浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院王非凡團(tuán)隊(duì)揭示circXRN2抑制組蛋白乳?;?qū)動(dòng)的腫瘤進(jìn)展
膀胱癌是全球最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,預(yù)后較差,在中國(guó)泌尿系統(tǒng)中也較為常見(jiàn)。有研究表明,環(huán)狀RNA通過(guò)作為miRNA海綿參與膀胱癌的進(jìn)展,但是環(huán)狀RNA的潛在作用和分子機(jī)制有待進(jìn)一步的探索和研究。已有文獻(xiàn)表明Hippo通路在人類癌癥中的異常狀態(tài),促進(jìn)腫瘤發(fā)生、轉(zhuǎn)移進(jìn)展和代謝轉(zhuǎn)移。那么在膀胱癌發(fā)展過(guò)程中,環(huán)狀RNA是否與Hippo通路有關(guān)呢?
2023年9月10日,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院泌尿外科王非凡團(tuán)隊(duì)在Molecular Cancer(IF=37.3)發(fā)表文章“CircXRN2 suppresses tumor progression driven by histone lactylation through activating the Hippo pathway in human bladder cancer”。本研究發(fā)現(xiàn)circXRN2通過(guò)穩(wěn)定LATS1激活Hippo通路,進(jìn)而抑制人類膀胱癌中H3K18乳酸化驅(qū)動(dòng)的腫瘤進(jìn)展。研究結(jié)果提供了一種環(huán)狀RNA參與膀胱癌發(fā)生的分子機(jī)制,并拓展了我們對(duì)膀胱癌中Hippo通路和組蛋白乳酸化的理解。

LATS1在膀胱癌中表達(dá)下調(diào),并與circXRN2相互作用
LATS1是Hippo信號(hào)通路中一個(gè)重要的促進(jìn)分子,在多種惡性腫瘤中發(fā)揮重要作用。組織芯片和臨床樣本顯示,與鄰近正常組織相比,膀胱癌組織中的LATS1異常下調(diào)。RIP和高通量測(cè)序等方法發(fā)現(xiàn)circXRN2(hsa_circ_0001134)對(duì)LATS1蛋白的結(jié)合效率和親和力最高。通過(guò)qRT-PCR也證實(shí)了在臨床腫瘤組織中circXRN2的失調(diào)。另外,circXRN2在腫瘤細(xì)胞系中的表達(dá)水平在一定程度上與Hippo通路關(guān)鍵分子TAZ和YAP的激活相關(guān)。綜上所述,circXRN2可能參與了LATS1和Hippo信號(hào)通路的調(diào)節(jié)。

CircXRN2在體內(nèi)外均能抑制膀胱癌細(xì)胞的增殖和遷移
在體外實(shí)驗(yàn)中,CCK8實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示了circXRN2抑制膀胱癌細(xì)胞活力,細(xì)胞集落形成實(shí)驗(yàn)也表現(xiàn)出相同的趨勢(shì)。此外,過(guò)表達(dá)circXRN2也會(huì)引發(fā)細(xì)胞凋亡,并降低了細(xì)胞的遷移能力。
在體內(nèi)研究中,作者構(gòu)建了裸鼠皮下異種移植物腫瘤發(fā)生模型和尾靜脈肺轉(zhuǎn)移模型。結(jié)果表明,circXRN2可以降低皮下腫瘤的生長(zhǎng)速率和重量。同樣,circXRN2過(guò)表達(dá)組的轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)數(shù)量遠(yuǎn)低于陰性對(duì)照組。
總的來(lái)說(shuō),circXRN2在體內(nèi)外均能抑制膀胱癌細(xì)胞的增殖和遷移。

