文獻(xiàn)檢索以及追蹤網(wǎng)站分享(2023年版)
對(duì)于學(xué)生或者科研人員來(lái)說(shuō),閱讀文獻(xiàn)的重要性不言而喻。本文分享了自己從2013-2023年間從本科到博士期間常用的文獻(xiàn)檢索以及追蹤網(wǎng)站。希望能對(duì)各個(gè)層次的朋友都有所幫助。
(此文為2017年版的更新版。前一版本只在實(shí)驗(yàn)室范圍小規(guī)模流傳。這一版在之前的基礎(chǔ)上增添了一些新的工具網(wǎng)站,以及自己的使用心得,發(fā)布在公共平臺(tái)上,希望能給更多的人提供幫助。)
總結(jié):
l? 文獻(xiàn)界的Chat AI:Perplexity https://www.perplexity.ai/
l? 知識(shí)地圖:Open knowledge maps https://openknowledgemaps.org/index
l? 論文數(shù)據(jù)庫(kù):Web of Science https://www.webofscience.com/wos/woscc/basic-search
??????????????????????? PubMed https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
l? 關(guān)聯(lián)文獻(xiàn)檢索:Connected Papers https://www.connectedpapers.com/
l? 文獻(xiàn)追蹤:stork文獻(xiàn)鳥 www.storkapp.me
l? 研究者社區(qū):ResearchGate https://www.researchgate.net/
l? 優(yōu)秀論文推薦:F1000 https://facultyopinions.com/
l? 圖片檢索文章:Open i https://openi.nlm.nih.gov/
l? 文獻(xiàn)互助平臺(tái):科研通 https://www.ablesci.com/
*紅色標(biāo)注的兩個(gè)網(wǎng)站需要付費(fèi)訂閱,其他目前皆為免費(fèi)/公益平臺(tái)

1. 文獻(xiàn)界的Chat AI:Perplexity

2015年,當(dāng)我剛進(jìn)入實(shí)驗(yàn)室的時(shí)候,我從師兄的電腦里繼承了一個(gè) “實(shí)驗(yàn)室新生必讀綜述“的文件夾。老實(shí)說(shuō),現(xiàn)在已經(jīng)畢業(yè)了,這里邊的老文獻(xiàn)我可能也就看了一半。誠(chéng)然,在5-10年前,要了解一個(gè)領(lǐng)域最好的方法可能就是啃上個(gè)十來(lái)篇領(lǐng)域牛人的綜述。然而,如果你現(xiàn)在問我如何進(jìn)入一個(gè)新的領(lǐng)域,我的回答可能是:“不如先去和AI聊聊?”
Perplexity是一個(gè)整合了ChatGPT并可以給出信息來(lái)源的搜索引擎。這無(wú)疑對(duì)科研人員來(lái)說(shuō)是一個(gè)絕妙的工具。回想一下,你為了在論文中插入引用文獻(xiàn)花了多少時(shí)間?當(dāng)然,這只是其中一個(gè)小用途?!癤XX是什么”、“XXX和什么疾病有關(guān)”、“XXX敲除會(huì)有什么表型”這些問題Perplexity都可以為你解答,并給出相應(yīng)的參考文獻(xiàn)。作為一個(gè)成熟的研究人員,Perplexity也可以成為你頭腦風(fēng)暴,思考課題方向和可行性的伙伴。
(參考出處可能是文獻(xiàn),也可能是個(gè)網(wǎng)站文章,要確定內(nèi)容的準(zhǔn)確性,還是點(diǎn)進(jìn)參考看一眼的好。)
2. 知識(shí)地圖:Open knowledge maps

