醫(yī)學(xué)高光譜顯微成像與智能分析關(guān)鍵技術(shù)研究及應(yīng)用-萊森光學(xué)
引言
惡性腫瘤(癌癥)一直是危害人類健康最嚴重的疾病,也是造成我國居民死亡的主要原因之一。由于環(huán)境污染、食品安全和不健康的生活方法等因素,惡性腫瘤患者逐年增加,并呈現(xiàn)發(fā)病低齡化的趨勢。
數(shù)字病理圖像的拍攝大多依賴于Red-Green-Blue(RGB)彩色相機。然而,傳統(tǒng)RGB圖像因缺少結(jié)構(gòu)、分子和光譜等關(guān)于生物細胞組織的多維度、多模態(tài)信息,已逐漸觸及智能病理診斷的短板,使得研究和開發(fā)人員需要花費大量時間開發(fā)復(fù)雜的圖像處理分析算法,以此滿足對數(shù)字病理圖像高精準分析的需求。近年來,人們開始探索將高光譜技術(shù)應(yīng)用于醫(yī)學(xué)顯微成像分析領(lǐng)域,通過獲取豐富的信息緩解分析算法復(fù)雜、難以部署等問題。高光譜技術(shù)最初應(yīng)用于遙感領(lǐng)域,相比于RGB彩色圖像,高光譜成像技術(shù)通過納米級別的成像光譜儀,可獲得拍攝目標的上百個波段圖像,是一種將二維空間成像和光譜技術(shù)有機結(jié)合的前沿技術(shù)。因為其包括了豐富的空間信息、輻射信息與光譜信息,高光譜機器視覺技術(shù)隨后在眾多領(lǐng)域展示出了巨大的研究應(yīng)用價值。

高光譜顯微圖像分析處理方法
病理切片圖像可以被分為細胞學(xué)圖像和組織學(xué)圖像,因為細胞和組織病理圖像是兩個層次的形態(tài)學(xué)特征。細胞學(xué)圖像包含細胞本身的信息,組織病理學(xué)圖像含有更復(fù)雜的空間和不同成分的相互關(guān)系等信息,因此二者對處理分析算法有不同的要求。

細胞學(xué)圖像檢測與分割
只有在正常檢測和分割細胞的基礎(chǔ)上,結(jié)合病理學(xué)圖像信息才能做出正確的診斷。相較于基于傳統(tǒng)彩色圖像的細胞檢測與分割只能對空間位置關(guān)系進行建模分析,高光譜病理圖像的細胞檢測分割可以充分利用光譜信息,因此大部分細胞檢測分割的任務(wù)可以轉(zhuǎn)化為對每個像素的分類任務(wù),如圖5所示。參見的方法包括支持向量機(SupportVectorMachine,SVM)、光譜角度匹配(SpectralAngleMapping,SAM)、k-均值算法(k-means)、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(NeuralNetwork,NN)等。此外,結(jié)合圖像空間信息,如細胞邊界等,可進一步提高細胞分割效果。

細胞學(xué)病理圖像分割中輸入的光譜信息與分割結(jié)果
組織學(xué)圖像分類與分級
組織區(qū)域病理分類與分級是病理切片分析中最重要的任務(wù)之一,盡管SVM、SAM等分類算法也同樣能適用于該任務(wù),但組織區(qū)域圖像通常包括了大量正常細胞與癌變細胞,只使用光譜信息難以達到精準的分類與分級效果。研究人員更傾向于采用能提取空間-光譜聯(lián)合特征的算法實現(xiàn)顯微高光譜圖像的分類。近年來,隨著深度學(xué)習的發(fā)展,3D卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)可直接對輸入的組織學(xué)高光譜圖像進行特征提取,隨后將提取到的高維抽象特征映射到可區(qū)分類別空間,如圖6所示。此類方法在一系列任務(wù)上取得了優(yōu)異的結(jié)果。例如肺癌、膽管癌組織病理圖像的分類與分級。

基于3D卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的組織學(xué)病理圖像分類
高光譜顯微圖像在疾病診斷中的研究與應(yīng)用進展
病理圖像分析是臨床疾病診斷的“金標準”,結(jié)合高光譜病理數(shù)字化圖像,可提高 醫(yī)師對病變組織器官的深層次分析的效率和準確率,在疾病診斷上具有重大的應(yīng)用潛力。

醫(yī)學(xué)高光譜技術(shù)從21世紀初開始發(fā)展,美國德州大學(xué)在2002年基于高光譜成像的細胞遺傳研究計劃中,研制了高光譜顯微系統(tǒng)用于細胞學(xué)和組織學(xué)研究。Balas等通過快照式光譜成像系統(tǒng)對宮頸口病變區(qū)域進行成像研究,有效地提高了宮頸腫瘤性病變和非腫瘤性病變組織的分類效果。Siddiqi等采集了宮頸病理組織切片的顯微高光譜數(shù)據(jù),對20個惡性腫瘤的組織分類靈敏度達到了98.5%。美國埃默里大學(xué)Fei教授構(gòu)建了基于LCTF高光譜成像儀器(光譜范圍500~950nm)觀察前列腺癌變組織與正常組織,通過支持向量機(SupportVectorMachine,SVM)分類器實現(xiàn)了癌變組織92.8%靈敏性與96.9%特異性的分類效果。針對乳腺癌癥檢測,Pogue等通過核估計方法對癌變組織的高光譜圖像進行分類,準確率達98%。Laura等在乳腺癌高光譜圖像上驗證了多種分類算法,并最后取得了79%的準確率。Silas等評估了使用點掃描高光譜成像儀測量了結(jié)腸腺癌的熒光激發(fā)光譜變化。結(jié)果表明,高光譜成像可成為區(qū)分結(jié)腸腺癌細胞和周圍正常結(jié)腸黏膜細胞的一種方法。Mauro設(shè)計基于微電子機械系統(tǒng)的數(shù)字微鏡高光譜成像系統(tǒng),用于觀察結(jié)腸腺正常和癌變黏膜之間的光譜差異,能夠顯示97.1%的分類準確率。暨南大學(xué)Zhu等采用液晶可調(diào)諧濾波器對胃組織切片的光譜信息進行分析,對癌變組織分類準確率達95%。Kiyotoki等對16組胃癌的腫瘤組織區(qū)域和正常區(qū)域進行了成像分析。
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