回顧2021 年，是歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部碩果累累的一年，助力合作客戶(hù)發(fā)表 33 篇單細(xì)胞文章，平均IF達(dá)8.408。今天，小編帶著大家一起回顧歐易單細(xì)胞的2021吧~

NO. 1

基于成像質(zhì)譜技術(shù)的肝癌微環(huán)境拓?fù)浞治鼋沂玖瞬煌瑐€(gè)體發(fā)育的巨噬細(xì)胞對(duì)細(xì)胞鄰域的反向調(diào)節(jié)

Topological analysis of hepatocellular carcinoma tumour microenvironment based on imaging mass cytometry reveals cellular neighbourhood regulated reversely by macrophages with different ontogeny

發(fā)表期刊：Gut

影響因子：23.051

DOI:?10.1136/gutjnl-2021-324339

文章概述：肝細(xì)胞癌 (HCC) 腫瘤微環(huán)境 (TME) 是高度復(fù)雜的，具有組織成各種功能單元、細(xì)胞鄰域 (CN) 的多種細(xì)胞成分。該研究結(jié)果首次揭示了肝細(xì)胞癌腫瘤微環(huán)境的各種拓?fù)涔δ軉卧?，也提供了最大的肝?xì)胞癌病理景觀庫(kù)。這項(xiàng)工作突出了特異性靶向 Kupffer 細(xì)胞而不是阻斷髓樣細(xì)胞整體作為肝細(xì)胞癌治療的新型免疫療法的潛力。

NO. 2

Kdm6b調(diào)節(jié)腸道上皮內(nèi)TCRαβCD8αα淋巴細(xì)胞成熟和細(xì)胞毒性的機(jī)制

The histone demethylase Kdm6b regulates the maturation and cytotoxicity of TCRαβCD8αα intestinal intraepithelial lymphocytes

發(fā)表期刊：Cell Death and Differentiation

影響因子：15.824

DOI:?10.1038/s41418-021-00921-w

文章概述：該研究主要證明了Kdm6b能夠以細(xì)胞內(nèi)作用方式調(diào)控小腸IELs的發(fā)育和功能。作者首先構(gòu)建了T細(xì)胞中條件性敲除Kdm6b的小鼠模型（Kdm6bF/F-CD4Cre），通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和V(D)J測(cè)序發(fā)現(xiàn)Kdm6b的缺失導(dǎo)致IELs中TCRαβ細(xì)胞的比例減少，TCR多樣性降低以及TCR V-J基因重排的差異，發(fā)現(xiàn)Kdm6b在維持在小腸IELs穩(wěn)態(tài)中的關(guān)鍵作用。隨后通過(guò)流式證實(shí)Kdm6b的缺失會(huì)破壞IELs胸腺前體細(xì)胞IELPs的穩(wěn)態(tài)和遷移，促進(jìn)TCRαβCD8αα IELs凋亡，從而導(dǎo)致腸道中TCRαβCD8αα數(shù)量減少。通過(guò)bulk RNA-Seq、ChIP-qPCR和CUT&Tag-seq等表明Kdm6b能夠通過(guò)清除相關(guān)基因增強(qiáng)子和啟動(dòng)子區(qū)域的抑制性H3K27Me3修飾來(lái)促進(jìn)TCRαβCD8αα IELs抗凋亡基因Bcl2及細(xì)胞毒性基因Gzmb和Fasl的表達(dá)，從而促進(jìn)TCRαβCD8αα IELs的成熟，Kdm6b也能夠通過(guò)降低啟動(dòng)子上的H3K27Me3水平調(diào)控腸道歸巢分子CCR9的表達(dá)。

NO. 3?

