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多年繪圖經(jīng)驗(yàn)總結(jié),分子機(jī)制圖繪制的所有技巧,可實(shí)操性強(qiáng)!

2023-06-21 12:30 作者:科研根號三  | 我要投稿

一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的分子機(jī)制圖既能讓審稿人一目了然的知道我們的研究工作,漂亮的圖也能讓整個(gè)標(biāo)書顯得高大上,給評審專家一個(gè)好的印象。

關(guān)于機(jī)制圖的繪制,比較建議用AI(Adobe Illustrator)軟件,當(dāng)然ppt也很好。只是相對來說熟練AI操作以后你會發(fā)現(xiàn)用AI繪圖,可變化的空間會更大、效率也更高!


AI(Adobe Illustrator)的安裝包和AI科研繪圖課程,有需要的可以自行下載,如果對AI繪圖有興趣的同學(xué),這里分享的軟件視頻交教程也可以保存到網(wǎng)盤學(xué)習(xí)!




一、 繪制分子機(jī)制圖?


繪制分子機(jī)制圖的順序是由外(細(xì)胞膜外)及內(nèi)(膜內(nèi)),由上游至下游。可先將信號通路機(jī)制做出來之后,再將MicroRNA或LncRNA對靶基因的作用機(jī)制以及靶基因?qū)ο掠涡盘柾返淖饔脵C(jī)制放在之后做,這樣思路清晰就不容易出錯(cuò),降低返工率。


?AI軟件12類元素的繪制思路?

1)基因結(jié)構(gòu)的放大

繪制思路:基因結(jié)構(gòu)以矩形、直線構(gòu)成、色塊的透明度設(shè)置應(yīng)用為主,繪制比較簡單。左圖是我們常用的一些元素,右圖是根據(jù)素材變形、排列做出來的最終效果圖。

2)外顯子,內(nèi)含子及DNA

繪制思路:外顯子,內(nèi)含子及DNA以矩形、直線、變形應(yīng)用為主,重點(diǎn)在于排列與配色,繪制比較簡單。

3)G蛋白偶聯(lián)受體

繪制思路:G蛋白偶聯(lián)受體以矩形、圓形、內(nèi)發(fā)光、箭頭、路徑查找的應(yīng)用為主。

4)細(xì)胞的內(nèi)吞作用

繪制思路:細(xì)胞的內(nèi)吞作用以矩形、圓形、畫筆、路徑查找器、剪刀的應(yīng)用為主,從2維到3維的演變。元素的排列技巧是要點(diǎn)。

5)RNA

繪制思路:RNA繪制用到的元素以圓形、圓角矩形、橢圓形、多邊形為主,在這些圖形的基礎(chǔ)上,以添加描點(diǎn)、再次變換、吸管工具的應(yīng)用為主,繪制的難點(diǎn)在于添加描點(diǎn)的靈活使用。

6)DNA解鏈

繪制思路:DNA解鏈以制作畫筆、擴(kuò)展外觀、制作陰影的應(yīng)用為主,看著有難度,實(shí)際只要掌握了陰影的應(yīng)用就不難啦。關(guān)于畫筆的制作,可以下載畫筆安裝到AI軟件上,或者是自己繪制模板。

7)濃縮染色質(zhì)環(huán)

繪制思路:濃縮染色質(zhì)環(huán)的繪制以鋼筆工具、鉛筆工具的弧線繪制以及參考線的應(yīng)用為主。

8)DNA解鏈

繪制思路:DNA解鏈以鋼筆工具、鉛筆工具的弧線繪制以及參考線的應(yīng)用為主,繪制思路跟濃縮染色質(zhì)環(huán)的繪制有點(diǎn)相似。

9)葉綠體

繪制思路:葉綠體以圓角效果、剪貼蒙版、符號工具、雙描邊的應(yīng)用為主,和諧的排序以及高級的配色是重點(diǎn)。

10)DNA解鏈

繪制思路:DNA解鏈以錨點(diǎn)的轉(zhuǎn)化、粗化效果、實(shí)時(shí)上色的應(yīng)用為主,對于細(xì)節(jié)上色的要求較高,同時(shí)漸變色的應(yīng)用、細(xì)節(jié)的處理都是難點(diǎn),繪制難度較難。

11)培養(yǎng)皿

繪制思路:培養(yǎng)皿以形狀生成器工具、符號工具的應(yīng)用為主,整體繪制比較簡單。

12)Transwell 小室和培養(yǎng)板

繪制思路:Transwell 小室和培養(yǎng)板以形狀生成器工具應(yīng)用為主。跟培養(yǎng)皿相比,由于增加了不規(guī)則的形狀,所以多了自由變換工具的應(yīng)用。

?

5個(gè)機(jī)制圖美化案例?

