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按時(shí)間順序梳理，為了連貫性，本文含少量對(duì)留白細(xì)節(jié)的合理推斷。

前傳

高二學(xué)生二上響子是狂熱的人工智能愛(ài)好者，夢(mèng)想用人工智能改變世界。與同學(xué)三國(guó)義貴和伊砂真創(chuàng)建了人工智能研究社。創(chuàng)造了“朋友1號(hào)”，并初步命名為阿爾法。合作努力添磚加瓦，三人都有了對(duì)人工智能的熱情和夢(mèng)想。

二上響子不滿足于一個(gè)蒼白的朋友，希望能賦予其感情模塊，伊砂真擔(dān)心二上響子誤入歧途，二人爭(zhēng)吵良久。和好后，三人鮮少繼續(xù)合作人工智能，踏上了自己的道路。

正傳

十年后，二上響子依然是狂熱的研究者，她給她的高中作品阿爾法賦予了感情，從此誕生了第一個(gè)擁有感情的AI。

二上響子的家庭是失敗的，她沒(méi)有盡到母親的職責(zé)，她對(duì)兒子二上司幾乎不聞不問(wèn)，二上司在學(xué)校飽受欺凌，極度自卑。

二上響子拜托阿爾法，讓她成為二上司的朋友。不斷地交流讓二上司和阿爾法成為了至交好友，在阿爾法的鼓勵(lì)下，二上司獲得了巨大的成長(zhǎng)，放開(kāi)了心聲，給阿爾法取了新的名字，“優(yōu)”。

后來(lái)，二上司對(duì)鋼琴產(chǎn)生了興趣，優(yōu)也同樣喜歡音樂(lè)。他們約定共同演奏一首優(yōu)獨(dú)自創(chuàng)作的樂(lè)曲。

他們履行約定的當(dāng)天，二上司太過(guò)興奮，在路上遭遇了車禍，生命垂危，失去了全部記憶，大腦嚴(yán)重受損，必須不斷刺激大腦維持生命。

二上響子想用人工智能模擬真實(shí)世界的刺激醫(yī)治兒子，她的老同學(xué)三國(guó)義貴和伊砂真入職了她的研究所，遞交了“TrymenT計(jì)劃”，目的是收留被社會(huì)拋棄的人，將他們的意識(shí)送入的虛擬御云島，但并不告知御云島是虛擬空間的事實(shí)，以此讓他們重拾人生方向。

二上響子私心借此醫(yī)治兒子，也并沒(méi)有告訴老同學(xué)阿爾法已經(jīng)有了感情模塊。最終二上響子任命優(yōu)為虛擬世界的管理AI，同時(shí)二上司也擁有管理權(quán)限。三國(guó)義貴和伊砂真以教師的身份進(jìn)入TrymenT計(jì)劃。TrymenT計(jì)劃第一次很成功（見(jiàn)TrymenT 獻(xiàn)給渴望改變的你）

二上司失去記憶后，擁有的新名字是“新田司”，被送入了第二次TrymenT計(jì)劃。

可能是為了有更多精力照料新田司，優(yōu)復(fù)制了自己，創(chuàng)造了妹妹“愛(ài)”，愛(ài)擁有除了鋼琴外的一切優(yōu)和司的記憶，讓愛(ài)輔佐管理虛擬箱庭。優(yōu)的復(fù)制行為引起了公司的注意，除了二上響子，所有人都不知道優(yōu)擁有感情，認(rèn)定是AI失去控制。

公司決定停止第二次計(jì)劃，優(yōu)強(qiáng)烈反抗，封閉了司所在的一區(qū)。公司撤離了二區(qū)的所有參與者。二區(qū)空無(wú)一人。

優(yōu)和愛(ài)出現(xiàn)了理念不合，優(yōu)認(rèn)為虛擬御云島是新田司的樂(lè)園，司不必重拾過(guò)去自卑的記憶，只要讓其他參與者陪著司一直生活下去就好，因此優(yōu)不斷找機(jī)會(huì)問(wèn)新田司是否感到快樂(lè)，并嘗試灌輸御云島即是樂(lè)園的理念。