通過(guò)小鼠反應(yīng)性膠質(zhì)化消除中風(fēng)亞型依賴(lài)性突觸

Stroke subtype-dependent synapse elimination by reactive gliosis in mice

發(fā)表期刊：Nature Communications

影響因子：14.919

DOI:?10.1038/s41467-021-27248-x

文章概述：卒中（stroke）在全世界范圍內(nèi)都是一種高致死高致殘的疾病，嚴(yán)重危害了人類(lèi)的生命健康。本研究主要探索小膠質(zhì)細(xì)胞/巨噬細(xì)胞?(microglia/macrophage) 和星形膠質(zhì)細(xì)胞?(astrocyte) 在缺血性卒中和出血性卒中修復(fù)階段的突觸吞噬情況。利用缺血性腦卒中?(MCAO) 和出血性腦卒中?(ICH) 小鼠模型，作者發(fā)現(xiàn)兩種膠質(zhì)細(xì)胞在缺血性腦卒中?(ischemic stroke) 模型小鼠中介導(dǎo)突觸吞噬，導(dǎo)致突觸丟失影響了疾病預(yù)后；而在出血性腦卒中?(hemorrhagic stroke) 模型小鼠中只有小膠質(zhì)細(xì)胞/巨噬細(xì)胞介導(dǎo)突觸吞噬，星形膠質(zhì)細(xì)胞無(wú)明顯作用。

NO. 4

單細(xì)胞RNA+單細(xì)胞ATAC測(cè)序助力解析小鼠不同器官γ δ T細(xì)胞異質(zhì)性圖譜

Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γ δ T cells

發(fā)表期刊：Science Bulletin

影響因子：11.78

文章概述：γ δ T細(xì)胞具有重要的免疫監(jiān)視功能，其不同亞型在維持組織穩(wěn)態(tài)和局部免疫反應(yīng)中發(fā)揮不同作用，但是γ δ T細(xì)胞的異質(zhì)性尚未完全解析。本文作者對(duì)小鼠胸腺、脾臟和淋巴結(jié)中的γ δ T細(xì)胞開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)開(kāi)放性組學(xué)分析，系統(tǒng)性解析了其異質(zhì)性。本文構(gòu)建了小鼠γ δ T單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜和單細(xì)胞染色質(zhì)開(kāi)放性圖譜，為深入解析γ δ T細(xì)胞異質(zhì)性和亞群調(diào)控機(jī)制提供了寶貴的資源庫(kù)。

NO. 5

急性肺損傷過(guò)程中間充質(zhì)干細(xì)胞介導(dǎo)的募集單核吞噬細(xì)胞的免疫調(diào)節(jié)：高維分析研究

Mesenchymal stem cell-mediated immunomodulation of recruited mononuclear phagocytes during acute lung injury: a high-dimensional analysis study

發(fā)表期刊：Theranostics

影響因子：11.553

DOI:?10.7150/thno.52514

文章概述：急性肺損傷(ALI)招募單核吞噬細(xì)胞在肺損傷和修復(fù)中起關(guān)鍵作用。本研究在脂多糖(LPS)誘導(dǎo)的ALI小鼠模型中研究了募集單核吞噬細(xì)胞的類(lèi)型和異體間充質(zhì)干細(xì)胞(MSCs)的免疫治療作用。

NO. 6

內(nèi)源性 p27 和 Ki67 的可視化揭示了 c-Myc 驅(qū)動(dòng)的代謝開(kāi)關(guān)在促進(jìn)靜止癌細(xì)胞存活中的重要性

Visualization of endogenous p27 and Ki67 reveals the importance of a c-Myc-driven metabolic switch in promoting survival of quiescent cancer cells

發(fā)表期刊：Theranostics

影響因子：11.552

DOI:?10.7150/thno.63763

NO. 7

早期和晚期肺腺癌中單個(gè)腫瘤和免疫細(xì)胞圖譜和動(dòng)態(tài)變化

Landscape and dynamics of single tumor and immune cells in early and advanced-stage lung adenocarcinoma

發(fā)表期刊：Clin. Transl. Med

影響因子：11.494

DOI:?10.1002/ctm2.350

NO. 8

單細(xì)胞圖譜解析人間充質(zhì)干細(xì)胞異質(zhì)性

Single-cell transcriptome atlas of human mesenchymal stem cells exploring cellular heterogeneity