CircXRN2可以阻止LATS1被SPOP降解
為了揭示circXRN2和LATS1之間的相互作用,作者構(gòu)建了表達(dá)LATS1不同片段的質(zhì)粒,RIP結(jié)果顯示,LATS1蛋白的片段2與circXRN2相互作用。過(guò)表達(dá)circXRN2在蛋白水平上上調(diào)了LATS1,但不上調(diào)了mRNA水平。推測(cè)circXRN2可能通過(guò)翻譯后修飾調(diào)節(jié)LATS1蛋白水平。為了證實(shí)這一推測(cè),通過(guò)真核蛋白合成抑制劑CHX處理陰性對(duì)照和過(guò)表達(dá)circXRN2的細(xì)胞,顯示circXRN2可以延長(zhǎng)LATS1蛋白的半衰期。蛋白酶體抑制劑bortezomib恢復(fù)了能抗circXRN2的腫瘤細(xì)胞中LATS1蛋白的表達(dá)水平。通過(guò)IP檢測(cè)不同細(xì)胞中LATS1蛋白的泛素化情況。在使用蛋白酶體的抑制劑和去泛素化酶抑制劑的過(guò)表達(dá)circXRN2的細(xì)胞中,LATS1蛋白的泛素化程度較少。綜上所述,circXRN2通過(guò)調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄后泛素化來(lái)調(diào)節(jié)膀胱癌細(xì)胞中的LATS1蛋白水平。
LATS1是散斑型POZ的潛在底物(SPOP,E3泛素連接酶適配器),而SPOP促進(jìn)LATS1 的泛素化和降解。因此,為了驗(yàn)證SPOP參與了人膀胱癌細(xì)胞中LATS1的泛素化和降解,在T24細(xì)胞中進(jìn)行了IP和質(zhì)譜檢測(cè),結(jié)果表明LATS1與SPOP蛋白相互作用,并且SPOP反向調(diào)控LATS1蛋白,且呈劑量依賴性。另外,敲低SPOP也降低了LATS1蛋白的泛素化水平。
大多數(shù)SPOP底物具有SPOP結(jié)合共識(shí)基序F-PS-S/T-S/T(“F”代表非極性,“P”代表極性)。在LATS1蛋白的n端有兩個(gè)推測(cè)的SPOP結(jié)合基序SBC1和SBC2。circXRN2與含有SBC1和SBC2的片段2相互作用。因此作者推測(cè)circXRN2和SPOP可能與LATS1蛋白競(jìng)爭(zhēng)性地相互作用,以調(diào)節(jié)其降解。
為了驗(yàn)證這一點(diǎn),作者構(gòu)建了野生型或突變型LATS1質(zhì)粒,將其轉(zhuǎn)染到293T或膀胱癌細(xì)胞中,發(fā)現(xiàn)SBC1突變導(dǎo)致SPOP介導(dǎo)的LATS1降解被顯著阻斷,而SBC2的突變幾乎沒(méi)有效果。同時(shí),co-IP結(jié)果顯示,野生型LATS1可以與SPOP結(jié)合,但SBC1突變型LATS1與SPOP的無(wú)相互作用。最后,作者發(fā)現(xiàn)敲低 circXRN2 促進(jìn)了膀胱癌細(xì)胞中SPOP與LATS1的相互作用。綜上所述,circXRN2可以阻止LATS1的SPOP介導(dǎo)的降解。

CircXRN2是膀胱癌中糖酵解和乳酸產(chǎn)生的抑制因子
Hippo通路能夠調(diào)節(jié)細(xì)胞糖酵解代謝,鑒于circXRN2、LATS1和Hippo通路之間的密切關(guān)系,作者假設(shè)circXRN2在膀胱癌細(xì)胞的糖酵解中起著關(guān)鍵作用。為了驗(yàn)證這一推測(cè),作者過(guò)表達(dá)了circXRN2,并進(jìn)行了2-NBDG攝取檢測(cè)、葡萄糖攝取測(cè)定和乳酸生成測(cè)定。結(jié)果證明,circXRN2降低了T24和TCCSUP細(xì)胞中的葡萄糖攝取和乳酸生成。海馬糖酵解速率分析的結(jié)果表明,過(guò)表達(dá)circXRN2的膀胱癌細(xì)胞的糖PER、基礎(chǔ)糖酵解和代償性糖酵解均低于正常腫瘤細(xì)胞。綜上所述,circXRN2在膀胱癌細(xì)胞的糖酵解和乳酸代謝中起負(fù)面作用。

