李定國(guó)揮師入湘，在收復(fù)了大批州縣的同時(shí)，清朝湖南地區(qū)的所有文武官員在續(xù)順公沈永忠率領(lǐng)下逃往岳州。而清定南王孔有德部因?yàn)榕c湖廣清軍相距甚遠(yuǎn)，后方已形成嚴(yán)重的威脅。然而，孔有德本人自視甚高，只派部將孫龍、李養(yǎng)性防守全州，并沒(méi)有派人去把分鎮(zhèn)南寧、柳州、梧州等地的駐軍抽回，繼續(xù)分兵把口，只一心想做他的廣西王。當(dāng)時(shí)奉使廣西的著名文人施閏章描寫(xiě)他在桂林拜謁定南王的情況：孔有德“具言其生平及粵西用兵曲折”，“王顧盼叱咤自豪，言出皆諾，無(wú)能后”，驕橫之狀，躍然紙上。六月間，李定國(guó)率領(lǐng)精銳由武岡、新寧直攻全州，二十八日殲滅全州清軍，守將孫龍、李養(yǎng)性戰(zhàn)死?？子械侣?tīng)聞后大驚，第二天親自帶領(lǐng)桂林留守軍隊(duì)前往興安縣嚴(yán)關(guān)，想要扼險(xiǎn)拒守，結(jié)果被李定國(guó)軍擊敗，“浮尸蔽江下”；當(dāng)日傍晚狼狽奔回桂林，下令緊閉城門(mén)。六月三十日午后，明軍進(jìn)抵桂林城郊?？子械乱?jiàn)定國(guó)軍威甚壯，知道僅憑身邊有限兵力難以守住桂林，于七月初二日飛檄鎮(zhèn)守南寧的提督線國(guó)安、鎮(zhèn)守梧州一帶的左翼總兵馬雄、鎮(zhèn)守柳州一帶的右翼總兵全節(jié)放棄地方，領(lǐng)兵回援省會(huì)。同一天，李定國(guó)大軍即將桂林包圍得水泄不通。明朝降將王允成當(dāng)時(shí)正在孔有德藩下，他過(guò)去同馬進(jìn)忠關(guān)系良好，人稱“王、馬”。馬進(jìn)忠隨李定國(guó)參加桂林戰(zhàn)役，在城下喊話要王允成反正。王允成不敢答應(yīng)，報(bào)告了孔有德。有德自知城中兵力單薄，必破無(wú)疑，考慮再三，對(duì)王允成說(shuō)：“汝姑出應(yīng)之，觀彼何所云以報(bào)我?！蓖踉食杉吹巧铣穷^，同馬進(jìn)忠接洽歸順事宜。據(jù)王允成后來(lái)說(shuō)，孔有德實(shí)際上有投降的企圖，但是因受部將挾制錯(cuò)過(guò)了時(shí)機(jī)。初四日中午，明軍攻破武勝門(mén)，一擁而進(jìn)，清軍抵?jǐn)巢蛔。子械聬澣皇?，悲嘆道：“已矣！”即在明靖江王府內(nèi)自殺，死前命隨從將其所居后殿以及掠得的珍寶付之一炬。在其妻白氏自縊之前把兒子孔庭訓(xùn)托付給侍衛(wèi)白云龍，并囑咐道：“茍得免，度為沙彌。勿效乃父作賊一生，下場(chǎng)有今日耳。”然而孔庭訓(xùn)還是被明軍查獲，幾年后由李定國(guó)下令處斬；他的妹妹孔四貞則乘亂逃出。桂林城里的明朝降臣原慶國(guó)公陳邦傅、其子文水伯陳曾禹、清廣西巡按王荃可、署布政使張星光都被活捉。接著，明軍南下平樂(lè)，殺清府江道周令緒，擒平樂(lè)知府尹明廷等；收復(fù)柳州，俘清右江道金漢蕙。