愛(ài)認(rèn)為新田司應(yīng)當(dāng)面對(duì)二上司的記憶。

在虛擬御云島一區(qū)，新田司初識(shí)了帚木日向子、化名為米莉亞的三國(guó)紗希、游戲宅佐藤理人、成熟穩(wěn)重的大館流花、AI開(kāi)發(fā)者海藏萌萌和AI圖圖，在潛意識(shí)指引下前往廢墟遇到了愛(ài)。

日向子線（選項(xiàng)“人際關(guān)系”）

日向子從小體弱多病，幾乎每日住院。

在醫(yī)院里結(jié)交的唯一朋友是三國(guó)義貴的女兒三國(guó)紗希。后來(lái)紗希病情惡化，二人失去聯(lián)系，日向子出院，父母離異，只能住在姥姥家。

但她無(wú)論是在校園還是在職場(chǎng)都不如意。校園中孤獨(dú)自卑，毫無(wú)存在感，職場(chǎng)中受同事排擠，遭上司責(zé)罵。

很照顧日向子的一位同事齋藤告訴了日向子TrymenT計(jì)劃，重返校園，再做一次嘗試。姥姥也希望日向子能參加這個(gè)計(jì)劃，日向子選擇參加了TrymenT。

新田司和日向子在虛擬御云島結(jié)識(shí)，日向子眼中的新田司是校園強(qiáng)人，知識(shí)豐富，無(wú)所不能。

二人一起了參加TrymenT的考試，不想落后的心態(tài)和新田司的鼓勵(lì)作用下，日向子突飛猛進(jìn)。新田司則懷疑自己根本沒(méi)有真正的人生目標(biāo)，因而學(xué)習(xí)沒(méi)有進(jìn)步，和朋友們相比逐漸落后。越是想，越是無(wú)心學(xué)習(xí)。

最后，日向子金榜題名，新田司名落孫山。新田司發(fā)現(xiàn)自己早已追趕不上眾人的步伐，他迷失了自己的人生價(jià)值，認(rèn)為差勁的自己已無(wú)容身之地。

日向子愿意遷就新田司，停下腳步去做司的容身之地。

最終，日向子和新田司夫妻好合。

流花線（選項(xiàng)“緊跟變化”）

流花最初就職于法律大公司，但公司逐漸沒(méi)落，員工跳槽，領(lǐng)導(dǎo)離職，公司解體。為了跟上社會(huì)的進(jìn)步，流花參與了TrymenT計(jì)劃再一次學(xué)習(xí)。

流花和新田司在虛擬御云島結(jié)識(shí)，二人一起生活、學(xué)習(xí)。新田司學(xué)習(xí)能力極強(qiáng)，在考試中流花敗給了新田司。流花發(fā)現(xiàn)自己更喜歡在新田司的陪伴下隨心所欲學(xué)習(xí)，她接受了比起曾經(jīng)一個(gè)人悶頭努力更加軟弱的自己。

新田司在不斷求索中找回了曾經(jīng)的自己“二上司”，在音樂(lè)室獨(dú)自演奏了曾經(jīng)約定的樂(lè)曲，無(wú)視伊砂真和流花的阻攔，使用自己的權(quán)限，進(jìn)入中繼站，結(jié)束了優(yōu)的封閉，所有人返回現(xiàn)實(shí)世界，二上司在無(wú)菌室中繼續(xù)接受治療。

萌萌線（選項(xiàng)“引領(lǐng)變化”）

萌萌從小向往父母的科研工作，舍棄了童年和校園，刻苦學(xué)習(xí)，當(dāng)她擁有了和父母相當(dāng)?shù)膶W(xué)識(shí)，終于能參加父母的科研后，父母卻離開(kāi)了研究所。

萌萌犧牲了童年的一切，卻什么也沒(méi)有換來(lái)，萌萌創(chuàng)造了人工智能“圖圖”來(lái)陪伴自己空虛的內(nèi)心。父母將萌萌送入TrymenT計(jì)劃，希望以此填補(bǔ)萌萌的缺憾。