CircXRN2通過(guò)穩(wěn)定LATS1介導(dǎo)Hippo通路,以調(diào)節(jié)膀胱癌的進(jìn)展、糖酵解和乳酸生成
作者為了證實(shí)circXRN2/LATS1軸調(diào)控膀胱腫瘤細(xì)胞的多種生物學(xué)功能和葡萄糖代謝,在過(guò)表達(dá)circXRN2的細(xì)胞中敲低LATS1蛋白。免疫印跡分析顯示在過(guò)表達(dá)circXRN2細(xì)胞中,LATS1蛋白和Hippo通路關(guān)鍵蛋白TAZ/YAP表現(xiàn)出相反的趨勢(shì),免疫熒光也表明CircXRN2改變了膀胱癌細(xì)胞中TAZ/YAP的位置。
CCK-8實(shí)驗(yàn)和細(xì)胞集落形成實(shí)驗(yàn)的結(jié)果表明,shLATS1逆轉(zhuǎn)了circXRN2對(duì)細(xì)胞活力和增殖的抑制作用。同時(shí),通過(guò)Transwell實(shí)驗(yàn)和傷口愈合實(shí)驗(yàn)表明。與circxrn2過(guò)表達(dá)的細(xì)胞相比,轉(zhuǎn)染shLATS1的細(xì)胞遷移能力更強(qiáng)。
此外,對(duì)照組、circXRN2-過(guò)表達(dá)組和 circXRN2+shLATS1組的葡萄糖攝取能力和乳酸生成分別通過(guò)2-NBDG攝取測(cè)定、葡萄糖攝取測(cè)定和乳酸生成檢測(cè)來(lái)確定。結(jié)果顯示,shLATS1減輕了circXRN2對(duì)糖酵解代謝的抑制。

circXRN2調(diào)控組蛋白乳酸化促進(jìn)膀胱癌的發(fā)生
組蛋白乳酸化依賴于糖酵解或其他代謝過(guò)程產(chǎn)生的細(xì)胞內(nèi)乳酸。因此,作者利用2-DG(一種糖酵解抑制劑)和草酸酯(一種乳酸脫氫酶抑制劑)來(lái)證實(shí)膀胱癌細(xì)胞中糖酵解、總?cè)樗峄徒M蛋白乳酸化之間的關(guān)系。2-DG和草酸酯以劑量依賴的方式降低了總?cè)樗峄徒M蛋白H3K18乳酸化水平,而乳酸脫氫酶LDH則完全抑制了這一趨勢(shì)。同時(shí),circXRN2顯著降低了總?cè)樗峄虷3K18乳酸化水平。值得注意的是,在膀胱癌細(xì)胞系中,總?cè)樗峄虷3K18乳酸化水平是顯著升高的,這表明其在腫瘤發(fā)生中的潛在作用。
所以,作者接著驗(yàn)證H3K18乳酸化在膀胱癌中的生物學(xué)功能,通過(guò)消siLDHA/B以降低總?cè)樗峄虷3K18乳酸化水平,CCK-8和菌落形成實(shí)驗(yàn)表明,H3K18乳酸化在細(xì)胞增殖和集落形成能力起著至關(guān)重要的作用。此外,siLDHA/B還會(huì)損害膀胱癌細(xì)胞的遷移能力。綜上所述,這些結(jié)果表明組蛋白H3K18的乳酸化是由circXRN2調(diào)節(jié)的,并參與了膀胱癌的腫瘤發(fā)生。

