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“引爆”科研界 | 空間多組學(xué)重磅來(lái)襲

2023-08-31 13:14 作者:中科新生命  | 我要投稿

重 磅 來(lái) 襲 !

空間多組學(xué)

· 領(lǐng)先的空間多組學(xué)平臺(tái)

· 超高性?xún)r(jià)比,項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富

· 提供“—站式”解決方案

優(yōu)惠價(jià):3.8萬(wàn)元起


2022年,《Nature》雜志將空間組學(xué)(Spatial Omics)技術(shù)列為最值得關(guān)注的七大技術(shù)之一,其有可能徹底改變我們對(duì)復(fù)雜組織微環(huán)境和動(dòng)態(tài)生物過(guò)程的理解。盡管近年來(lái)出現(xiàn)了各種空間組學(xué)技術(shù),但在充分發(fā)揮其潛力之前,仍需要解決幾個(gè)艱巨的挑戰(zhàn),其中空間不同組學(xué)間的數(shù)據(jù)整合是一項(xiàng)重大挑戰(zhàn)。盡管困難重重,空間組學(xué)技術(shù)仍以驚人的速度快速發(fā)展,相關(guān)文章呈爆發(fā)式增長(zhǎng),現(xiàn)在已然來(lái)到了黃金時(shí)期。

2023空間多組學(xué)


2020空間轉(zhuǎn)錄組




重磅喜訊

中科新生命技術(shù)團(tuán)隊(duì)潛心研究,打通了空間多組學(xué)從實(shí)驗(yàn)端到分析端的技術(shù)屏障,開(kāi)發(fā)高端對(duì)齊整合算法,解決數(shù)據(jù)整合難題,可以通過(guò)對(duì)同一份樣本連續(xù)切片,實(shí)現(xiàn)對(duì)相鄰切片進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組、空間蛋白質(zhì)組、空間代謝組數(shù)據(jù)的聯(lián)合分析。幫助老師們從系統(tǒng)生物學(xué)維度,結(jié)合不同層面的生物學(xué)信息,多維度的對(duì)生物學(xué)規(guī)律進(jìn)行系統(tǒng)解釋?zhuān)瑢?shí)現(xiàn)從空間維度進(jìn)行表型→機(jī)制的全面揭示。


技 術(shù) 路 線

Technology Roadmap

技 術(shù) 特 色

Product Advantages

1. 搭建領(lǐng)先的空間多組學(xué)高端平臺(tái)

中科新生命搭建了基于10x Genomics CytAssist空間轉(zhuǎn)錄組平臺(tái)、基于Bruker最新MALDI 2 Tims-Tof flex深度空間代謝組平臺(tái)和基于顯微切割的超精細(xì)空間蛋白質(zhì)組平臺(tái)。

空間轉(zhuǎn)錄組:采用10×?Genomics??CytAssist技術(shù)平臺(tái)測(cè)量完整組織切片的mRNA,將mRNA的空間信息與形態(tài)學(xué)內(nèi)容相結(jié)合,并繪制所有基因表達(dá)發(fā)生的位置,獲得生物過(guò)程復(fù)雜而完整的基因表達(dá)圖譜。此平臺(tái)無(wú)須透化優(yōu)化/貼片測(cè)試,操作流程更簡(jiǎn)便,也節(jié)省了樣本使用量,同時(shí)具有檢測(cè)靈敏度高、可選更大的捕獲面積等優(yōu)勢(shì)。中科新生命可提供組織樣品準(zhǔn)備、樣品檢測(cè)、文庫(kù)構(gòu)建、測(cè)序到數(shù)據(jù)分析的全流程服務(wù)。


空間蛋白質(zhì)組:中科新生命擁有豐富的空間樣本處理經(jīng)驗(yàn)以及優(yōu)質(zhì)的蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái),提供樣本制備(組織包埋、組織切片、LCM激光顯微切割)、數(shù)據(jù)檢測(cè)(4D-DIA)、生信分析的一站式服務(wù),并可兼容包括新鮮冷凍樣本、FFPE樣本在內(nèi)的多種類(lèi)型組織。


深度空間代謝組:中科新生命作為國(guó)內(nèi)首家引入MALDI 2 Tims-Tof flex平臺(tái)的服務(wù)商,開(kāi)發(fā)了一站式高端版的深度空間代謝組學(xué)分析解決方案,通過(guò)增加分子分離維度和對(duì)“后電離”技術(shù)的創(chuàng)新應(yīng)用,實(shí)現(xiàn)對(duì)代謝物進(jìn)行空間分布分析的同時(shí)完成高深度的定性定量。同時(shí)借Smartbeam3D激光器實(shí)現(xiàn)激光的精準(zhǔn)聚焦,可以實(shí)現(xiàn)驚人的5μm亞細(xì)胞級(jí)空間成像分析。

