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奧維森科技:榮登傳染病學(xué)和微生物學(xué)領(lǐng)域一區(qū)期刊:腸道微生物+大腸桿菌蛋白組學(xué)研究

2023-07-25 14:22 作者:奧維森  | 我要投稿

大腸桿菌是導(dǎo)致全球范圍內(nèi)大量腹瀉病例的一種重要的病原體,生物還原劑替拉帕扎明(TPZ)在臨床上用于治療各種類型的癌癥,也對大腸桿菌菌株具有明顯的抗菌活性。TPZ通過調(diào)節(jié)耐藥性相關(guān)基因的表達(dá),誘導(dǎo)了大腸桿菌耐藥性的逆轉(zhuǎn),這可能在耐藥性細(xì)菌感染的臨床治療中具有輔助作用。近日,北京農(nóng)學(xué)院動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院在傳染病學(xué)和微生物學(xué)領(lǐng)域期刊《International Journal of Antimicrobial Agents》(IF= 10.8,JCR Q1)上發(fā)表了題為《New insights into the antimicrobial action and protective therapeutic effect of tirapazamine towards Escherichia coli-infected mice》的研究成果,旨在評估TPZ對大腸桿菌感染小鼠的保護(hù)性治療作用,并深入了解其抗菌作用機(jī)制。


奧維森科技在研究中提供了腸道微生物組學(xué)和大腸桿菌蛋白質(zhì)組學(xué)測序及分析服務(wù),下面就讓小編帶大家一起來看看這篇文章吧!


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替拉帕扎明對大腸桿菌感染小鼠的抗菌作用和保護(hù)性治療作用的新見解



合作單位

北京農(nóng)學(xué)院



研究背景

大腸桿菌是人類和動物常見的腸道微生物,也是第五常見的主要食源性病原體,可導(dǎo)致嚴(yán)重的腸道疾病??股氐倪^度使用和濫用加速了抗生素耐藥性細(xì)菌的傳播,多重耐藥(MDR)菌的增加已成為全球公共衛(wèi)生的主要威脅,且耐藥(AMR)菌株可以在環(huán)境、動物和人中廣泛傳播,從而對感染疾病控制構(gòu)成挑戰(zhàn)。替拉帕扎明(TPZ)是一種雜環(huán)二氮氧化物,是一種生物還原劑,可通過誘導(dǎo)DNA和染色體斷裂導(dǎo)致細(xì)胞凋亡,同時也具有殺菌作用,且在厭氧條件下更具活性。此外,也有研究報導(dǎo)過TPZ對MDR菌株的抗菌活性。


本研究旨在通過體外抗菌活性、耐藥性逆轉(zhuǎn)、生物膜形成和蛋白質(zhì)組學(xué)分析來深入了解TPZ的抗菌作用機(jī)制,并通過觀察臨床癥狀、組織細(xì)菌負(fù)荷、組織病理學(xué)特征和腸道微生物群變化來評估TPZ對大腸桿菌感染小鼠的保護(hù)性治療作用,了解TPZ作為一種潛在的單一或聯(lián)合抗菌劑治療病原體感染的有效性和安全性。



樣本采集與處理

將50 mL大腸桿菌懸浮液用TPZ的一半最小抑菌濃度(MIC)激發(fā)6小時作為處理組(ET),使用另外50 mL的大腸桿菌懸浮液作為未處理的對照組(EC)。采集ET和EC細(xì)胞并在-80 °C下儲存,在timsTOF Pro質(zhì)譜儀上進(jìn)行4D Label-Free檢測用于蛋白質(zhì)組分析。


5周齡雌性BALB/c小鼠,被適應(yīng)性喂養(yǎng)一周,并被隨機(jī)分為三組:對照組(C)、大腸桿菌感染組(E)和大腸桿菌感染+TPZ治療組(ET)。大腸桿菌激發(fā)試驗通過腹膜內(nèi)注射5.0×106CFU/小鼠的劑量進(jìn)行,感染當(dāng)天被視為第0天。感染后3天,治療組小鼠通過腹膜內(nèi)注射25 mg/kg劑量的TPZ,每天兩次,持續(xù)7天,大腸桿菌感染組注射不含TPZ的溶劑。在感染后11天從每組收集新鮮的小鼠糞便用于擴(kuò)增子測序以分析糞便微生物群。



測序區(qū)域和平臺

微生物組?16S rRNA V3-V4區(qū);Illumina Miseq PE300。

蛋白質(zhì)組?4D Label-Free;timsTOF Pro質(zhì)譜儀



研究成果
1、TPZ對大腸桿菌的體外抗菌活性和細(xì)胞活力

測定了TPZ對大腸桿菌E和E-10菌株的MIC均為25 μM,在50 μM和更高濃度的TPZ下,兩種大腸桿菌菌株的生長都被完全抑制。TPZ對兩株大腸桿菌的最小殺菌濃度(MBC)均為50μM,表明TPZ對大腸桿菌具有較強(qiáng)的抗菌活性。


HD11細(xì)胞的TPZ的半數(shù)毒性濃度(CC50)值為37.97 μM,Vero細(xì)胞的TPZ的CC50值為593.5 μM,表明TPZ在較高濃度下對細(xì)胞具有潛在的毒性。TPZ對Vero細(xì)胞的CC50值是MBC值的10倍,說明制定合理的藥物劑量和程序可以有效防止復(fù)合物對細(xì)胞活力的損害。


