【質(zhì)譜學(xué)堂】2023年交流群?jiǎn)栴}集（8）
質(zhì)譜學(xué)堂，是一個(gè)專注于質(zhì)譜技術(shù)分享、學(xué)習(xí)、交流的綜合性平臺(tái)。
自平臺(tái)成立以來(lái),經(jīng)過(guò)數(shù)年的發(fā)展沉淀,服務(wù)質(zhì)譜行業(yè)從業(yè)者累計(jì)數(shù)萬(wàn)人，影響力遍及全國(guó)諸多省份乃至國(guó)外。平臺(tái)牢記“用心助力質(zhì)譜行業(yè)發(fā)展”的使命，在質(zhì)譜“小圈子”內(nèi)成就了“大影響”，涉及質(zhì)譜行業(yè)如IVD、DMPK、蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)等諸多領(lǐng)域。
希望能把有共同興趣的陌生人變?yōu)槭烊?，能讓各位進(jìn)群的人通過(guò)群里的分享、討論，讓自己的交流圈擴(kuò)大一些，也希望大家能遇到各種興趣和觀念的同道。讓我們共同打造學(xué)習(xí)和交流的圣地。
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本期的質(zhì)譜學(xué)堂交流群?jiǎn)栴}集由瑾微共同進(jìn)行整理的，歡迎感興趣的朋友多多轉(zhuǎn)發(fā)支持啦！當(dāng)然我們也非常期待更多的液質(zhì)小伙伴加入質(zhì)譜學(xué)堂，一起做最專業(yè)的分享！
01 關(guān)機(jī)流程
Q(Urotropin)：Hallo，我想請(qǐng)問(wèn)一下有沒(méi)有知道請(qǐng)安捷倫G6125B SQ的關(guān)機(jī)流程嗎？請(qǐng)問(wèn)是在操作面板上vent之后等溫度還有真空下降之后就可以直接關(guān)電源了嗎？
A(wt)：進(jìn)度條走完就好了。
Q(Urotropin)：那請(qǐng)問(wèn)油泵會(huì)自動(dòng)關(guān)閉嗎，還是需要手動(dòng)關(guān)閉，另外油泵關(guān)掉之后還需要再放真空嗎，謝謝。
A(Grapefruit cat)：應(yīng)該是先卸真空后關(guān)油泵。液質(zhì)油泵加泵油需要卸真空嗎？
A(見(jiàn)繭)：加油不得停機(jī)械泵嗎？停泵真空就沒(méi)了吧！
A(wt)：你要是前級(jí)泵沒(méi)插在墻上的話，放空的過(guò)程中前級(jí)泵自己就關(guān)掉了，不需要手動(dòng)再去關(guān)了，要是你們前級(jí)泵直接插墻上的插座的話，放空時(shí)候那個(gè)進(jìn)度條走不到底的，等渦輪泵轉(zhuǎn)速下來(lái)之后了，需要手動(dòng)把前級(jí)泵關(guān)掉。
Q(Urotropin)：那么重啟MS的話就是反過(guò)來(lái)對(duì)吧 先開(kāi)油泵（如果在墻上）-打開(kāi)儀器等參數(shù)穩(wěn)定-然后做autotune？
A(wt)：嗯嗯，抽起來(lái)稍微等等時(shí)間再調(diào)諧。
Q(Urotropin)：非常感謝。
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AB Sciex?要求真空度
瑾微：質(zhì)譜開(kāi)關(guān)機(jī)是很關(guān)鍵的操作步驟，如果操作失誤可能會(huì)對(duì)儀器造成損傷。我們這篇文章對(duì)AB Sciex、安捷倫以及waters的質(zhì)譜儀的開(kāi)關(guān)機(jī)流程都有介紹，大家可以對(duì)照操作哦！【您的假期余額已不足，趕快來(lái)開(kāi)啟您的寶貝吧：液質(zhì)（LCMS）開(kāi)關(guān)機(jī)流程】
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02?質(zhì)譜方法開(kāi)發(fā)
Q(beam)：請(qǐng)問(wèn)用sciex的QQQ定量，Q1離子是確定的嗎，做的和文獻(xiàn)中不一樣？Q1和Q3和文獻(xiàn)中的都不一樣的，這也可行嗎？
A（德令哈）：根據(jù)自己打出來(lái)的就行，不同的儀器，小數(shù)點(diǎn)后面可能有些微差別。
Q(beam)：文章中Q1是151， 我的是Q1是115，這行嗎？
A（德令哈）：這肯定不行，最多是小數(shù)點(diǎn)，差幾十肯定不是一個(gè)離子了。
A(ZQK)：脫了兩個(gè)水吧，DP太大，TEM太高。
Q(wt)：我的化合物分子量124，單桿做著沒(méi)問(wèn)題，三桿Scan就找不到124這個(gè)離子了，只有零零碎碎一些，是啥情況？
正離子模式下常見(jiàn)的加合離子
陰離子模式下常見(jiàn)的加合離子
瑾微：我考慮可能是CE較高，將m/z 124的母離子打碎了，可以將碰撞能從低到高調(diào)整，母離子響應(yīng)會(huì)從高到低，碎片離子數(shù)量和響應(yīng)則會(huì)從少逐漸增多。
我愛(ài)吃蝦：?對(duì)開(kāi)發(fā)感興趣的小伙伴，可以關(guān)注【方法開(kāi)發(fā)系列】文章；
液質(zhì)分析方法開(kāi)發(fā)【基礎(chǔ)篇】——質(zhì)譜條件優(yōu)化
