激肽釋放酶(KLK)底物, Kallikrein 6 substrate|1926163-28-1|Abz-AFRFSQ-EDD
迄今為止已描述的最佳人激肽釋放酶6(hK6)FRET底物。
編號: 128981
中文名稱: 激肽釋放酶(KLK)底物, Kallikrein 6 substrate
CAS號: 1926163-28-1
單字母: Abz-AFRFSQ-EDDnp
三字母: Abz-Ala-Phe-Arg-Phe-Ser-Gln-EDDnp
氨基酸個數(shù): 6
分子式: C50H63N15O13
平均分子量: 1082.13
精確分子量: 1081.47
等電點(diǎn)(PI): -
pH=7.0時的凈電荷數(shù): 1
平均親水性: -0.33333333333333
疏水性值: -0.23
來源: Synthetic
儲存條件: -20 ± 5 °C
標(biāo)簽: 酶底物肽
Caspase酶對應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
表1. 人胱天蛋白酶的功能分類:
啟動器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:啟動器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識別位
凋亡啟動器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動caspase激活級聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對于形成死亡誘導(dǎo)信號復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對IETD肽序列具有相對較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動級聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時,它們在級聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因為它放大了來自啟動器Caspase的信號,使用對Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對活化的Caspase-3進(jìn)行檢測,可以檢測Caspase-3的活性。 Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個關(guān)鍵成分組成:Caspase識別序列和信號產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識別序列不同,一般由三個或四個氨基酸組成(表2)。Caspase酶識別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對應(yīng)的Caspase識別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號或抑制信號的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。
表2. Caspase的底物及其序列
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識別序列及生色基團(tuán)組成,常見的生色團(tuán)有pNA(對硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計在405 nm處進(jìn)行光密度檢測。
表3. Caspase的顯色底物
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed?620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過程,其動態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動力學(xué)測定。
圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed?620的激發(fā)和發(fā)射光譜。
表4.熒光半胱天冬酶底物。
底物名稱 對應(yīng)的Caspase Ex(nm) Em(nm) ε1 Φ2
Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
Z-DEVD-AFC 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
Z-DEVD-ProRed?620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
(Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * 半胱天冬酶3、7 500 522 80000 N / D
Z-DEVD-ProRed?620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 376 482 17000 0.53
Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 376 482 17000 0.53
注意:
1.ε=在其最大吸收波長處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1M -1)。
2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。
Caspase抑制劑
Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點(diǎn)結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團(tuán)組成。具有醛官能團(tuán)的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細(xì)胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。
表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