科研代碼分享|生物信息分析之SCI熱門圖表-箱型圖和小提琴圖
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真香提示:文末可以知道如何獲取代碼~??
在生物信息學(xué)分析中,箱型圖和小提琴圖是分組中最直觀的可視化方式,通過箱型圖和小提琴圖可以直觀的觀察到不同分組之間基因的表達(dá)差異,因此是做t檢驗(yàn)等必備的可視化方式之一。?
利用純生物信息學(xué)分析發(fā)表高分SCI,箱型圖和小提琴圖是兩組t檢驗(yàn)等必不可少的可視化展示方式。如下圖。這是來自Advanced Science的一篇IF > 16分生信文章。



但是具體要如何實(shí)現(xiàn)??? 今天,小編以代碼提供的數(shù)據(jù)為例進(jìn)行說明。
代碼具體包括:
Step1 輸入數(shù)據(jù)(三個(gè)信息,第一列是樣本,第二列是分期信息,第三列是基因表達(dá)值)
Step2 R代碼繪制箱型圖和小提琴圖
下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的箱型圖

下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的小提琴圖

神奇吧,就是如此簡單,我們用的都是入門級函數(shù),稍微懂點(diǎn)R語言就能實(shí)現(xiàn)。
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