發(fā)表期刊：Clinical and Translational Medicine

影響因子：11.492

DOI：10.1002/ctm2.650

文章概述：作者從11個(gè)健康供體的樣本中獲得約130,000個(gè)細(xì)胞，構(gòu)建了不同組織的MSCs單細(xì)胞圖譜。對(duì)MSCs進(jìn)一步分析研究，發(fā)現(xiàn)組織特異性以及具有保守性的MSCs亞群，ECM在MSCs異質(zhì)性中起到?jīng)Q定作用。此外，ECM相關(guān)的炎癥、衰老、抗原處理和呈遞等功能在組織特異性亞群中也是高度異質(zhì)性的。擬時(shí)序分析進(jìn)一步說(shuō)明MSCs組織內(nèi)以及不同組織間的異質(zhì)性。發(fā)育軌跡的構(gòu)建也說(shuō)明了MSCs組織間和組織內(nèi)的異質(zhì)性。

NO. 9

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組顯示高級(jí)別漿液性卵巢癌的異質(zhì)性

Single-cell transcriptomes reveal heterogeneity of high-grade serous ovarian carcinoma

發(fā)表期刊：Clinical and Translational Medicine

影響因子：11.492

文章概述：高級(jí)別漿液性卵巢癌?(HGSOC)?是最常見(jiàn)的上皮性卵巢癌，對(duì)該疾病的異質(zhì)性和分子基礎(chǔ)仍然不完全了解。作者鑒定出一種具有高增殖和耐藥性潛力的上皮細(xì)胞亞群，進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)證實(shí)了它們?cè)诼殉舶┘?xì)胞生長(zhǎng)和遷移中的作用。通過(guò)擬時(shí)序分析，發(fā)現(xiàn)包括翻譯機(jī)制在內(nèi)的多種信號(hào)通路的失調(diào)與卵巢癌轉(zhuǎn)移有關(guān)。此外，SCENIC分析揭示了基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的相互作用，并通過(guò)JUN/AP-1抑制劑T-5224驗(yàn)證，表明JUN可作為潛在的卵巢癌治療靶點(diǎn)。

NO. 10

心臟免疫細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析揭示Rel驅(qū)動(dòng)的CD72陽(yáng)性巨噬細(xì)胞誘導(dǎo)心肌細(xì)胞損傷

Single-cell transcriptomic analyses of cardiac immune cells reveal that Rel-driven CD72-positive macrophages induce cardiomyocyte injury

發(fā)表期刊：Cardiovasc Res

影響因子：10.784

DOI：10.1093/cvr/cvab193

NO.11

單細(xì)胞測(cè)序揭示2型糖尿病小鼠視網(wǎng)膜細(xì)胞的新轉(zhuǎn)錄圖譜和異質(zhì)性

Pathogenesis study based on high throughput single-cell sequencing analysis reveals novel transcriptional landscape and heterogeneity of retinal cells in type 2 diabetic mice

發(fā)表期刊：Diabetes

影響因子：9.463

DOI:?10.2337/db20-0839

NO. 12

促炎性和增殖性小膠質(zhì)細(xì)胞驅(qū)動(dòng)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的進(jìn)展

Pro-inflammatory and proliferative microglia drive progression of glioblastoma

發(fā)表期刊：Cell Reports

影響因子：9.423

DOI:?10.1016/j.celrep.2021.109718

NO. 13

單細(xì)胞測(cè)序助力解析氣道goblet cell 化新機(jī)制

LKB1 dificiency upregulates RELM-α to drive airway goblet cell metaplasia

發(fā)表期刊：Cell Mol Life Sci

影響因子：9.261

DOI:?10.1007/s00018-021-04044-w

NO. 14

5mC調(diào)控子分子亞型系統(tǒng)，描繪膀胱癌微環(huán)境特征并指導(dǎo)精準(zhǔn)醫(yī)療

5mC regulator-mediated molecular subtypes depict the hallmarks of the tumor microenvironment and guide precision medicine in bladder cancer

發(fā)表期刊：BMC Medicinee

影響因子：8.775

DOI:?10.1186/s12916-021-02163-6

NO. 15

單細(xì)胞RNA測(cè)序揭示阿爾茨海默病的B細(xì)胞相關(guān)分子生物標(biāo)記物

Single-cell RNA sequencing reveals B cell–related molecular biomarkers for Alzheimer’s disease

發(fā)表期刊：Exp Mol Med

影響因子：8.718

DOI:?10.1038/s12276-021-00714-8

NO. 16

單細(xì)胞測(cè)序助力解析食管鱗狀細(xì)胞癌分子圖譜特征

Dissecting the single-cell transcriptome network underlying esophagus non-malignant tissues and esophageal squamous cell carcinoma

