前沿篇│如何利用酵母雙雜交研究真菌與植物宿主蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
大麗輪枝菌是一種土壤傳播的植物真菌病原體,可穿透植物根系,并在木質(zhì)部定植,導(dǎo)致植物發(fā)生黃萎病,降低許多重要經(jīng)濟作物的產(chǎn)量。該病原體在世界范圍內(nèi)均有分布,以微菌核形式在土壤中可存活14年以上,且寄主范圍廣泛,危害性強。目前關(guān)于大麗輪枝菌的眾多效應(yīng)因子如何調(diào)節(jié)植物免疫仍有許多未知。
2023年1月,西北農(nóng)林科技大學(xué)胡小平團隊在Microbiology Spectrum上發(fā)表了題為“Verticillium dahliae Effector VdCE11 Contributes to Virulence by Promoting Accumulation and Activity of the Aspartic Protease GhAP1 from Cotton”的研究論文,該研究發(fā)現(xiàn)大麗輪枝菌的一種新效應(yīng)因子VdCE11,它可以與棉花的天冬氨酸蛋白酶(GhAP1)靶向互作,并促進GhAP1的積累,提高其水解酶活性,導(dǎo)致棉花黃萎病易感性增強。
文章思路與結(jié)果
1.尋找效應(yīng)蛋白
通過對 XJ592進行全基因組測序,鑒定到793個分泌蛋白。根據(jù)經(jīng)典的效應(yīng)因子結(jié)構(gòu)特征分析,選擇其中67個作為候選效應(yīng)因子,并瞬轉(zhuǎn)本氏煙,發(fā)現(xiàn)VdCE11會引起煙草葉片細胞死亡(圖1-A)。
2.看效應(yīng)蛋白對植物免疫反應(yīng)系統(tǒng)中的marker影響?
與轉(zhuǎn)GFP對照相比,轉(zhuǎn)的葉片病程防御相關(guān)基因表達量顯著升高、HO積累顯著升高,說明VdCE11在植物免疫應(yīng)答的調(diào)控中起著重要作用(圖1-C、D)。
圖1
3.還發(fā)現(xiàn)VdCE11通過引發(fā)植物免疫反應(yīng),使轉(zhuǎn)VdCE11的煙草葉片抵抗其他真菌(灰葡萄孢菌、核盤菌)能力增強(圖2)。
圖2
4.構(gòu)建效應(yīng)蛋白敲除株,檢測真菌對植物宿主的毒力反應(yīng)變化?
為更深入地了解VdCE11的功能,構(gòu)建大麗輪枝菌ΔVdCE11敲除株,侵染棉花和擬南芥,結(jié)果發(fā)現(xiàn),接種ΔVdCE11突變體后,棉花和擬南芥植株的病害癥狀都比接種野生型XJ592的植株要弱得多。通過回補GFP-tagged VdCE11,大麗輪枝菌毒力恢復(fù),說明VdCE11促進大麗輪枝菌對棉花和擬南芥的毒力效應(yīng)(圖3.A-F)。
而接種大麗輪枝菌ΔVdCE11敲除株的煙草,毒力作用反而減弱,可能與VdCE11會引發(fā)煙草免疫反應(yīng)有關(guān)。說明VdCE11對不同宿主植物的毒力作用不同(圖3.G-H)。
圖3
5.尋找效應(yīng)蛋白在植物宿主中的靶蛋白?
為了尋找VdCE11的宿主靶點,以VdCE11為誘餌,對感染真菌的棉花根系cDNA文庫進行了酵母雙雜交(Y2H)篩選,結(jié)果篩選到互作蛋白GhAP1,并通過Y2H、CoIP等體內(nèi)外實驗對互作進行了證實(圖4)。
圖4
6.進一步分析植物中靶蛋白功能?
對在棉花中篩選到的靶蛋白GhAP1進行研究,首先檢測了棉花接菌后,不同時間GhAP1的表達譜,發(fā)現(xiàn)接菌后24h,GhAP1轉(zhuǎn)錄水平顯著增加。
構(gòu)建沉默植株,接種XJ592,與野生型棉花對比觀察形態(tài)指標(biāo)、真菌定植量、病程相關(guān)基因表達量,發(fā)現(xiàn)沉默棉株,對大麗輪枝菌抗性增強,說明GhAP1是棉花對黃萎病抗性的負調(diào)控因子(圖5)。
圖5
7.檢測效應(yīng)蛋白對靶蛋白含量及活性的影響?
通過檢測共轉(zhuǎn)VdCE11和GhAP1煙草葉片中的GhAP1含量;以及通過體外酶解實驗,發(fā)現(xiàn)VdCE11可以促進GhAP1的積累和酶活性(圖6)。
圖6
總結(jié)
VdCE11在宿主-病原體相互作用中的功能機制預(yù)測模型
本研究鑒定到了一種大麗輪枝菌效應(yīng)因子VdCE11,它可以誘導(dǎo)本氏煙草的細胞死亡和防御反應(yīng)。在棉花、擬南芥中,VdCE11促進大麗輪枝菌對宿主的毒力作用。同時,通過酵母雙雜交篩選,找到了其在陸地棉中的靶蛋白GhAP1。發(fā)現(xiàn)VdCE11可促進GhAP1蛋白的積累,提高其水解酶活性,揭示了大麗輪枝菌毒力效應(yīng)的作用新機制,為認識黃萎病提供了有價值的數(shù)據(jù)模型。
DOI:?10.1128/spectrum.03547-22