實(shí)測(cè)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)部分展示:



2. 打通濕實(shí)驗(yàn)路線

針對(duì)不同包埋方法(CMC、OCT等)進(jìn)行優(yōu)化測(cè)試后,最終選擇對(duì)樣本進(jìn)行OCT包埋,對(duì)包埋組織進(jìn)行連續(xù)切片,相鄰的組織切片分別用于空間轉(zhuǎn)錄組、空間蛋白質(zhì)組和空間代謝組研究,并結(jié)合組織學(xué)染色結(jié)果,為空間多組學(xué)研究提供無(wú)限可能。


3. 豐富的多組學(xué)聯(lián)合分析內(nèi)容

根據(jù)spot信息,開(kāi)發(fā)空間映射和高端整合對(duì)齊算法,獲取多個(gè)維度信息,可實(shí)現(xiàn)空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄+空間蛋白三組學(xué)或者兩組學(xué)的聯(lián)合方案,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行深入的挖掘。部分實(shí)測(cè)分析內(nèi)容展示如下:

圖像對(duì)齊后坐標(biāo)整合(空轉(zhuǎn)+空代)
空間分群(空轉(zhuǎn)+空代)
UMAP分群

(空轉(zhuǎn)+空代)



4. 項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富

作為行業(yè)多組學(xué)產(chǎn)品服務(wù)龍頭公司,中科新生命自搭建空間多組學(xué)平臺(tái)以來(lái),陸續(xù)協(xié)助客戶(hù)完成超200+個(gè)項(xiàng)目,處理800+樣本,積累豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),可以更好地為各位老師的空間組學(xué)項(xiàng)目研究保駕護(hù)航。部分切片經(jīng)驗(yàn)展示:



應(yīng) 用 場(chǎng) 景

Application Scenario

器官空間異質(zhì)性研究

腫瘤免疫微環(huán)境研究

組織原位圖譜研究

疾病病理進(jìn)程研究

神經(jīng)科學(xué)和發(fā)育生物學(xué)研究


應(yīng) 用 案 例

Application Cases

1. Spatially resolved multi-omics deciphers bidirectional tumor-host interdependence in glioblastoma. Cancer Cell(IF= 50.3)

空間代謝組+空間蛋白質(zhì)組+空間轉(zhuǎn)錄組

德國(guó)弗萊堡大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的Dieter Henrik Heiland團(tuán)隊(duì)通過(guò)空間分辨的轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)來(lái)表征膠質(zhì)母細(xì)胞瘤,確定以免疫和代謝應(yīng)激因素為標(biāo)志的隔離的微環(huán)境,揭示了局部區(qū)域腫瘤-宿主的相互依賴(lài)性,從而導(dǎo)致空間特定適應(yīng)性轉(zhuǎn)錄程序的產(chǎn)生。此外,他們將膠質(zhì)母細(xì)胞瘤干細(xì)胞模型植入人類(lèi)和嚙齒動(dòng)物新皮質(zhì)組織模擬各種環(huán)境,證實(shí)了轉(zhuǎn)錄狀態(tài)源于對(duì)各種環(huán)境的動(dòng)態(tài)適應(yīng)。


2.? APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and in?ammatory challenge. Cell Reports(IF= 8.8)

空間代謝組+空間轉(zhuǎn)錄組+單細(xì)胞測(cè)序

University of Kentucky研究團(tuán)隊(duì)結(jié)合單細(xì)胞和空間多組學(xué)技術(shù),系統(tǒng)地描述APOE4在大腦對(duì)衰老、外周炎癥挑戰(zhàn)和淀粉樣蛋白病理學(xué)的反應(yīng)中的作用(有氧糖酵解增加和脂質(zhì)代謝途徑的表達(dá)改變),并提出了結(jié)合代謝和炎癥的治療方法可能在治療和預(yù)防AD方面具有極大的應(yīng)用前景。

文獻(xiàn)解讀:

時(shí)空多組學(xué) | 單細(xì)胞及空間多組學(xué)揭示APOE4在衰老、神經(jīng)炎癥和阿爾茲海默癥中的作用機(jī)制


敲 重 點(diǎn) !

中科新生命自主研發(fā)算法,可提供真正意義上的完整的空間多組學(xué)研究?“一站式”解決方案,包括實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣本檢測(cè)、圖像對(duì)齊、數(shù)據(jù)挖掘等步驟。送福利時(shí)刻到啦!新學(xué)期新氣象,優(yōu)惠多多,誠(chéng)意滿(mǎn)滿(mǎn),快來(lái)聯(lián)系我們吧。


“引爆”科研界 | 空間多組學(xué)重磅來(lái)襲的評(píng)論 (共 條)

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