項目文章Pharmacol Res(IF 10)|中山大學附屬第三醫(yī)院利用轉錄組和蛋白組分析揭示MU

非酒精性脂肪肝(NAFLD)以肝臟內(nèi)甘油三酯的過度積聚為特征,與代謝紊亂密切相關。肝臟負責豐富的蛋白質(zhì)合成和代謝穩(wěn)態(tài)的協(xié)調(diào)。在疾病條件下,超負荷的蛋白質(zhì)合成超過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)的儲存能力,損害其在肝細胞中的功能完整性,這可能會促進內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激。此外,受損的胰島素信號傳導導致葡萄糖/脂質(zhì)儲存和處置的失衡,引發(fā)一系列細胞內(nèi)應激信號以響應代謝紊亂,在NAFLD的病理生理學中發(fā)揮重要作用。然而,在各種研究中,NAFLD中肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激是增強還是抑制仍存在爭議。此外,關于ER應激反應受損如何影響代謝以及哪些ER應激反應分子參與了這一過程,目前還知之甚少。中山大學附屬第三醫(yī)院陳燕銘/石國軍教授團隊在PHARMACOL RES發(fā)表題為Secreted MUP1 that reduced under ER stress attenuates ER stress induced insulin resistance through suppressing protein synthesis in hepatocytes的研究論文,該研究利用轉錄組和蛋白組數(shù)據(jù)分析揭示了MUP1減輕肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激的關鍵作用,重組MUP1或其潛在衍生物可能是緩解NAFLD的一個有效的治療靶點。其中,中科新生命提供了轉錄組和蛋白組的檢測和技術支持服務。

研究材料
小鼠肝臟組織、血清、尿液、小鼠原代肝細胞、AML12細胞、HepG2細胞
?技術路線
步驟1:在NAFLD小鼠模型中,肝組織中MUP蛋白顯著減少;
步驟2:在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激下,肝細胞中MUP1蛋白表達和分泌減少;
步驟3:MUP1刺激肝細胞中的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣流出并誘導急性內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應;
步驟4:MUP1干預能夠引起肝細胞預適應于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激,進而緩解藥物引起的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激引起的胰島素抵抗。
?研究結果
1.??NAFLD小鼠肝臟中MUP蛋白減少
生理指標檢測結果發(fā)現(xiàn)NAFLD小鼠表現(xiàn)出體重過度增加、肝臟與體重和脂肪與體重的比率增加,以及肝臟甘油三酯含量顯著增加。為了進一步探討NAFLD小鼠肝臟內(nèi)蛋白質(zhì)的變化,作者采用了蛋白質(zhì)組學分析,結果顯示NAFLD小鼠的多種MUP亞型的顯著下降,其中MUP1亞型可能對代謝貢獻最大。這些數(shù)據(jù)表明MUPs,尤其是MUP1,可能是參與NAFLD代謝調(diào)節(jié)的重要因子。

2. NAFLD小鼠肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應受損
KEGG分析顯示,“內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的蛋白質(zhì)加工”途徑顯著豐富。NAFLD小鼠中,未折疊蛋白應答(UPR)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關蛋白降解(ERAD)途徑的表達模式發(fā)生了明顯改變。且WB結果顯示,在NAFLD小鼠的肝臟中,IRE1α和PERK的水平顯著增加,而p-eIF2α、ATF4和BiP的水平顯著降低,這表明在代謝紊亂和肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應中UPR信號失調(diào)導致內(nèi)質(zhì)網(wǎng)負擔增加。這些數(shù)據(jù)表明,在NAFLD小鼠模型中,肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應受損?。??

3. ?內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激下肝細胞MUP1的表達降低
接下來,作者將NAFLD小鼠和對照小鼠腹腔注射衣霉素(Tm,一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激誘導劑)或等量DMSO以建立肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激小鼠模型,蛋白質(zhì)檢測結果顯示MUPs的水平在肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激模型中顯著降低。WB分析證實了MUP1在肝臟中的類似表達模式。因此,MUPs被鑒定為代謝和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應蛋白,這表明MUPs可能是NAFLD中內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激和代謝的潛在聯(lián)系。

4. 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激誘導肝細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中MUP1聚集
為了解決MUP1響應內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激而降低的機制,對肝臟切片進行免疫熒光染色以確定MUP1在肝臟中的分布。共聚焦顯微鏡分析顯示,與對照小鼠相比,MUP1保留在Tm小鼠的肝細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中。進一步表明內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激下MUP1在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的滯留增加,這部分解釋了細胞中成熟MUP1的減少。

5. MUP1刺激肝細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中鈣離子外流并誘導急性內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激
用MUP1處理原代肝細胞并進行RNA測序,GSEA分析顯示,“鈣信號通路”顯著富集(圖5B)。由于鈣穩(wěn)態(tài)對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)穩(wěn)態(tài)和細胞命運至關重要,因此,作者推測MUP1作為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應蛋白,可能通過反饋參與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激的調(diào)節(jié)。為了進一步研究MUP1對肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激的影響,用毒胡蘿卜素(thapsigargin,Tg)作為調(diào)節(jié)Ca2+濃度的陽性對照。結果顯示,MUP1處理瞬時刺激內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激途徑。值得注意的是,MUP1對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激的影響與Tg相似,表明MUP1對Ca2+穩(wěn)態(tài)的潛在作用。而在無Ca2+溶劑中用MUP1處理,Ca2+從ER流出,顯著增加了胞漿Ca2+濃度。這些數(shù)據(jù)表明,MUP1刺激肝細胞中的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣離子外流并誘導急性內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應。

6. MUP1預處理抑制蛋白質(zhì)合成并減輕肝細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激和胰島素抵抗
為了進一步研究MUP1在短暫刺激內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激中的生理意義,將原代肝細胞用MUP1預處理后用Tm處理誘導應內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激。WB和轉錄組結果表明,Tm顯著增加了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激標志物的蛋白質(zhì)水平,包括GADD34、ATF4、CHOP、XBP1s和p-eIF2α,而MUP1預處理可抑制ER應激。接下來,作者評估了抑制肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激對胰島素反應的影響。MUP1預處理細胞受到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激時,Akt顯著增強,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激標記物顯著減弱,這表明胰島素敏感性和肝內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激得到改善。該數(shù)據(jù)表明,MUP1預處理在體外減輕了肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激誘導的胰島素抵抗。

7. MUP1預處理減輕Tm誘導的肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激
為了評估MUP1在體內(nèi)的病理生理作用,用MUP1預處理小鼠然后腹腔注射Tm以建立急性內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激模型,Tm處理導致明顯的肝臟甘油三酯積聚和空泡化,MUP1預處理組有所改善,結果表明MUP1預處理減輕了Tm誘導的過度肝臟脂肪變性。同時,作者還研究了腎臟中的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應。有趣的是,MUP1預處理顯著減輕了Tm誘導的腎內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激,這表明MUP1對體內(nèi)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激反應的影響?。

?小編小結
在這項研究中,作者提供了肝臟MUPs顯著降低導致內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激受損的證據(jù)。MUP1作為MUP家族中最豐富的成員,由內(nèi)質(zhì)網(wǎng)合成和加工,它受到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激的負調(diào)節(jié)。從機制上講,肝臟內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激導致MUP1形成聚集體并被困在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,從而減少MUP1的分泌。此外,在肝細胞中補充重組MUP1增加了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣離子外流至胞漿中,并短暫誘導預適應內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激,這有助于肝細胞通過抑制蛋白質(zhì)合成來減輕化學誘導的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激誘導的胰島素抵抗,表明NAFLD的潛在治療靶點。