發(fā)表期刊：EbioMedicine

影響因子：8.142

DOI:?10.1016/j.ebiom.2021.103459

NO. 17

單細(xì)胞測(cè)序助力解析新輔助化療手段——紫杉醇+順鉑與單純手術(shù)治療在食管鱗狀細(xì)胞癌中的腫瘤微環(huán)境差異

Dissecting the single-cell transcriptome network in patients with esophageal squamous cell carcinoma receiving operative paclitaxel plus platinum chemotherapy

發(fā)表期刊：Oncogenesis

影響因子：7.48

DOI:?10.1038/s41389-021-00359-2

NO. 18

子宮腺肌癥在位內(nèi)膜和異位病變的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

Single-cell transcriptomic analysis of eutopic endometrium and ectopic lesions of adenomyosis

發(fā)表期刊：Cell Biosci

影響因子：7.134

DOI:?10.1186/s13578-021-00562-z

NO. 19

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序解析子宮內(nèi)膜異位癥成纖維細(xì)胞命運(yùn)與免疫細(xì)胞異質(zhì)性

Single-cell transcriptomic analysis of endometriosis provides insights into fibroblast fates and immune cell heterogeneity

發(fā)表期刊：Cell Biosci

影響因子：7.134

DOI:?10.1186/s13578-021-00637-x

NO. 20

從鼻腔到法氏囊，IBDV 感染雞法氏囊的單細(xì)胞測(cè)序機(jī)制研究

From nasal to basal: single-cell sequencing of the bursa of Fabricius highlights the IBDV infection mechanism in chickens

發(fā)表期刊：Cell Biosci

影響因子：7.134

DOI:?10.1186/s13578-021-00728-9

NO. 21

單細(xì)胞助力解析小鼠膀胱尿路上皮細(xì)胞圖譜和分化特征

Single-cell transcriptomes of mouse bladder urothelium uncover novel cell type markers and urothelial differentiation characteristics

發(fā)表期刊：Cell Prolif

影響因子：6.832

DOI:?10.1111/cpr.13007

NO. 22

復(fù)發(fā)性難治性多發(fā)性骨髓瘤的病例研究通過(guò)將連續(xù)基因組學(xué)與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組相結(jié)合，揭示了漿細(xì)胞的克隆進(jìn)化和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

A case study of relapsed and refractory multiple myeloma reveals clonal evolution and gene regulatory networks of plasma cells via combining consecutive genomics with single-cell transcriptomes

發(fā)表期刊：Frontiers Cell and Developmental Biology

影響因子：6.684

NO. 23

膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示了獨(dú)特的腫瘤微環(huán)境和針對(duì)腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的潛在免疫治療靶點(diǎn)

Single-Cell Transcriptomics of Glioblastoma Reveals a Unique Tumor Microenvironment and Potential Immunotherapeutic Target Against Tumor-Associated Macrophage

發(fā)表期刊：Frontiers in Oncology

影響因子：6.244

DOI:?10.3389/fonc.2021.710695

NO. 24

單細(xì)胞RNA測(cè)序顯示子宮內(nèi)膜癌免疫細(xì)胞和子宮內(nèi)膜上皮細(xì)胞表型

Phenotyping of immune and endometrial epithelial cells in endometrial carcinomas revealed by single-cell RNA sequencing

發(fā)表期刊：Aging (Albany NY)

影響因子：5.683

DOI:?10.18632/aging.202288

NO. 25

妊娠糖尿病患者胎盤(pán)的單細(xì)胞水平轉(zhuǎn)錄組分析

Transcriptomic Profiling of Human Placenta in Gestational Diabetes Mellitus at the Single-Cell Level

發(fā)表期刊：Front Endocrinol

影響因子：5.55

DOI:?10.3389/fendo.2021.679582

NO. 26

綜合肝臟單細(xì)胞RNA測(cè)序和非靶向代謝組學(xué)解釋清肺排毒湯對(duì)冠狀病毒誘導(dǎo)的肺炎小鼠的免疫和代謝調(diào)節(jié)

