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R語言學習記錄:從nc文件中提取某站點的時間序列

2022-04-04 23:21 作者:孤獨的王大老實  | 我要投稿

今天接到一位姐妹的求助,她要提取某個站點的PDSI,但是不知道怎么整,問我會不會。這等小事不得讓我拿捏一下,我說“坐標,年份,速來”

然后發(fā)現(xiàn)用raster包和terra包提取,有一點區(qū)別,于是再記錄一下。

目的:提取nc格式的站點PDSI

數(shù)據(jù)源:

Drought indices (uea.ac.uk)

https://crudata.uea.ac.uk/cru/data/drought/

Climate Explorer: Select a monthly field (knmi.nl)

http://climexp.knmi.nl/selectfield_obs2.cgi?id=someone@somewhere

法1:raster包stack處理

View一下p,發(fā)現(xiàn)它長這樣

是一個寬數(shù)據(jù)

class一下p,它是一個矩陣

矩陣、數(shù)組

轉(zhuǎn)置一下p

轉(zhuǎn)置以后長這樣

法2:raster包brick處理

brick函數(shù)的結(jié)果和stack一樣

和法1一樣,只不過把柵格做成了brick而不是stack,主要區(qū)別就在于brick函數(shù)秒出結(jié)果,stack函數(shù)足足等了16多分鐘!果然brick函數(shù)效率高啊。


法3:terra包rast處理


terra的處理結(jié)果

terra的處理速度和raster的brick一樣,都是秒出。但是列名(轉(zhuǎn)置后是行名)不一樣,rast讀取的圖層名不如brick函數(shù)輸出的圖層名信息多,brick函數(shù)輸出的圖層名年月日都標上了。這竟然和之前nc轉(zhuǎn)tif的記錄中截然相反。

在nc轉(zhuǎn)tif中,rast讀取的nc文件圖層名是pre_i,brick讀取的nc文件名就只是x1,x2等等。

這提了個醒:讀取nc文件時要這兩種方法都試一試,看看哪個易于后續(xù)操作。

法4:還有更快捷的方法,但是只針對于世界氣象組織網(wǎng)站上的數(shù)據(jù)

Climate Explorer: Select a monthly field (knmi.nl)

http://climexp.knmi.nl/selectfield_obs2.cgi?id=someone@somewhere

這個網(wǎng)站收錄了很多數(shù)據(jù)集,包括這次用到的PDSI。


找到需要的數(shù)據(jù)集


點進去后會要你選擇提取的區(qū)域,提取點還是面,面的話要加一個mask


經(jīng)緯度要確定好是十進制的

點擊make time series

時間序列圖

然后它的時間序列就出來了,還可以下載這個點數(shù)據(jù)的eps,pdf,元數(shù)據(jù),raw data(dat格式),nc文件等等

由于只需要1960到2020年的數(shù)據(jù),在這個頁面的下面還可以進一步限制條件


好多可以限制的條件

限制完了就可以在新的頁面上下載它了。

時間序列
  • 推薦下載dat格式的文件。為什么推薦下載dat格式的文件呢?因為快啊,下載下來的dat格式文件用excel打開,分列,把多余的表頭刪除就ok了。(別問為啥不用R或者Python或者MATLAB打開dat文件,光是開軟件加寫路徑和代碼的工夫excel就在旁邊抽事后煙看著你笑了,效率為王?。。ㄕf到敲文件路徑,昨天還和師妹吐槽來著:MATLAB比R人性化太多了,R就是個垃圾,路徑還得用反斜杠,右下角的目錄窗口更換盤符還得點右邊的三個點)

  • 如果不嫌麻煩,就是想用netcdf來install B,其實也可以。用下面的代碼:

  • metadata。點這個會下載整個數(shù)據(jù)集年份的全球區(qū)域的原始數(shù)據(jù)。如果要轉(zhuǎn)區(qū)域的tif的話可以參考這個

  • pdf。下載一個dat文件的pdf版本,屬實沒必要。

  • eps。我只在ps上用過eps文件,這方面還真沒遇到過,不過圖像文件的封裝方式有很多,估計這也是其中一種。希望有知道這個文件怎么用遙感方式處理的大手子可以來指點一下。


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