引領(lǐng)4D蛋白組學(xué)新標(biāo)準(zhǔn)：更高深更靈敏更精準(zhǔn)——鹿明生物
2022年3月9號(hào)，鹿明生物新購(gòu)設(shè)備timsTOF Pro2全新上線，為更好地滿足客戶的需求，推動(dòng)蛋白組學(xué)研究新高度，加強(qiáng)行業(yè)蛋白組學(xué)的研究更快、更靈敏。鹿明生物繼timsTOF Pro后，繼續(xù)加強(qiáng)蛋白組深度研究，為4D Proteomics更快、更靈敏“添磚加瓦”。
與小鹿一睹timsTOF Pro2進(jìn)駐全過程吧~
隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展，特別是離子淌度的引入，增加了一個(gè)新的分離維度，將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面，打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸，大幅度的提高掃描速度和檢測(cè)靈敏度，帶來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測(cè)周期、定量準(zhǔn)確性等性能的全面提升，可以更好的解決大隊(duì)列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測(cè)。
相比于timsTOF Pro，timsTOF Pro 2 配備了最新一代雙TIMS分析器，離子容量可提高三倍。經(jīng)過簡(jiǎn)化的離子透鏡最大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精準(zhǔn)，也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析，在短梯度下實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋。
tims TOF Pro2依賴于雙捕集離子淌度（TIMS）和同步累積連續(xù)碎裂（PASEF）數(shù)據(jù)采集模式兩大創(chuàng)新技術(shù)，可實(shí)現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性。同時(shí)，其配備了最新一代雙 TIMS 分析器，離子容量可提高三倍，最大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度，讓蛋白質(zhì)組學(xué)分析再上一個(gè)新的臺(tái)階，鹿明生物同時(shí)配備了Evosep One高通量色譜使其在短梯度下也能實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋，結(jié)果更精準(zhǔn)，也成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。
tims TOF Pro2特點(diǎn)：
1.更高掃描速度：助力臨床大隊(duì)列項(xiàng)目研究
PASEF? 驅(qū)動(dòng)的timsTOF Pro 2 可以實(shí)現(xiàn)超過120 Hz的掃描速度，使用PASEF 可以實(shí)現(xiàn)對(duì)低豐度肽段離子多次重復(fù)選擇并碎裂，以提高低豐度肽的二級(jí)譜圖質(zhì)量，從而實(shí)現(xiàn)了更高置信度的肽譜匹配而不會(huì)損失靈敏度和分辨率，在高通量的同時(shí)保證分析鑒定的質(zhì)量。將tims TOF Pro 2 和Evosep One的強(qiáng)大組合應(yīng)用于新冠病毒感染患者血清蛋白質(zhì)組學(xué)研究，實(shí)現(xiàn)60樣本/天（SPD）方法和PASEF 進(jìn)行采集，在720 份樣本中，310±18 種蛋白質(zhì)被定量，其中包括70 多種潛在的生物標(biāo)志物，為分析大隊(duì)列研究提供了寶貴視角。
2.更高覆蓋深度：助力蛋白組鑒定到更多的蛋白數(shù)量
憑借全新的TIMS 裝置和新優(yōu)化的dda-PASEF 方法，使用 HEK酶切樣本，tims TOF Pro 2 單針上樣200 ng，在60 分鐘梯度下能夠鑒定超過7,000種蛋白質(zhì)和超過60,000條多肽，達(dá)到了前所未有的蛋白質(zhì)組學(xué)覆蓋深度。
3.超高靈敏度：助力微量樣本蛋白組分析
隨著某些特定細(xì)胞、少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本的研究需求越來(lái)越多，極微量蛋白組定量分析變得至關(guān)重要，而采用高靈敏度的質(zhì)譜儀是對(duì)微量樣本進(jìn)行定量分析的關(guān)鍵。timsTOF Pro 2 上樣20ng HeLa 樣本，在30分鐘梯度下即能夠鑒定超過4,200 個(gè)蛋白和接近30,000 條多肽。
4.鑒定更可信：助力蛋白或化合物更高可信度的鑒定
利用PASEF 的速度和TIMS 對(duì)碰撞截面積（CCS）的精確測(cè)定大幅提高DIA 分析能力。dia-PASEF 比傳統(tǒng)的DIA 方法有更高靈敏度和選擇性，排除單電荷母離子降低本底噪音干擾，利用分子量和碰撞橫截面 CCS 值的相關(guān)性，實(shí)現(xiàn)高可信度的鑒定。
5. 高靈敏度修飾肽段同分異構(gòu)體分離：助力修飾蛋白組分析
dia-PASEF 在timsTOF Pro 2 上的高靈敏度、掃描速度和重現(xiàn)性可以實(shí)現(xiàn)低樣本量的修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析。例如可以實(shí)現(xiàn)小鼠腦樣本起始總蛋白量?jī)H為25μg的磷酸化蛋白質(zhì)組的非標(biāo)記定量分析，使用Evosep的30 樣本/天的分析方法，三次重復(fù)可鑒定出多達(dá)4473個(gè)特有的磷酸化多肽。
采用PASEF 技術(shù)能夠鑒定27,768 個(gè)磷酸化肽，展現(xiàn)了淌度輔助質(zhì)量對(duì)齊(MOMA) 的優(yōu)勢(shì)。1946 條鑒定的共洗脫異構(gòu)體中，20% 的異構(gòu)體可以被TIMS完全分離，這使得我們可以更好地理解蛋白磷酸化準(zhǔn)確位點(diǎn)信息。
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鹿明生物tims TOF Pro服務(wù)及應(yīng)用產(chǎn)品：
上海鹿明生物科技有限公司多年來(lái)，一直專注于生命科學(xué)和生命技術(shù)領(lǐng)域，是國(guó)內(nèi)早期開展以蛋白組和代謝組為基礎(chǔ)的多層組學(xué)整合實(shí)驗(yàn)與分析的團(tuán)隊(duì)。經(jīng)過多年的發(fā)展沉淀，公司建立起了4D-DIA/LFQ/PRM、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修飾蛋白組等蛋白組學(xué)技術(shù)平臺(tái)。
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End本文系鹿明生物原創(chuàng)
