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SSR批量合成記錄

2023-05-12 15:07 作者:Albert_Xin  | 我要投稿

SSRMMD下載:https://github.com/GouXiangJian/SSRMMD

本人最近在設(shè)計SSR引物,用于跑分子標(biāo)記,然后發(fā)現(xiàn)很多很好用的軟件都可以實(shí)現(xiàn)SSR的查找和引物的設(shè)計,其中TBtools是最好用之一。但是我是mac的系統(tǒng),引物設(shè)計這個插件不是很好的兼容我的系統(tǒng),所以在網(wǎng)絡(luò)上查閱相關(guān)資料后發(fā)現(xiàn)SSRMMD這個軟件能很好的將ssr查找出來并設(shè)計出引物,所以在這里記錄一下。

軟件的下載:

這個軟件不需要特別的安轉(zhuǎn)個,下載好軟件就可以使用。

下面我介紹下mac下面的使用(Windows自行查看說明文檔):

輸入上面的內(nèi)容就可以查看幫助文檔

然后來個最簡單的示例

就能鑒別序列中的SSR

然后用這軟件下面的connetctorToPrimer3進(jìn)行合成引物

-i輸入的是上面SSRMMD-master的結(jié)果文件,然后就可以得到很多SSR引物,然后就拼命的跑膠吧?。?!

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