液質(zhì)分析方法開(kāi)發(fā)【基礎(chǔ)篇】——液相條件優(yōu)化（上）
液質(zhì)分析方法開(kāi)發(fā)【基礎(chǔ)篇】——液相條件優(yōu)化（下）
液質(zhì)分析方法開(kāi)發(fā)【基礎(chǔ)篇】——前處理?xiàng)l件優(yōu)化
液質(zhì)分析方法開(kāi)發(fā)【基礎(chǔ)篇】——基質(zhì)效應(yīng)
液質(zhì)分析方法開(kāi)發(fā)【基礎(chǔ)篇】——?dú)埩襞c污染
玩轉(zhuǎn)質(zhì)譜|4|：液質(zhì)（LCMS）中常見(jiàn)的子離子
玩轉(zhuǎn)質(zhì)譜|3|：液質(zhì)（LCMS）中化合物常用的幾種掃描模式
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03 16s rDNA測(cè)序
Q(習(xí)簡(jiǎn))：請(qǐng)問(wèn)有人做過(guò)16s rDNA測(cè)序嗎？想請(qǐng)問(wèn)測(cè)序后是可以根據(jù)序列知道具體的菌株嗎？
A(Shape)：16s一般是鑒定到屬的水平。菌株是分不開(kāi)的。
Q(習(xí)簡(jiǎn))：在測(cè)序前，能不能先分離菌株，比如放線菌或者擬桿菌什么的，然后只鑒定感興趣的菌株??？
A(Shape)：主要是在后續(xù)的分析中，會(huì)把序列相似性在97%以上的片段作為一個(gè)物種來(lái)分析。序列相似性太近的話，做16s就沒(méi)有意義。
Q(習(xí)簡(jiǎn))：好的，那16s和系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)有啥關(guān)系啊、
A(Shape)：16s主要就是看一堆細(xì)菌各自的分布。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)我不太懂。
Q(習(xí)簡(jiǎn))：好的好的謝謝你的解答。
瑾微：這個(gè)咱不太懂。。。就附張圖吧~~，此外，還可以參考這篇文章
【微生物組學(xué)干貨 | 16S rRNA基因測(cè)序技術(shù)介紹】
【16S rDNA 測(cè)序簡(jiǎn)介】
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04表面活性劑的清除
Q(Lilly)：大家給看看，什么問(wèn)題,全掃圖 waters。
A (HappyXing)：表面活性劑污染。
Q(Lilly)：對(duì)儀器會(huì)有很大影響嗎，對(duì)其他化合物的定量有沒(méi)有影響呢？
A (HappyXing)：如果是內(nèi)標(biāo)法，理論上對(duì)定量結(jié)果影響較小；外標(biāo)法，就不好說(shuō)了，具體情況具體分析。既然有污染，對(duì)結(jié)果大概率是有影響的，就看你對(duì)數(shù)據(jù)變異的接受程度了。
Q(Lilly)：這種污染，可以沖干凈嗎？咋沖？
A (HappyXing)：先確認(rèn)污染是液相還是質(zhì)譜：斷開(kāi)液相管路，不進(jìn)入質(zhì)譜，看一下質(zhì)譜那邊干擾物在不在，如果不在，基本就是液相污染。不接質(zhì)譜，去掉柱子，沖洗管路，確保管路已經(jīng)沖洗干凈，接質(zhì)譜測(cè)試。確認(rèn)無(wú)污染后，斷開(kāi)質(zhì)譜，再?zèng)_洗柱子，然后再接質(zhì)譜測(cè)試。
瑾微：前處理過(guò)程中最好消除表面活性劑，比如用固相萃取的方法，還有推薦洗柱子的時(shí)候可以加點(diǎn)異丙醇進(jìn)去。還是要逐個(gè)排查吧，先判斷質(zhì)譜，如果質(zhì)譜污染，最好清洗錐孔和四極桿，如果柱子污染，就好好沖柱子吧。。。
表面活性劑?簡(jiǎn)介表面活性劑具有兩性分子結(jié)構(gòu)：一端是親水基團(tuán)，簡(jiǎn)稱親水基，也稱為疏油基或憎油基，能夠使表面活性劑以單體的形式溶在水中。
親水基團(tuán)經(jīng)常為極性基團(tuán)，可為羧基（-COOH）、磺酸基（-SO3H）、氨基（-NH2）或胺基及其鹽，羥基（-OH）、酰胺基、醚鍵（-O-）等也可作為極性親水基團(tuán)；
另一端是疏水基團(tuán)，簡(jiǎn)稱親油基，也稱為疏水基或憎水基。疏水基團(tuán)通常為非極性烴鏈，如疏水的烷基鏈R-（烷基）、Ar-（芳基）等。
表面活性劑分為離子型表面活性劑（包括陽(yáng)離子表面活性劑與陰離子表面活性劑）、非離子型表面活性劑、兩性表面活性劑、復(fù)配表面活性劑、其他表面活性劑等。
表面活性劑溶液中，表面活性劑的濃度達(dá)到一定值后，表面活性劑分子會(huì)形成各種有序的組合體稱之為膠束。膠束化作用或膠束的形成是表面活性劑溶液十分重要的基本性質(zhì)，一些重要的界面現(xiàn)象都與膠束的形成有關(guān)。
使表面活性劑在溶液中形成膠束的濃度被稱之為臨界膠束濃度（Critical Micelle Concentration，CMC）。膠束并不是固定不變的球形，它為極度不規(guī)則、動(dòng)態(tài)變化的形狀。在某些條件下，表面活性劑還會(huì)出現(xiàn)反膠束的狀態(tài)。
影響臨界膠束濃度?主要因素
表面活性劑的結(jié)構(gòu)???