對(duì)于一個(gè)領(lǐng)域新人來(lái)說(shuō),你可能并不知道這個(gè)領(lǐng)域的人們都在研究些什么。如果要去檢索的話,什么才是你的關(guān)鍵詞。這時(shí)候,知識(shí)地圖就派上用場(chǎng)了。
Open Knowledge Maps是一個(gè)根據(jù)關(guān)鍵詞匯總文獻(xiàn)關(guān)聯(lián)性的一個(gè)網(wǎng)站。當(dāng)你丟進(jìn)一個(gè)研究方向,網(wǎng)站會(huì)根據(jù)其找到100篇相關(guān)文獻(xiàn),并根據(jù)關(guān)鍵詞進(jìn)行分類。這樣,你就可以大概知道這個(gè)領(lǐng)域多數(shù)文章都在研究什么方向了。
3. 論文數(shù)據(jù)庫(kù)
人工智能再厲害也無(wú)法取代你的思考。如果真的可以的話,那可能也不需要我們了。工具可以幫助我們更快地了解這個(gè)領(lǐng)域,有效地找到有價(jià)值的文章,省下的時(shí)間和經(jīng)歷就要回歸原始論文和一手實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)了。
下邊的數(shù)據(jù)庫(kù)可能大多數(shù)人都了解了,分享一點(diǎn)點(diǎn)使用心得。
????a) Web of Science?

Web of Science是我最為常用的數(shù)據(jù)庫(kù)了。與PubMed相比,它最大的優(yōu)勢(shì)是可以根據(jù)引用量排序。通常來(lái)說(shuō),我喜歡用WoS搜索最新或者引用最多的文章。如果你不知道這個(gè)領(lǐng)域該讀些什么文獻(xiàn)的話,不如從5年內(nèi)引用最多的文獻(xiàn)讀起。此外,WoS的檢索和篩選也更為簡(jiǎn)單一些,這也是我喜歡用它的一個(gè)原因。
不過,WoS最頭疼的地方在于它是收費(fèi)的。所以,對(duì)于沒有數(shù)據(jù)庫(kù)資源的人或者地方來(lái)說(shuō),WoS是用不了的。另一方面,WoS收錄會(huì)比PubMed慢一些。如果你想找更多文獻(xiàn),記得把核心合集改成所有數(shù)據(jù)庫(kù)。
????b) PubMed

PubMed在科研人中的地位不用贅述。它的公益性和免費(fèi)使得我們可以在任何有網(wǎng)絡(luò)的地方檢索文獻(xiàn)。此外,PubMed也應(yīng)該是常用數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄最全的數(shù)據(jù)庫(kù)了。如果你想追溯一個(gè)概念是怎么被提出的,或是一個(gè)蛋白是怎么被發(fā)現(xiàn)的,PubMed應(yīng)該是最好的選擇了。
4. 關(guān)聯(lián)文獻(xiàn)檢索:Connected Papers

當(dāng)你找到了一篇領(lǐng)域內(nèi)十分重要的文獻(xiàn),接下來(lái)該讀些什么呢?如果在以前,我可能會(huì)在WoS上找找誰(shuí)引用了它,它又引用了誰(shuí),挑幾篇引用量高的文獻(xiàn)接著看。
有了Connected Papers就省了事了。輸入一篇文章,它會(huì)根據(jù)文章的關(guān)聯(lián)度和發(fā)表時(shí)間生成一張網(wǎng)絡(luò)圖。它將幫助你更快的找到下一篇重要的文獻(xiàn)。
5. 文獻(xiàn)追蹤:
????a) stork文獻(xiàn)鳥?

如何追蹤你感興趣的領(lǐng)域和人發(fā)了哪些新研究呢?RSS的時(shí)代可能已經(jīng)過去,社交媒體的新聞刷起來(lái)太累。
試試文獻(xiàn)鳥Stork吧,輸入郵箱和關(guān)鍵詞/人名,一旦有了新論文,就會(huì)推送到你的郵箱。文獻(xiàn)鳥就像一個(gè)鬧鈴,有時(shí)候確實(shí)有點(diǎn)煩人。最近我已經(jīng)把推送頻率改成一周一次了。
b) 研究者社區(qū):ResearchGate