在一段時(shí)間里，李定國(guó)親自坐鎮(zhèn)桂林，又派出軍隊(duì)收復(fù)了廣西各府縣，他還委任總兵徐天佑為廣西巡撫，并且設(shè)置了“布、按、有司”各官。八月初二日，李定國(guó)派人把“偽慶國(guó)公陳邦傅父子二人”和清廣西巡按王荃可、署布政使張星光解赴貴陽(yáng)。九月初二日，秦王孫可望下令把陳邦傅父子押赴市曹剝皮，王荃可、張星光處斬。然后將剝皮揎草的陳邦傅尸體送往安龍等地示眾，“大書(shū)于牌曰：逆犯陳邦傅先經(jīng)肆劫皇杠，摽掠宮人，罪已漏網(wǎng)。不思建功贖罪，輒行背主反叛。今已拿獲，解赴軍前，立將邦傅父子剝皮，傳示滇、黔，云云”。這種處理方式在安龍的永歷朝廷內(nèi)引發(fā)了一件流傳頗廣的軼事：御史李如月上疏劾奏秦王“擅殺勛爵，僭竊之奸同于莽、操，請(qǐng)除國(guó)患；兼敕邦傅罪狀，加以惡謚，用懲奸兇”。永歷帝既畏懼孫可望的專(zhuān)橫，也覺(jué)得李如月的奏疏是非不明，便以小臣妄言為名廷杖四十，奏疏留中不發(fā)，用意是加以保全。不料李如月性格倔犟，偏要太歲頭上動(dòng)土，自己把奏疏另抄一份，封面上寫(xiě)“大明山東道御史揭帖”，遞交孫可望派駐安龍的總提塘張應(yīng)科。孫可望得報(bào)后，立即派人到安龍請(qǐng)命將李如月按處置陳邦傅例剝皮揎草。李如月臨刑時(shí)大罵不屈。這件事后來(lái)被一些封建文人大加渲染，把李如月吹捧為忠臣義士。就事情本身而言，陳邦傅在南明時(shí)位居慶國(guó)公，跋扈殃民；降清時(shí)不僅劫駕未成，又誘殺了宣國(guó)公焦璉，是一個(gè)典型的亂臣賊子，人人得而誅之。孫可望將他處死，無(wú)可非議。李如月卻把早已降清的陳邦傅仍稱為“勛臣”，這不僅是昏庸，而是同他以及南明許多官僚一直把原大順、大西軍視之為“賊”，而對(duì)降清的明朝舊官藕斷絲連的階級(jí)偏見(jiàn)一脈相承。不過(guò)，孫可望命人把這樣一個(gè)迂腐冥頑小官處以極刑，手段又如此殘酷，難免授人以口實(shí)。李定國(guó)占領(lǐng)桂林以后，清定南王藩下提督線國(guó)安、總兵馬雄、全節(jié)帶領(lǐng)府、州、縣官先后竄往同廣東接境的梧州。其中以右翼總兵全節(jié)最為狼狽，他本人于七月十六日逃到梧州，“其兵馬盡行嘩散”，左營(yíng)副將何九成在途中受傷而斃；右營(yíng)副將鄭元?jiǎng)缀椭熊娪螕舨瘫髱ьI(lǐng)兵馬往桂林投誠(chéng)；后營(yíng)副將沈邦清被擊斃。八月，李定國(guó)乘勝揮軍進(jìn)攻梧州，線國(guó)安、馬雄、全節(jié)不敢迎戰(zhàn)，逃入廣東乞憐于平南王尚可喜。這月十五日，明軍收復(fù)梧州，廣西全省均告平定。清朝鎮(zhèn)守廣東的平南、靖南二藩得到孔有德城陷自盡的消息，極為恐慌，急忙命令同廣西接境的“州縣文武官員如賊果薄城，即便相機(jī)護(hù)印入肇，以固根本”。廣東德慶州屬開(kāi)建縣協(xié)守副將謝繼元當(dāng)即率領(lǐng)部下棄城逃到肇慶。這說(shuō)明廣東清朝當(dāng)局已成驚弓之鳥(niǎo)，有意放棄肇慶以西的州縣。由于李定國(guó)很快率領(lǐng)主力北上湖南，不僅未能乘勝進(jìn)軍廣東，連廣西的局勢(shì)也遠(yuǎn)沒(méi)有穩(wěn)固。這年九月間，清軍重新占領(lǐng)梧州；十月，派官進(jìn)駐開(kāi)建。

