• 1. BioSciTools

• 1.1 BioSciTools Introduction

• 1.2 Original intention of design

• 2. BioSciTools Apps and Features

• 2.1 RevCom

• 2.2 CorPlot

1. BioSciTools

最近時間公眾號暫時停更是因為我用一周時間開發(fā)了新的生物信息學(xué)分析程序 BioSciTools (Bioinformatics Science Tools).經(jīng)過深度Java開發(fā)和調(diào)試，終于帶著這個漂亮而強大的程序跟大家見面啦！這篇文章我會展示BioSciTools的開發(fā)初衷、功能簡介、和優(yōu)秀特征。

Description: BioSciTools, a desktop program developed based on Java, aims to make new exploration and contribution to the development of bioinformatics, and realize data analysis and visualization in the fields of sequence analysis, multimomics (transcriptomics, genomics, protein omics, metabonomics, single cell), microbiology, medicine, etc. The program inherits the excellent interactive group, perfect analysis function and beautiful operation interface of HiPlot(https://hiplot.com.cn).

1.1 BioSciTools Introduction

1.(官方網(wǎng)站將不斷更新程序功能、程序下載、版本升級等內(nèi)容)：
Website: https://benben-miao.github.io/BioSciTools-Web/

2.發(fā)布官網(wǎng)的源代碼Github倉庫
Code Github: https://github.com/benben-miao/BioSciTools-Web/

3.版本v1.0.0的下載地址，之后新版本建議通過官網(wǎng)更新
Download: https://download.fastgit.org/benben-miao/BioSciTools-Web/releases/download/1.0.0/BioSciTools-v1.0.0.exe

1.2 Original intention of design

開發(fā)這個程序的初衷在于想將我開發(fā)的Hiplot (https://hiplot.com.cn)生物信息學(xué)分析云平臺的優(yōu)秀分析邏輯、交互組間等優(yōu)勢和TBtools等桌面端程序的功能本地化結(jié)合起來。讓BioSciTools真正成為科研者進行數(shù)據(jù)分析的寶器，適合初級及高級的生物信息學(xué)分析需求，因此我在美化界面、交互友好、功能完善方面做了深入的實現(xiàn)和優(yōu)化。

同時BioSciTools作為我首次完全基于Java開發(fā)的桌面端程序，相比于之前基于VUE.js、Node.js等前端開發(fā)的的Hiplot、R開發(fā)的Shinyapp、Python開發(fā)的Flask,Streamlit等（這些程序我都在Hiplot平臺有開發(fā)），此次讓自己將美的程序交互設(shè)計、完善的程序功能邏輯接口在Java中實現(xiàn)。

最近考上了廈大的博士，因此以后有更多的機會為BioSciTools深入開發(fā)，以后與各位科研者同行共勉。

2. BioSciTools Apps and Features

BioSciTools的子程序剛開發(fā)兩個RevCom 和CorPlot，后續(xù)將繼續(xù)開發(fā)，希望給科研者帶來驚喜的同時后續(xù)更大家共同見證它的不斷完善和成長，相信大家會喜歡我開發(fā)的程序的風(fēng)格。

2.1 RevCom

RevCom: Reverse Complete DNA序列反向互補分析

2.2 CorPlot

CorPlot: Correlation analysis and plot. 基于轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)等組學(xué)數(shù)據(jù)進行對樣本/分組間的Pearson相關(guān)性分析。