眾所周知，CRISPR/Cas技術(shù)相較于其他編輯手段有很大的優(yōu)勢，但是在實(shí)際應(yīng)用CRISPR/Cas技術(shù)進(jìn)行基因敲除時(shí)，難免會遇到許多問題，畢竟CRISPR/Cas技術(shù)從被發(fā)現(xiàn)到被使用也不過寥寥數(shù)年，實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn)較為不足，這不僅導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)試錯(cuò)成本增加，甚至?xí)绊懣蒲腥藛T的積極性。

而減少試錯(cuò)成本最重要的手段就是預(yù)先設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案并進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)，但是一個(gè)好的實(shí)驗(yàn)方案真的這么容易設(shè)計(jì)嗎？僅僅gRNA的序列設(shè)計(jì)這一步就要考慮各種問題，包括如何才能覆蓋更多的轉(zhuǎn)錄本，如何盡量避免截短蛋白的表達(dá)，要同時(shí)使用幾個(gè)gRNA等等，甚至基因測序結(jié)果已經(jīng)明確地表明已經(jīng)完全敲除了，但WB的結(jié)果卻讓人仿佛在看一場世紀(jì)靈異事件大賞……

因此一個(gè)便捷又智能的CRISPR基因編輯方案設(shè)計(jì)工具就十分重要了，但且不說這個(gè)方案設(shè)計(jì)系統(tǒng)是否使用便捷，最基本的是，我們要如何確保這個(gè)系統(tǒng)設(shè)計(jì)出來的方案可行性足夠高呢？

目前國內(nèi)只有一個(gè)由源井生物自主研發(fā)的免費(fèi)CRISPR基因編輯系統(tǒng)——紅棉CRISPR基因編輯系統(tǒng)，那么就來看看源井生物的專家團(tuán)隊(duì)是如何解決這個(gè)問題的？

除了結(jié)合了兩大數(shù)據(jù)庫（Ensemble、NCBI數(shù)據(jù)庫）的龐大數(shù)據(jù)，他們還加入了5000例基因成功敲除的獨(dú)家真實(shí)數(shù)據(jù)，并進(jìn)一步結(jié)合生物信息技術(shù)對這些大數(shù)據(jù)進(jìn)行多維度的全方面分析，綜合計(jì)算了所有轉(zhuǎn)錄本、外顯子、編碼區(qū)的位置、大小等參數(shù)，最終綜合得出最佳gRNA敲除區(qū)域，當(dāng)然方案中還有更多能供你評估敲除風(fēng)險(xiǎn)的參數(shù)。

除了保證紅棉系統(tǒng)所設(shè)計(jì)的方案的可行性，源井生物的專業(yè)團(tuán)隊(duì)也在不斷優(yōu)化-紅棉系統(tǒng)的使用感，目前紅棉系統(tǒng)可智能設(shè)計(jì)涵蓋10大研究物種的基因敲除方案，只需輸入基因名/基因ID就可得到3套優(yōu)質(zhì)的gRNA基因敲除方案，包括移碼敲除、小片段敲除或大片段敲除，能基本滿足你的研究需求，并且沒有復(fù)雜的注冊流程，只需掃碼關(guān)注公眾號即可使用，后續(xù)也可通過掃描二維碼進(jìn)行登錄使用，進(jìn)一步節(jié)約你的寶貴時(shí)間。

當(dāng)然，從紅棉系統(tǒng)上線至今，也有許多科研工作者對紅棉系統(tǒng)以及背后的源井生物團(tuán)隊(duì)表示認(rèn)可或者提出寶貴建議，在未來源井生物也會秉持著最初的目標(biāo)不斷前行，讓更多對CRISPR/Cas9技術(shù)感興趣的科研工作者們在使用CRISPR/Cas9技術(shù)時(shí)能更多地感受到這個(gè)被譽(yù)為“基因剪刀”的基因編輯工具的魅力，而不是被信息滯后等多種因素影響對科研的熱情。