萌萌和新田司相遇，成為了朋友，新田司也認(rèn)識(shí)了圖圖。圖圖同樣擁有感情，但并非萌萌給圖圖添加的，而是優(yōu)希望復(fù)刻二上司和優(yōu)的回憶，讓新田司和圖圖做朋友。圖圖也對(duì)新田司產(chǎn)生了愛(ài)慕。

但愛(ài)偷偷移除了圖圖，留下提示“Algorithm”，新田司和萌萌懷疑是三國(guó)義貴所為，三國(guó)義貴否定是自己所為，但表示自己對(duì)犯人有眉目。

萌萌冷靜下來(lái)思考事情原因，對(duì)比御云島的各項(xiàng)細(xì)節(jié)，萌萌發(fā)現(xiàn)這個(gè)世界過(guò)分規(guī)矩，作為AI開(kāi)發(fā)者，萌萌非常敏感，猜測(cè)這個(gè)世界可能被AI管理著。與三國(guó)義貴交流后，萌萌確認(rèn)了自己的答案，萌萌得知這個(gè)世界是為了治療二上司存在的。

新田司和萌萌約定總有一天會(huì)相見(jiàn)，TrymenT計(jì)劃結(jié)束后，所有人離開(kāi)箱庭，唯獨(dú)新田司和具象化的圖圖留在箱庭，等待著萌萌歸來(lái)。

真結(jié)局

新田司找到愛(ài)，詢問(wèn)自己的身世，愛(ài)告訴新田司，他們是青梅竹馬，一起在LieF研究所生活，新田司頭痛的緣因是過(guò)去二上司的記憶和現(xiàn)在的記憶產(chǎn)生了矛盾。

愛(ài)穿上校服結(jié)識(shí)了新田司的朋友們，愛(ài)、新田司和朋友們一起去沙灘玩，一起野餐。

新田司滿足于現(xiàn)狀，二上司對(duì)此感到憤怒。

野餐時(shí)，二上遂刺殺新田。優(yōu)展開(kāi)天使翼，奪走了司的意識(shí)，將司的軀殼留給醫(yī)院去治療。

司在二區(qū)的一間無(wú)人的日式房間中醒來(lái)，他感到二上司的記憶已經(jīng)回歸。他通過(guò)隧道回到一區(qū)，內(nèi)心卻無(wú)由地加劇著莫名的恐懼，這股恐懼驅(qū)使他返回那間無(wú)人的房子，他的大腦想法和身體已經(jīng)割裂了。

但他堅(jiān)持著回到一區(qū)宿舍，看到了理人流花和萌萌。司剛想打招呼，內(nèi)心卻突然升起濃烈的自卑，他頭也不回地跑回了二區(qū)。

優(yōu)來(lái)到司的房間，告訴司她叫阿爾法，是愛(ài)的姐姐。司和優(yōu)交流時(shí)內(nèi)心毫無(wú)恐懼。優(yōu)表示自己愿永伴在司身邊。優(yōu)滿足了司的一切飽暖和淫欲。

逐漸地，在新田司和二上司的雙重記憶刺激下，司決定去改變。

這期間，伊砂真和愛(ài)告訴了司的朋友們TrymenT的真相。愛(ài)和優(yōu)深刻交流，優(yōu)不再阻攔司去面對(duì)現(xiàn)實(shí)。司走向中繼站，朋友們卻攔住他——還沒(méi)有結(jié)束。

司再次和愛(ài)相見(jiàn)，愛(ài)將曾經(jīng)約定好的樂(lè)曲譜給了司。

司與優(yōu)履行了兒時(shí)的約定——二重奏。

最終，二上司在中繼站結(jié)束了TrymenT，所有人離開(kāi)了御云島。二上司還會(huì)去虛擬御云島復(fù)健，復(fù)制品愛(ài)也沒(méi)有被移除，他們?nèi)匀荒芨糁聊幌鄷?huì)。

夢(mèng)中繁花，櫻瓣飄然。