LCN2是H3K18乳酸化的靶點(diǎn),在膀胱癌中作為致癌基因
作者接著研究了H3K18乳酸化的調(diào)控機(jī)制,CUT&Tag和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)分析顯示,H3K18la可以在許多基因的啟動(dòng)子區(qū)域富集,同時(shí),H3K18la相關(guān)基因也在調(diào)節(jié)腫瘤發(fā)生的多種信號(hào)通路中富集。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并與CUT&Tag數(shù)據(jù)和PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),作者選取了LCN2、NRARP 和KRT80作為候選基因,然后發(fā)現(xiàn),在過(guò)表達(dá)circXRN2的膀胱癌細(xì)胞中,LCN2被circXRN2顯著下調(diào)。此外,2-DG也在蛋白水平上調(diào)節(jié)LCN2的表達(dá)。
LCN2是一種癌癥進(jìn)展的促進(jìn)因子,在膀胱癌組織中表達(dá)上調(diào)。為了進(jìn)一步研究其功能,作者針對(duì)LCN2啟動(dòng)子設(shè)計(jì)了不同區(qū)域的特異性引物,ChIP實(shí)驗(yàn)顯示H3K18la富集在LCN2啟動(dòng)子中,且H3K18la與LCN2啟動(dòng)子之間的相互作用可以被2-DG和circXRN2降低,進(jìn)一步表明H3K18la在LCN2轉(zhuǎn)錄中的關(guān)鍵作用。最后,LCN2的敲低顯著地降低了細(xì)胞的增殖、菌落的形成和增殖腫瘤細(xì)胞的遷移。綜上所述,LCN2直接受H3K18乳酸化調(diào)控,并在人類膀胱癌中發(fā)揮致癌基因的作用。

CircXRN2-LATS1軸在體內(nèi)抑制膀胱癌細(xì)胞的腫瘤生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移
為了驗(yàn)證circXRN2-LATS1軸是否能抑制膀胱癌細(xì)胞的腫瘤生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移,作者將轉(zhuǎn)染(對(duì)照、circXRN2過(guò)表達(dá)、circXRN2+shLATS1)的細(xì)胞皮下注射到裸鼠體內(nèi)。與體外細(xì)胞實(shí)驗(yàn)相似,過(guò)表達(dá)circXRN2顯著降低腫瘤的生長(zhǎng)速率,而敲低LATS1可顯著減弱circXRN2的抑制效果。作者又構(gòu)建了裸鼠肺轉(zhuǎn)移模型,與對(duì)照組相比,過(guò)表達(dá)circXRN2顯著減少了肺轉(zhuǎn)移性結(jié)節(jié),而circXRN2+shLATS1組中,結(jié)節(jié)顯著增加。此外,通過(guò)免疫組化和免疫印跡檢測(cè)了不同治療組腫瘤中LATS1、TAZ/YAP、LCN2和H3K18la的表達(dá)水平,與上述的實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。綜上所述,circXRN2通過(guò)調(diào)控Hippo信號(hào)通路來(lái)抑制人膀胱癌中H3K18乳酸化介導(dǎo)的腫瘤進(jìn)展。

總結(jié)
本研究探索了環(huán)狀RNA的一種新的分子機(jī)制,并為環(huán)狀RNA和H3K18乳酸化調(diào)節(jié)人膀胱癌的腫瘤進(jìn)展提供了具體的證據(jù)。特別地,circXRN2通過(guò)調(diào)節(jié)H3K18乳酸化來(lái)抑制膀胱癌的進(jìn)展。在機(jī)制上,circXRN2與LAST1蛋白結(jié)合,保護(hù)其免受SPOP介導(dǎo)的泛素化降解,隨后調(diào)控Hippo信號(hào)通路,抑制H3K18乳酸化。本研究結(jié)果將有助于發(fā)現(xiàn)人類膀胱癌新的分子靶點(diǎn)和治療策略。

原文鏈接:
https://doi.org/10.1186/s12943-023-01856-1