2、TPZ逆轉(zhuǎn)大腸桿菌耐藥性表型

兩種大腸桿菌菌株都是MDR菌,經(jīng)TPZ處理后各類耐藥性已從中度敏感降至敏感,TPZ影響大腸桿菌對β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類、喹諾酮類、多肽類、酰胺醇類和四環(huán)素類抗生素的耐藥性。TPZ對大腸桿菌具有強(qiáng)效的抗生物膜能力,并可能解釋耐藥性表型的逆轉(zhuǎn)。


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圖1 TPZ對大腸桿菌的體外抗菌活性和細(xì)胞活力



3、TPZ誘導(dǎo)的差異表達(dá)蛋白的蛋白質(zhì)組學(xué)分析

使用4D Label-Free蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究了TPZ對大腸桿菌中蛋白質(zhì)表達(dá)的影響,在EC和ET組中鑒定出2218種蛋白質(zhì),分別有53和47種蛋白質(zhì)上調(diào)或下調(diào)。


4、蛋白質(zhì)GO和代謝通路分析

TPZ處理后,大腸桿菌色氨酸代謝、過氧化氫酶、牛磺酸與下丘腦代謝相關(guān)蛋白顯著上調(diào)。色氨酸在腸道免疫耐受和維持腸道微生物組平衡方面發(fā)揮著重要作用。此外,DNA損傷、修復(fù)和重組相關(guān)蛋白RecA、Holliday連接ATP依賴性DNA解旋酶RuvB、tRNA假尿苷合成B、DNA回旋酶B亞基和原體蛋白I也顯著上調(diào)。保護(hù)細(xì)菌免受活性氧自由基(ROS)引起的氧化應(yīng)激的蛋白質(zhì)顯著下調(diào),導(dǎo)致細(xì)胞代謝中氧化還原穩(wěn)態(tài)破壞,主要涉及免疫系統(tǒng)中的過氧化氫酶、抗氧化劑、雙功能過氧化氫酶和硫氧化還原蛋白/谷胱甘肽過氧化物酶BtuE。


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圖2 TPZ處理大腸桿菌的定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析



5、TPZ在大腸桿菌感染的小鼠模型中顯示出潛在的療效

與未治療組相比,TPZ治療顯著減輕了大腸桿菌感染誘導(dǎo)的體重減輕、死亡率、結(jié)腸炎,還提高了小鼠的存活率。TPZ治療后7天,小鼠體內(nèi)細(xì)菌載量急劇減少,幾乎所有的細(xì)菌都被從體內(nèi)清除。組織學(xué)分析顯示,TPZ治療小鼠腺體結(jié)構(gòu)破壞和炎癥細(xì)胞浸潤顯著減弱。結(jié)果表明,在小鼠感染模型中TPZ有效地改善了感染癥狀、結(jié)腸炎和細(xì)菌定植。


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圖3 TPZ對大腸桿菌感染的BALB/c小鼠有明顯的治療作用



6、TPZ治療誘導(dǎo)小鼠腸道微生物群變化

與C組比較,E組和ET組的腸道微生物群多樣性呈下降趨勢。主成分分析顯示,ET組的微生物群落組成與E組和C組截然不同,表明TPZ處理在一定程度上影響了小鼠的微生物群落構(gòu)成。γ-變形菌、放線菌和彎曲桿菌是糞便微生物群中的主要門。


LEfSe分析顯示E組中Helicobacter、Helicobacterbilis和Lachnospiraceae含量豐富,ET組中Turicimonasmuris,bacterium_Ellin5012和Lactobacillus?acidophilus豐度增加。KEGG分析顯示,C、E和ET組的差異表達(dá)蛋白在ET中顯著富集。大腸桿菌感染和TPZ治療強(qiáng)烈影響了小鼠的腸道微生物組結(jié)構(gòu),特別是關(guān)于Bacterium_Ellin5012,Bacterium,Bifidobacteriumsp,Staphylococcusequorum,uncultured Corynebacterium和Lachnospiraceae。


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圖4 大腸桿菌感染和TPZ處理的BALB/c小鼠的糞便微生物多樣性分析



研究結(jié)論

1、TPZ在體外和體內(nèi)均能有效抑制大腸桿菌的增殖。

2、TPZ的耐藥性逆轉(zhuǎn)活性是通過調(diào)節(jié)與大腸桿菌耐藥性和生物膜形成相關(guān)的基因來實現(xiàn)的。

3、蛋白質(zhì)組學(xué)分析表明,TPZ對大腸桿菌的抗菌活性可能是通過破壞細(xì)菌DNA來實現(xiàn)的。

4、TPZ提高了大腸桿菌感染小鼠的存活率,TPZ對小鼠的保護(hù)性治療作用也可能與腸道微生物群的調(diào)節(jié)有關(guān)。



參考文獻(xiàn)

Zhouhui W, Yu W, Lei L, etl. New insights into the antimicrobial action and protective therapeutic effect of tirapazamine towards Escherichia coli-infected mice[J]. International Journal of Antimicrobial Agents,2023.



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