都是混科研的,誰(shuí)還沒幾個(gè)偶像/競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手呢?那就在ResearchGate關(guān)注他們吧,看看他們H指數(shù),看看他們又公布了什么預(yù)印本。你也可以在RG上聯(lián)系作者要論文全文,如果實(shí)驗(yàn)做不出來(lái)也可以發(fā)帖請(qǐng)教,總會(huì)有好心人分享建議的。
c) 優(yōu)秀論文推薦:F1000

另一個(gè)找到好文章的方法就是看看大牛們都推薦什么文章,這里就像是一個(gè)科研圈的大牛點(diǎn)評(píng),各個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的專家會(huì)對(duì)新的研究論文評(píng)星并且寫幾句簡(jiǎn)短的評(píng)語(yǔ)。根據(jù)這些評(píng)分,你也可以輕松找到近期發(fā)表的有趣的或者重要的文章。
不幸的是,這個(gè)網(wǎng)站也是收費(fèi)的,非會(huì)員只能在有限時(shí)間或者查看有限內(nèi)容。希望我們的圖書館也買了會(huì)員吧。
6. 圖片檢索文章:Open i

不知道你有沒有過,需要去搜搜自己的對(duì)照實(shí)驗(yàn)靠不靠譜,別人做出來(lái)的數(shù)值到底高了還是低了。這種時(shí)候再去一篇一篇根據(jù)關(guān)鍵詞搜文獻(xiàn)真是太累了。
直到我發(fā)現(xiàn)了不知道哪個(gè)神仙做出來(lái)的這個(gè)Open i網(wǎng)站,可以直接檢索文獻(xiàn)圖片。用用吧,用用你就知道多好用了。
7. 文獻(xiàn)互助平臺(tái):科研通

不論你的數(shù)據(jù)庫(kù)有多全,總有你找不到的論文。來(lái)科研通發(fā)個(gè)帖吧,會(huì)有世界各地的網(wǎng)友來(lái)幫你。發(fā)布文獻(xiàn)/書籍求助需要平臺(tái)積分,積分可以通過簽到、幫助別人下載文獻(xiàn)或者電子書或者給平臺(tái)捐款獲得。感覺小木蟲又活了過來(lái)呵~
8. 中科院學(xué)位論文檢索系統(tǒng):

最后一個(gè)是中科院圖書館的學(xué)位論文資源。研究論文的實(shí)驗(yàn)方法可能很簡(jiǎn)單,但是你總能在一篇好的博士論文中找到詳盡的實(shí)驗(yàn)方法、完善的背景介紹和深入的討論。字里行間都流露著這位師兄/姐數(shù)年的心血結(jié)晶。
這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的問題在于權(quán)限非常嚴(yán)苛。例如“學(xué)位論文文摘和目錄面向訂購(gòu)用戶開放;學(xué)位論文前16頁(yè)服務(wù)面向中科院各單位開放;學(xué)位論文全文服務(wù)面向論文所屬培養(yǎng)單位開放”。但是你總可以通過“文獻(xiàn)傳遞”,通過圖書館索要全文。
寫在后邊的一些想法:
近些年,我學(xué)到了一個(gè)新詞,叫做“信息繭房”。我想在科研閱讀上也會(huì)遇到同樣的問題。一方面,科研論文浩如煙海,一個(gè)人這輩子也不可能讀完所有論文;另一方面,如果我們只關(guān)注自己的一片小天地,不免視野日漸狹隘。我想創(chuàng)意的很大一部分來(lái)自于學(xué)科的互鑒以及知識(shí)的互通。而現(xiàn)在電子數(shù)據(jù)庫(kù)形成的這種“檢索-閱讀”的方式亦十分不利于視野的擴(kuò)寬。一種解決辦法是去翻一本實(shí)在的雜志,有封面,有目錄,有簡(jiǎn)訊,有長(zhǎng)文,你會(huì)瞥到其他領(lǐng)域也讓你感到有趣的研究。但是,現(xiàn)在每本雜志一期的體量總是讓人望而生畏,加之又有哪些圖書館會(huì)訂閱每期紙質(zhì)雜志供師生借閱呢。我目前還沒有更好的方法,如果大家有更好的方法也歡迎留言交流。
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Francis He
2023.02.19