自動(dòng)模式，binsize會(huì)根據(jù)畫布放大倍數(shù)進(jìn)行自動(dòng)調(diào)節(jié)。

• 默認(rèn)展示bin50；

• 放大至15%以上時(shí)，自動(dòng)切換至bin20；

• 放大至40%以上時(shí)，自動(dòng)切換至bin10；

• 放大至100%以上時(shí)，自動(dòng)切換至bin1。

2.【新增】多基因熱圖支持雙擊查看基因詳細(xì)信息

勾選部分基因，切換展示方案至熱圖，雙擊熱圖中某個(gè)bin，可展示當(dāng)前bin中所包含的各基因詳細(xì)數(shù)量。未勾選基因的狀態(tài)下暫不支持此功能，多顏色圖狀態(tài)下也不支持此功能。

3.【新增】支持Cellbin下全基因熱圖展示

Cellbin下可切換至基因表達(dá)熱圖圖層，進(jìn)行細(xì)胞維度下的熱圖展示。

4.【優(yōu)化】圖例功能優(yōu)化，支持切換圖像圖例和聚類圖例

• 非Cluster圖層下，在Image Layer中勾選圖像、或在基因/蛋白列表中勾選復(fù)選框并以multi-colored形式展示后，圖像圖例自動(dòng)顯示；

• Cluster圖層下，默認(rèn)展示聚類圖例，當(dāng)有圖像圖層或基因/蛋白multi-colored圖存在時(shí)，也可手動(dòng)切換至圖像圖例。
  

高級(jí)分析

1.【新增】支持多張芯片批量全流程投遞

• 支持文件增加、刪除，可對(duì)多張芯片的gef文件進(jìn)行批量全流程投遞。

2.【新增】自動(dòng)注釋：支持自定義reference功能，自動(dòng)注釋提供三種reference來(lái)源可選

• Default：可從singleR的默認(rèn)數(shù)據(jù)庫(kù)中選??；

• StereoMiner Database：可從知識(shí)庫(kù)中選?。?/p>

• Data Management：用戶可下載數(shù)據(jù)格式模板，將自定義的reference文件上傳至STOmics Cloud數(shù)據(jù)管理模塊，從數(shù)據(jù)管理模塊中選取。支持rds和h5ad兩種格式。

3.【新增】預(yù)處理：增加預(yù)處理前后統(tǒng)計(jì)信息對(duì)比

• 在PR任務(wù)下，查看預(yù)處理后的結(jié)果時(shí)，支持顯示細(xì)胞數(shù)和平均MID數(shù)進(jìn)行過(guò)濾前后的數(shù)值對(duì)比。

4.【優(yōu)化】自動(dòng)注釋自定義reference：支持對(duì)表格進(jìn)行表頭配置

通過(guò)StereoMiner Database或Data Management選擇自定義reference時(shí)，文件列表支持編輯表頭，以展示用戶更加關(guān)注的信息。

StereoCopilot

1.【新增】支持對(duì)時(shí)空專業(yè)問(wèn)題及時(shí)空云平臺(tái)操作手冊(cè)的智能問(wèn)答

2.【新增】支持本地文獻(xiàn)上傳生成總結(jié)

• 單擊按鈕彈框可選擇本地文獻(xiàn)，文獻(xiàn)大小限制30M以內(nèi)、文件格式限為pdf，同時(shí)文獻(xiàn)內(nèi)容需包含介紹、摘要等內(nèi)容；

• 選擇文獻(xiàn)后自動(dòng)發(fā)送并生成文獻(xiàn)總結(jié)。

3.【新增】基于上傳文件全文的提問(wèn)

文件上傳成功后，可在右側(cè)會(huì)話框輸入問(wèn)題，StereoCopilot將基于上傳文件的內(nèi)容進(jìn)行回答。

4.【新增】功能插件的自定義選擇

在右上方點(diǎn)擊插件按鈕，可選擇需要使用的插件，StereoCopilot將結(jié)合插件功能進(jìn)行回答。

• 時(shí)空知識(shí)問(wèn)答：選擇該插件，StereoCopilot將在時(shí)空專業(yè)知識(shí)庫(kù)搜索相關(guān)答案，并根據(jù)用戶的問(wèn)題進(jìn)行總結(jié)后返回答案；

• 實(shí)時(shí)網(wǎng)頁(yè)搜索：選擇該插件，StereoCopilot將聯(lián)網(wǎng)搜索Google網(wǎng)頁(yè)查詢最新信息，并根據(jù)用戶問(wèn)題進(jìn)行總結(jié)后返回答案。

默認(rèn)選擇時(shí)空知識(shí)問(wèn)答插件，用戶可根據(jù)具體問(wèn)題切換插件的選擇。若不選擇插件，將默認(rèn)使用ChatGPT模型進(jìn)行回答。

幫助中心

1.【新增】時(shí)空云平臺(tái)STOmics?Cloud使用手冊(cè)和版本更新文檔，當(dāng)前版本僅支持中文版手冊(cè)

2.【新增】支持關(guān)鍵詞搜索

• 點(diǎn)擊右上角搜索框或使用快捷鍵ctrl+k，輸入關(guān)鍵詞搜索。

3.【新增】支持切換主題顏色及深色模式

滿足用戶需求，提供更強(qiáng)大的數(shù)據(jù)分析工具是時(shí)空云平臺(tái)STOmics Cloud的核心追求。基于此，STOmics Cloud會(huì)定期進(jìn)行更新迭代，不斷完善產(chǎn)品體驗(yàn)。目前，除了已經(jīng)上線的功能，STOmics Cloud也在根據(jù)用戶實(shí)際科研需求開(kāi)發(fā)新功能，更完善、更智能的功能將陸續(xù)上線。