美化案例1

改變了DNA粗糙的畫法,給整張圖框選添加漸變色背景,箭頭整體風(fēng)格一致讓整體更加協(xié)調(diào),文字背景增加立體效果。

美化案例2

改變蛋白組合的畫法,讓其看上去更簡潔美觀,調(diào)整各個(gè)細(xì)胞的立體感,增加背景顏色過渡。

美化案例3

美化不規(guī)則圖形,填充陰影和色彩,讓圖形更加有立體感。

美化案例4

豐富素材顏色,添加陰影,陰影的應(yīng)用讓二維變?nèi)S效果,整體更加立體美觀。


?5個(gè)中標(biāo)案例機(jī)制圖賞析


比美化更重要的,是研究思路的展示。我找了5個(gè)中標(biāo)標(biāo)書的機(jī)制圖優(yōu)秀案例,還整理了幾個(gè)典型錯(cuò)誤的機(jī)制圖案例,大家可以仔細(xì)看看,總結(jié)一下經(jīng)驗(yàn)。


1.LncRNA-OC募集TRIM8促進(jìn)TAK1泛素化介導(dǎo)破骨細(xì)胞分化減弱在強(qiáng)直性脊柱炎病理性成骨中的作用及機(jī)制研究。



2.HLA-A2 抗體通過 Src-鈣信號通路誘發(fā) TRALI 的作用及相關(guān)機(jī)制研究。

▲HLA-A2 抗體可能通過磷酸化 PMN 胞內(nèi) Src,誘導(dǎo) PSGL-1 和 LFA-1 等表面粘附分子的上調(diào)表達(dá)和重分布,增強(qiáng) PMN 對肺血管內(nèi)皮細(xì)胞的粘附特性,同時(shí)通過上調(diào) PMN 炎性因子的分泌及 PMN 胞內(nèi) Src-鈣信號通路增強(qiáng)鈣響應(yīng)信號而促進(jìn) ROS 的產(chǎn)生, 介導(dǎo)肺血管內(nèi)皮細(xì)胞損傷,從而誘發(fā) TRALI 。



3.MicroRNA-30b通過調(diào)節(jié)自噬參與慢性腎臟病血管鈣化的機(jī)制研究。

▲①高磷通過調(diào)控 Wnt/β-catenin 信號通路對細(xì)胞自噬產(chǎn)生作用,從而影響細(xì)胞鈣化過程;同時(shí),Wnt/β-catenin 通路通過 pit1 調(diào)控細(xì)胞鈣化(虛線部分)。

②高磷下調(diào) miR-30b 表達(dá),進(jìn)一步通過 Beclin1 和 Wnt5A 直接和間接地參與對自噬的調(diào)控,產(chǎn)生抑制鈣化的效應(yīng)。



4.LincRNA-p21通過p21及p53通路調(diào)控細(xì)胞增殖與凋亡參與動脈粥樣硬化的分子機(jī)制研究。



5.內(nèi)質(zhì)網(wǎng)介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡和炎癥及破骨細(xì)胞分化信號通路在假體周圍骨溶解骨組織中的作用及機(jī)制研究。

?

5個(gè)問題機(jī)制圖范例分析?


案例1:畫風(fēng)粗獷、顏色搭配不合理,箭頭顏色和分子結(jié)構(gòu)顏色太接近,不好辨認(rèn)。


案例2:lncRNA這個(gè)元素好像被孤立了。



案例3:沒有統(tǒng)一名稱(PKD1和Polycystin是一種蛋白)、作圖粗糙。


案例4:字體較小 、趨勢標(biāo)線不好理解 、沒有重點(diǎn) 、受體多余。


案例5:miRNA 如何調(diào)控基因不明確、受體多余。



機(jī)制圖繪制經(jīng)驗(yàn)總結(jié)?


1. 磷酸化和去磷酸化的過程注意在分子相對應(yīng)的蛋白上加上或去掉磷酸基團(tuán)的圖案;


2. 箭頭如果指的是上下游的關(guān)系,應(yīng)該在箭頭處說明上下游是促進(jìn)還是抑制的關(guān)系;


3. 標(biāo)書中的機(jī)制說明圖也可以從經(jīng)典文章中找一些圖片,略加修改后直接使用,但不建議用文獻(xiàn)中的機(jī)制圖;


4. 基金標(biāo)書的申請一般需要1-2張分子機(jī)制圖;


5. 不要太過追求各類元素的堆砌,繪制原則應(yīng)該是盡量精簡,一目了然。


6. 分子機(jī)制(機(jī)理)圖的繪制中,已經(jīng)有一些軟件插件的存在,但是這些并不能完全滿足SCI中繪圖的需求。


7. 些插件的素材,顏色和形態(tài)和立體感的美化也都存在一些不足,學(xué)會AI繪制操作,美化圖標(biāo)和素材,能夠更優(yōu)化的處理我們所需要的機(jī)制圖。


8 學(xué)習(xí)素材的繪制也能夠更好的掌握AI軟件的基礎(chǔ)繪制工具和流程,以便繪制其它類型的圖片。


9. 機(jī)制圖的配色很重要,關(guān)于色彩搭配技巧,建議直接套用配色網(wǎng)站上的配色方案或者是從頂刊文獻(xiàn)的插圖總結(jié)經(jīng)驗(yàn)。


以上就是關(guān)于分子機(jī)制圖繪制我個(gè)人經(jīng)驗(yàn)的分享!Adobe Illustrator的安裝包和軟件操作教程已經(jīng)打包好,有需要可自行下載!


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