Integrated hepatic single-cell RNA sequencing and untargeted metabolomics revealed the immune and metabolic modulation of Qing-Fei-Pai-Du decoction in coronavirusinduced pneumonia mice

發(fā)表期刊：Phytomedicine

影響因子：5.34

DOI:?10.1016/j.phymed.2021.153922

NO. 27

參與角膜穩(wěn)態(tài)維持和血管豁免的人角膜異質(zhì)性分子特征

Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege

發(fā)表期刊：Ocul Surf

影響因子：5.032

DOI:?10.1016/j.jtos.2021.04.010

NO. 28

再生障礙性貧血患者和健康供者骨髓細(xì)胞的單細(xì)胞RNA序列

Single-cell RNA-seq of bone marrow cells from aplastic anemia patient and healthy donor

發(fā)表期刊：Frontiers in Genetics

影響因子：4.59

DOI：10.3389/fgene.2021.745483

NO. 29

基于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)的老年和年輕小鼠胰島β細(xì)胞生理差異研究

Islet β-cells physiological difference study of old and young mice based on single-cell transcriptomics

發(fā)表期刊：J Diabetes Investig.

影響因子：4.232

DOI:?10.1111/jdi.13579

NO. 30

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分辨率下的 Blinatumomab 誘導(dǎo) T 細(xì)胞活化

Blinatumomab-induced T cell activation at single cell transcriptome resolution

發(fā)表期刊：BMC Genomics

影響因子：3.694

DOI:?10.1186/s12864-021-07435-2

NO.31

小鼠左心室的單細(xì)胞 RNA 測(cè)序揭示細(xì)胞多樣性和細(xì)胞通訊

Single-Cell RNA Sequencing of Mouse Left Ventricle Reveals Cellular Diversity and Intercommunication

發(fā)表期刊：Physiol Genomics

影響因子：3.107

DOI:?10.1152/physiolgenomics.00016.2021

NO. 32

卵巢卵泡顆粒細(xì)胞的 scRNA-seq 揭示了不同繁殖力山羊的不同表達(dá)模式

scRNA-seq of ovarian follicle granulosa cells from different fertility goats reveals distinct expression patterns

發(fā)表期刊：Reprod Domest Anim

影響因子：2.002

DOI:?10.1111/rda.13920

NO. 33

基于單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)的通瀉安腸湯治療腹瀉型腸易激綜合征臨床機(jī)制研究

Study on the clinical mechanism of Tong-Xie-An-Chang Decoction in the treatment of diarrheal irritable bowel syndrome based on single-cell sequencing technology

發(fā)表期刊：Medicine (Baltimore)

影響因子：1.881

DOI:?10.1097/MD.0000000000023868

歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部

歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部建立于2018年，已成為歐易生物的核心部門(mén)之一。先后引入多套10x Genomics和 BD RhapsodyTM，流式細(xì)胞儀等主流的高通量單細(xì)胞分選平臺(tái)，已獲得10x Genomics公司授權(quán)的單細(xì)胞基因表達(dá)和空間轉(zhuǎn)錄組雙平臺(tái)服務(wù)提供商認(rèn)證，并與北京、廣州等地協(xié)同科研院所分別成立聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室。

團(tuán)隊(duì)成員50余人，博士學(xué)歷5人，碩士及以上學(xué)歷人員比例達(dá)40%以上；擁有300m獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室，可完成樣本處理、細(xì)胞分選、文庫(kù)構(gòu)建和空間轉(zhuǎn)錄等的實(shí)驗(yàn)。

單細(xì)胞事業(yè)部成立至今，已完成1500+個(gè)項(xiàng)目、8000+例樣本的單細(xì)胞解離與測(cè)序，參與或協(xié)助客戶(hù)發(fā)表近50篇高水平文章。歐易生物單細(xì)胞事業(yè)部致力于為廣大科研工作者提供周到、貼心、專(zhuān)業(yè)的技術(shù)服務(wù)，專(zhuān)注于以客戶(hù)的口碑鑄就品牌形象。

2021年，優(yōu)雅落幕

2022年，精彩再續(xù)

2022期待我們攜手并進(jìn)，共創(chuàng)佳績(jī)

Anna? 撰文

本文系歐易生物原創(chuàng)

轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明文本轉(zhuǎn)自歐易生物