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深度學(xué)習(xí)法-- 基于基因分型的數(shù)據(jù)排序鑒定與蠶豆中毒和定殖含量相關(guān)的調(diào)節(jié)性SNP

2021-01-07 23:35 作者:geneXplain  | 我要投稿

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geneXplain很高興與您分享另一個(gè)TRANSFAC?應(yīng)用程序的出色示例,該實(shí)例是在bean系統(tǒng)中的應(yīng)用!

最近的出版物“深度學(xué)習(xí)法-- 基于基因分型的數(shù)據(jù)排序鑒定與蠶豆中毒和定殖含量相關(guān)的調(diào)節(jié)性SNP ” 描述了可控制蠶豆中有毒化合物合成的調(diào)節(jié)劑的鑒定。 在該研究中,通過使用MATCH?程序以及從TRANSFAC?數(shù)據(jù)庫獲得的非冗余植物位置權(quán)重矩陣(PWM)庫,可以鑒定出預(yù)計(jì)會(huì)影響轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的SNP。

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圖示: CNN啟動(dòng)子預(yù)測的網(wǎng)絡(luò)體系結(jié)構(gòu)由四個(gè)1D卷積層,一個(gè)平坦層和兩個(gè)完全連接的層組成。 最后,具有一個(gè)神經(jīng)元和乙狀結(jié)腸激活功能的輸出層計(jì)算被分析序列被分類為啟動(dòng)子序列的概率。


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