流式細(xì)胞那些事(一)
流式分析要做好,實(shí)用軟件不能少
自上個(gè)世紀(jì)40年代起,流式細(xì)胞術(shù)經(jīng)過幾十年的發(fā)展,已經(jīng)成為生物學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、藥物學(xué)、材料學(xué)等多領(lǐng)域不可或缺的技術(shù),從環(huán)境微生物檢測(cè)、常規(guī)細(xì)胞功能檢測(cè),到臨床疾病診斷和監(jiān)測(cè),再到腫瘤免疫機(jī)理研究、生物制藥等均有廣泛的應(yīng)用。

作為一個(gè)生物人,工作學(xué)習(xí)中或多或少都有應(yīng)用到流式細(xì)胞術(shù)的場(chǎng)合,但如果單位或平臺(tái)因?yàn)轭A(yù)算有限沒有配置流式細(xì)胞儀,外檢機(jī)構(gòu)提供的流式報(bào)告又不是很符合心意,那么尋找試用版和破解版去分析原始數(shù)據(jù)似乎就成了必經(jīng)之路。然而,試用版往往功能有限且使用期限很短,破解版又存在諸多安裝問題和安全隱患,總找不到很好的解決方法。那么,接下來要介紹的這款流式分析軟件就可以很好地解決這些難題了。

Flowing Software是一款免費(fèi)實(shí)用的流式分析軟件,由Turku Bioscience Center的Perttu Terho等人開發(fā),基于Windows環(huán)境的流式數(shù)據(jù)分析軟件。Flowing Software的操作界面簡(jiǎn)潔容易上手,基礎(chǔ)功能齊全兼容性好,雖然從2013年11月4日后就停止更新,其基礎(chǔ)功能仍舊不遜色于其他商業(yè)流式軟件。
功 能 簡(jiǎn) 介

1.??主界面
菜單欄:建立新的分析文件,打開和保存分析文件,基礎(chǔ)設(shè)置等。Main:建立流式圖,設(shè)置門,導(dǎo)出數(shù)據(jù)列的主要操作區(qū)域。Populations:對(duì)門的屬性(如名稱、顏色)進(jìn)行修改。Tool Properties:對(duì)流式圖的顏色、大小、位置進(jìn)行變更。


2.?Main菜單欄
File:讀取原始數(shù)據(jù),包括FCS及TXT等文件,對(duì)文件進(jìn)行排序等。Edit:撤銷/恢復(fù)上一步操作,復(fù)制粘貼和刪除流式圖,選擇流式圖等。Create:創(chuàng)建流式圖(包括散點(diǎn)圖、直方圖、疊圖等),數(shù)據(jù)查看器,比率計(jì)算器和參數(shù)修改器等。


流式圖的右擊菜單欄:可對(duì)流式圖設(shè)門,選擇門,創(chuàng)建和復(fù)制數(shù)據(jù)列,坐標(biāo)選擇等。

數(shù)據(jù)列的右擊菜單:可對(duì)數(shù)據(jù)列進(jìn)行屬性設(shè)置。

注 意 事 項(xiàng)
1. 支持的文件類型
Flowing Software可以讀取FCS2.0和FCS3.0的標(biāo)準(zhǔn)流式細(xì)胞術(shù)格式(FCS)。但是由于不同品牌不同型號(hào)的儀器在編寫時(shí)會(huì)有差異,會(huì)存在無法讀取所有文件的可能性。
2.?分析文件
保存分析后生成的分析文件是.flow文件,分析文件包括分析方法,門和原始數(shù)據(jù)名稱等信息,但不包含數(shù)據(jù)本身,僅包含引用。如果原始數(shù)據(jù)發(fā)生移動(dòng),打開分析文件時(shí),可能會(huì)警告找不到數(shù)據(jù),此時(shí)需要重新從新的位置加載數(shù)據(jù)。
作者:海星生物 公眾號(hào):Cas9X細(xì)胞基因編輯
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