多組學(xué)聯(lián)合新品——復(fù)刻高分文章思路,對(duì)數(shù)據(jù)簡單堆砌說再見
大部分生理過程是由許多復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)和相互依賴的途徑共同推進(jìn),幫助生物體進(jìn)行正常的生長發(fā)育、脅迫應(yīng)激等過程。這個(gè)復(fù)雜的系統(tǒng)并不是多條獨(dú)立的線性途徑的簡單加和,而是涉及到大量的基因表達(dá)、蛋白質(zhì)功能執(zhí)行和代謝水平的協(xié)同改變。
針對(duì)越來越多的多組學(xué)聯(lián)合研究及分析需求,近期中科新生命全新推出了一款“轉(zhuǎn)錄蛋白代謝三組學(xué)聯(lián)合分析”產(chǎn)品——從轉(zhuǎn)錄、蛋白到代謝,打通表型與分子機(jī)制間的關(guān)系,梳理數(shù)據(jù)邏輯,有機(jī)整合分析。復(fù)刻高分文章思路,對(duì)數(shù)據(jù)簡單堆砌說再見。相比于以往的生信分析產(chǎn)品,這款產(chǎn)品“高分文章復(fù)刻”的特色到底體現(xiàn)在哪呢?為了回答這個(gè)問題,我們首先對(duì)近期一些高分文章進(jìn)行一次盤點(diǎn)。
Nature Plants
Multi-omics reveals mechanisms of total resistance to extreme illumination of a desert alga
發(fā)表時(shí)間:2020年
主要結(jié)果:


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Nat Plants | 轉(zhuǎn)錄-蛋白-代謝多組學(xué)揭示沙漠藻類對(duì)極端光照的抗性機(jī)制
Nature Plants
Maize multi-omics reveal roles for autophagic recycling in proteome remodelling and lipid turnover
發(fā)表時(shí)間:2018年
主要結(jié)果:


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【多組學(xué)】Nature Plants:玉米瘋起來居然連自己都吃!
The Plant Cell
Autophagy Plays Prominent Roles in Amino Acid, Nucleotide, and Carbohydrate Metabolism During Fixed-carbon Starvation in Maize
發(fā)表時(shí)間:2020年
主要結(jié)果:


解讀詳情:
PLANT CELL:轉(zhuǎn)錄蛋白代謝多組學(xué)聯(lián)合探索自噬對(duì)玉米碳饑餓脅迫的調(diào)控機(jī)制
Plant Physiology
Multi-omics Analysis Reveals Sequential Roles for ABA during Seed Maturation
發(fā)表時(shí)間:2019年
主要結(jié)果:

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熟悉的植物激素,不一樣的分析策略!
通過盤點(diǎn)以上多篇植物生理方向的高分文獻(xiàn),我們不難發(fā)現(xiàn)它們都有著非常類似的研究模式——
(1)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)——首先選取一種特定的實(shí)驗(yàn)材料或應(yīng)激處理方式
(2)表型觀察——比較實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)分組下生理表型的響應(yīng)和變化
(3)代謝組分析——對(duì)生理表型進(jìn)行代謝物分子層面的描述和解釋
(4)轉(zhuǎn)錄組+蛋白質(zhì)組分析——從基因表達(dá)層面描述發(fā)生的應(yīng)激調(diào)控
(5)整合分析——利用代謝組組具象化表型變化,利用基因表達(dá)解釋表型變化背后的深層機(jī)制,最終闡述特定生理或應(yīng)激條件下的整體生物系統(tǒng)變化。
在總結(jié)了這些高水平研究思路后,我們的報(bào)告分析邏輯也隨之產(chǎn)生了:

