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全流程R語(yǔ)言Meta分析核心技術(shù)

2023-09-04 16:12 作者:科研技術(shù)平臺(tái)  | 我要投稿

Meta分析是針對(duì)某一科研問(wèn)題,根據(jù)明確的搜索策略、選擇篩選文獻(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)、采用嚴(yán)格的評(píng)價(jià)方法,對(duì)來(lái)源不同的研究成果進(jìn)行收集、合并及定量統(tǒng)計(jì)分析的方法,最早出現(xiàn)于“循證醫(yī)學(xué)”,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于農(nóng)林生態(tài),資源環(huán)境等方面。R語(yǔ)言擁有完整有效的數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計(jì)分析與保存機(jī)制,可以對(duì)數(shù)據(jù)直接進(jìn)行分析和顯示,命令格式簡(jiǎn)單、結(jié)果可讀性強(qiáng),包含眾多針對(duì)Meta分析軟件包,是進(jìn)行Meta整合分析及評(píng)價(jià)的有效平臺(tái)。課程從文獻(xiàn)計(jì)量分析研究熱點(diǎn)變化,尋找科學(xué)問(wèn)題、R-Meta多手段全流程分析與Meta高級(jí)繪圖多層次分層嵌套模型構(gòu)建與Meta回歸診斷、貝葉斯網(wǎng)絡(luò)、MCMC參數(shù)優(yōu)化及不確定性分析、Meta數(shù)據(jù)缺失值處理的六種方法與結(jié)果可靠性分析、Meta加權(quán)機(jī)器學(xué)習(xí)與非線性Meta分析等方面講解,每個(gè)專題,每一部分結(jié)合多個(gè)典型案例實(shí)踐,深受眾多學(xué)員好評(píng)。

專題一

Meta分析的選題與檢索

1、Meta分析的選題與文獻(xiàn)檢索

1)?什么是Meta分析

2)?Meta分析的選題策略

3)?精確檢索策略,如何檢索全、檢索準(zhǔn)

4)?文獻(xiàn)的管理與清洗,如何制定文獻(xiàn)納入排除標(biāo)準(zhǔn)

5)?文獻(xiàn)數(shù)據(jù)獲取技巧,研究課題探索及科學(xué)問(wèn)題的提出

6)?文獻(xiàn)計(jì)量分析CiteSpace、VOSViewer、R bibliometrix及研究熱點(diǎn)分析

專題二

Meta分析與R語(yǔ)言基礎(chǔ)

2、Meta分析的常用軟件/R語(yǔ)言基礎(chǔ)及統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)

1)?R語(yǔ)言做Meta分析的優(yōu)勢(shì)及其《Nature》、《Science》經(jīng)典案例應(yīng)用

2)?R語(yǔ)言基本操作與數(shù)據(jù)清洗方法

3)?統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)和常用統(tǒng)計(jì)量計(jì)算(sd\se\CI)、三大檢驗(yàn)(T檢驗(yàn)、卡方檢驗(yàn)和F檢驗(yàn))

4)?R語(yǔ)言Meta分析常用包及相關(guān)插件介紹與安裝

從自編程計(jì)算到調(diào)用Meta包(meta、metafor、dmetar、esc、metasens、metamisc、meta4diag、gemtc、robvis、netmeta、brms等),全程分析如何進(jìn)行meta計(jì)算、meta診斷、貝葉斯meta、網(wǎng)狀meta、亞組分析、meta回歸及作圖。

專題三

R語(yǔ)言Meta分析與作圖

3、R語(yǔ)言Meta效應(yīng)值計(jì)算

1)?R語(yǔ)言Meta分析的流程

2)?各類meta效應(yīng)值計(jì)算、自編程序和調(diào)用函數(shù)的對(duì)比

連續(xù)資料的RR、MD與SMD

分類資料的RR和OR

3)?R語(yǔ)言meta包和metafor包的使用

4)?如何用R基礎(chǔ)包和ggplot2繪制漂亮的森林圖

專題四

R語(yǔ)言Meta回歸分析

4R語(yǔ)言Meta分析與混合效應(yīng)模型構(gòu)建

1)?Meta分析的權(quán)重計(jì)算

2)?Meta分析中的固定效應(yīng)、隨機(jī)效應(yīng)

3)?如何對(duì)Meta模型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)和構(gòu)建嵌套模型、分層模型(混合效應(yīng))

4)?Meta回歸和普通回歸、混合效應(yīng)模型的對(duì)比及結(jié)果分析

5)?使用Rbase和ggplot2繪制Meta回歸圖

專題五

R語(yǔ)言Meta診斷分析

5R語(yǔ)言Meta診斷進(jìn)階

1)?Meta診斷分析(t2、I2、H2、R2、Q、QE、QM等統(tǒng)計(jì)量)

2)?異質(zhì)性檢驗(yàn)及發(fā)表偏移、漏斗圖、雷達(dá)圖、發(fā)表偏移統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)

3)?敏感性分析、留一法、增一法、Gosh圖

4)?風(fēng)險(xiǎn)分析、失安全系數(shù)計(jì)算

5)?Meta模型比較和模型的可靠性評(píng)價(jià)

6)?Bootstrap重采樣方法評(píng)估模型的不確定性

7)?如何使用多種方法對(duì)文獻(xiàn)中的SD、樣本量等缺失值的處理

專題六

R語(yǔ)言Meta分析的不確定性

6、R語(yǔ)言Meta分析的不確定性

1)?網(wǎng)狀Meta分析

2)?貝葉斯理論和蒙特拉羅馬爾可夫鏈MCMC

3)?如何使用MCMC優(yōu)化普通回歸模型和Meta模型參數(shù)

4)?R語(yǔ)言貝葉斯工具Stan、JAGS和brms

5)?貝葉斯Meta分析及不確定性分析

專題七

機(jī)器學(xué)習(xí)在Meta分析中的應(yīng)用

7、機(jī)器學(xué)習(xí)在Meta分析中的應(yīng)用

1)?機(jī)器學(xué)習(xí)基礎(chǔ)以及Meta機(jī)器學(xué)習(xí)的優(yōu)勢(shì)

2)?Meta加權(quán)隨機(jī)森林(MetaForest)的使用

3)?使用Meta機(jī)器學(xué)習(xí)和傳統(tǒng)機(jī)器學(xué)習(xí)對(duì)文獻(xiàn)中的大數(shù)據(jù)訓(xùn)練與測(cè)試

4)?如何判斷Meta機(jī)器學(xué)習(xí)使用隨機(jī)效應(yīng)還是固定效應(yīng)以及超參數(shù)的優(yōu)化

5)?使用Meta機(jī)器學(xué)習(xí)進(jìn)行驅(qū)動(dòng)因子分析、偏獨(dú)立分析PDP

專題八

討論與答疑

1、練習(xí)

2、討論與答疑

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