添加劑的加入與類型
溫度的影響? ? ? ? ? ? ??
表面活性劑與蛋白質(zhì)?相互作用蛋白質(zhì)包含非極性、極性和帶電基團(tuán)，許多兩親分子均可以與蛋白質(zhì)發(fā)生各種作用。表面活性劑在不同條件下可形成具有不同結(jié)構(gòu)的分子有序組合體，如膠束、反膠束等，其分別與蛋白質(zhì)相互作用也不同。
蛋白質(zhì)-表面活性劑（Protein-Surfactant，P-S）之間主要存在著靜電作用和疏水作用，離子型表面活性劑與蛋白質(zhì)作用主要是極性基的靜電作用和疏水碳?xì)滏湹氖杷饔?，分別結(jié)合到蛋白質(zhì)的極性和疏水部分，形成P-S的復(fù)合物。
而非離子型表面活性劑主要通過(guò)疏水力與蛋白質(zhì)發(fā)生作用，其疏水鏈與蛋白質(zhì)的疏水基團(tuán)之間的相互作用對(duì)表面活性劑和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能都能產(chǎn)生一定的影響。因此，表面活性劑的類型、濃度和體系環(huán)境決定了表面活性劑是使蛋白質(zhì)穩(wěn)定還是失穩(wěn)，聚集還是分散。
表面活性劑?HLB值表面活性劑要呈現(xiàn)特有的界面活性，必須使疏水基和親水基之間有一定的平衡。HLB（Hydrophile-Lipophile Balance）是表面活性劑的親水-親油平衡值，是衡量表面活性劑的親水疏水性能的指標(biāo)。
HLB值是一個(gè)相對(duì)值（0~40之間），如石蠟HLB值=0（無(wú)親水基），聚氧乙烯為20，親水性較強(qiáng)的SDS其HLB值為40。HLB值可作為選用表面活性劑的參考依據(jù)。HLB值越大，說(shuō)明該表面活性劑的親水性越好；HLB值越小，則說(shuō)明該表面活性劑的親水性越差。
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05氣相色譜柱的選擇
Q(felicita)：?jiǎn)栆幌赂魑焕蠋?，就是DB-5MS的安捷倫氣相色譜柱可以用來(lái)走短鏈脂肪酸嗎？還是對(duì)于極性大的物質(zhì)一定得用極性的氣相柱？（如果得用極性柱的話就得買了）。
A(玉汝于陳)：不一定會(huì)用到。如果分離度好的話，就用吧，非極性柱以沸點(diǎn)分離，如果能跟雜質(zhì)分開(kāi)，就不需要換極性柱，關(guān)注一下樣品的pH，如果酸性太大就得需要硅烷化，減弱酸性，不然對(duì)柱子有損傷。
Q(felicita)：老師，那氣質(zhì)有類似于液質(zhì)的兩通嗎？就是不接柱子測(cè)一下質(zhì)譜條件。之前沒(méi)做過(guò)氣質(zhì)。
A(玉汝于陳)：氣質(zhì)的燈絲能量是固定的，只有傳輸線溫度和推斥極能量可能存在修改優(yōu)化，所以篩選條件時(shí)需要更改的參數(shù)并不多，或者說(shuō)氣質(zhì)的質(zhì)譜那邊不需要優(yōu)化方法。
瑾微：氣相色譜柱的極性可以根據(jù)柱種類不同，分為烴類和硅氧烷類（非極性固定液），聚乙二醇類（極性固定液），而非極性柱的分離順序主要根據(jù)試液的沸點(diǎn)，而極性柱子分離順序除了沸點(diǎn)之外還和物質(zhì)的極性有關(guān)，此外，極性柱子的使用溫度比非極性柱子的使用溫度更低，這種特性使得非極性柱子適合沸點(diǎn)高的物質(zhì)分析。
【做了多年氣相，你真的了解你的色譜柱嗎？】【氣相色譜柱極性分類】
END
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更重要的是有N多大佬發(fā)大紅包。。。。。
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還有一起擺爛、摸魚(yú)的群友
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