李定國(guó)收復(fù)廣西全省，功績(jī)非常巨大，在南明史上堪稱空前。它同1648年江西、廣東反正來(lái)歸大不一樣，是力殲強(qiáng)敵大獲全勝的輝煌戰(zhàn)果。以前廣西雖曾處于永歷朝廷管轄之下，瞿式耜、陳邦傅以及忠貞營(yíng)等卻各自為政，不可能把廣西經(jīng)營(yíng)成堅(jiān)固的抗清基地。李定國(guó)軍以雷霆萬(wàn)鈞之勢(shì)，一舉攻克桂林，使廣西、廣東清軍聞風(fēng)喪膽，本來(lái)可以先行穩(wěn)定廣西，相機(jī)收取廣東部分地方，擴(kuò)大南明控制區(qū)?？墒?，孫可望得知清敬謹(jǐn)親王尼堪軍即將進(jìn)入湖南，竟下令調(diào)李定國(guó)部由桂入湘迎戰(zhàn)。這一決策固然成就了李定國(guó)衡陽(yáng)大捷，但從戰(zhàn)略上看，孫可望本應(yīng)留下一部分軍隊(duì)牽制辰州守?cái)承煊?，自己同白文選、馮雙禮等大將率領(lǐng)主力入湘迎戰(zhàn)尼堪。即使需要李定國(guó)出兵會(huì)戰(zhàn)，梧州重鎮(zhèn)也應(yīng)留下足夠的兵力防守。聯(lián)系到下文所述清廷戒諭尚可喜、耿繼茂等切勿輕易出兵廣西，可以看出孫可望在軍事部署上的失算。十月三十日，李定國(guó)親自統(tǒng)領(lǐng)兵馬進(jìn)抵衡陽(yáng)。李定國(guó)主力北上后，他留在廣西的兵力非常單薄，平南王尚可喜趁這個(gè)機(jī)會(huì)令線國(guó)安、馬雄、全節(jié)挑選甲兵會(huì)同廣東水師副將強(qiáng)世爵等從廣東封川出發(fā)，水、陸并進(jìn)，于九月初五日重占梧州，由馬雄鎮(zhèn)守該地。十一月二十八日，徐天佑率部撤往柳州，桂林僅有明朝宗室安西將軍朱喜三留守。清軍乘虛而進(jìn)，十二月二十三日在平樂(lè)擊敗明義寧伯龍韜、總兵廖鳳部，占領(lǐng)該城。次年正月十五日清軍占領(lǐng)陽(yáng)朔，朱三喜部下只有一千多雜牌軍隊(duì)，根本抵擋不住清朝正規(guī)軍。十九日，清軍重占桂林，線國(guó)安、全節(jié)和新任廣西巡撫陳維新盤(pán)踞該地。四月間，明將胡一青曾率軍來(lái)攻桂林，被線國(guó)安等擊退。七月二十一日，李定國(guó)雖曾再次進(jìn)攻桂林，卻未能奏捷。

在桂林大捷之后，李定國(guó)派兵收復(fù)平樂(lè)、梧州、柳州、南寧。八月，明軍入楚，收復(fù)永州、衡州。十月，馬進(jìn)忠攻陷岳州，所至披靡。李定國(guó)又遣軍進(jìn)攻永新、安福，下之，遂圍吉安?！胺财咴?，復(fù)郡十六、州二，辟地將三千里，軍聲大振。