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靶向脂質(zhì)組學+免疫組學揭示:類視黃醇抑制腫瘤細胞鐵死亡機理

2023-07-13 14:57 作者:鹿明生物  | 我要投稿

01研究背景

鐵死亡是一種鐵依賴性調(diào)節(jié)細胞死亡形式,由細胞膜脂質(zhì)過氧化物的過載引起。近年來,鐵死亡引發(fā)關(guān)注并大量報道。本研究通過擬靶向脂質(zhì)組學、免疫組學等方法,發(fā)現(xiàn)誘導(dǎo)腫瘤細胞鐵死亡,可作為一種潛在的治療方法。但是否通過多種途徑從不同維度進行調(diào)節(jié)仍需深入探索,鐵死亡概念的提出與機制深入探究,為進一步發(fā)掘腫瘤靶向治療提供新方向。

02前言

2023年5月,復(fù)旦大學附屬中山醫(yī)院胸外科王群、詹成課題組與美國德克薩斯大學MD安德森癌癥中心Boyi Gan課題組Cancer Research期刊發(fā)表的題為 “Retinol saturase mediates retinoid metabolism to impair a ferroptosis defense system in cancer cells ”(IF:13.312)的研究成果,通過靶向代謝組學、qRT-PCR?、LC-MS、免疫組織化學等研究方法,發(fā)現(xiàn)類視黃醇顯著抑制鐵死亡能力特征,腫瘤靶向治療提供了理論依據(jù)。

03研究思路

04研究方法

研究材料:

雄性BALB/c裸鼠,4周齡,隨機分為六個治療組(n=8)

研究技術(shù):

(1)CCK8:測定細胞活力

(2)qRT-PCR:RNA提取和定量分析

(3)免疫印跡:檢測蛋白質(zhì)

(4)BODIPY-C11法:測定脂質(zhì)過氧化

(5)MDA測定:MDA試劑盒

(6)FENIX測定:Malvern粒度儀

(7)RNA測序:Illumina HiSeq平臺

(8)LC-MS:靶向脂質(zhì)組學分析

(9)染色質(zhì)免疫沉淀法CHIP:測定染色質(zhì)

(10)免疫組織化學:分析腫瘤體

05研究結(jié)果

1.?CRISPR/Cas9篩選發(fā)現(xiàn)RETSAT是一種重要的鐵死亡疾病介體

通過CRISPR/Cas9篩選發(fā)現(xiàn),除了LA(亞油酸)外所有的脂肪酸中,ACSL4參與PUFAs(多不飽和脂肪酸)酯化的鐵死亡因子調(diào)節(jié)。研究通過細胞實驗進一步發(fā)現(xiàn),在腫瘤細胞中敲低或敲除RETSAT對鐵死亡誘導(dǎo)的RSL3、IKE等導(dǎo)致的細胞脂質(zhì)過氧化及后續(xù)細胞死亡具有顯著的保護作用。表明FINs(鐵死亡誘導(dǎo)劑)誘導(dǎo)RETSAT上調(diào),RETSAT參與了鐵死亡級聯(lián)反應(yīng)(圖1A-E)。

2.?RETSAT是一種不干擾已知鐵死亡調(diào)節(jié)因子的促鐵死亡基因

研究發(fā)現(xiàn)RETSAT-KO細胞作用不同靶點的多種FINs觸發(fā)的鐵死亡性貧血更具抵抗力。RETSAT-KO細胞對FINs的敏感性通過重新表達而恢復(fù),而排除了CRISPR/Cas9介導(dǎo)的RETSAT耗竭的脫靶效應(yīng)。RETSAT在鐵蛋白血癥中顯示出特異性,RETSAT-KO阻止了RSL3誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化,表明RETSAT是一個關(guān)鍵促鐵死亡基因(圖1F-K)。

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圖1 CRISPR/Cas9篩查將RETSAT與鐵死亡性貧血相關(guān)聯(lián)

3.?類視黃醇可防止脂質(zhì)過氧化和鐵死亡性貧血

RETSAT鐵死亡性貧血和類視黃醇代謝作用,通過外源性培養(yǎng)補充ROL(視黃醇)及下游代謝產(chǎn)物,包括RAL(視黃醛)和RA(視黃酸),以劑量依賴的方式消除細胞對FINs的敏感性。ROL、RAL和RA顯著消除了由RSL3引起的脂質(zhì)過氧化(圖2A-C)。

4.?STRA6通過介導(dǎo)ROL進入細胞防止鐵死亡性貧血

通過CRISPR/Cas9產(chǎn)生的STRA6-KO細胞系發(fā)現(xiàn)STRA6的缺失不僅使細胞對FINs敏感,且削弱了外源性補充的ROL抗鐵死亡作用。表明類視黃醇在預(yù)防鐵死亡性貧血引起了脂質(zhì)過氧化(圖2D-F)。

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圖2視黃醇作為自由基捕獲預(yù)防鐵死亡性貧血抗氧化劑

5.?類視黃醇是有效的自由基捕獲抗氧化劑

研究通過熒光抑制自氧化(FENIX)測定模擬細胞膜的脂質(zhì)雙層。ROL、RAL或RA,以劑量依賴方式顯著延遲了自身氧化。代謝產(chǎn)物中,RAL表現(xiàn)出最強的自由基捕獲活性,可能是具有獨特的官能團。表明類視黃醇可以捕獲脂質(zhì)雙層中的自由基,而破壞脂質(zhì)過氧化(圖3A-C)。

6.?RETSAT通過介導(dǎo)ROL減少13,14-DROL促進鐵死亡性貧血

研究發(fā)現(xiàn)RETSAT的酶促功能將ROL轉(zhuǎn)化為13,14-DROL,具有與RETSAT一致的促鐵死亡作用。用ROL補充的Cas-NC、RETSAT-KO和RETSAT-OE細胞,可降低或消除對FINs的敏感性。表明RETSAT通過酶促介導(dǎo)將ROL轉(zhuǎn)化為13,14-DROL,從而削弱了ROL的抗氧化活性(圖3D)。

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圖3 RETSAT通過介導(dǎo)類視黃醇代謝調(diào)節(jié)鐵死亡性貧血

7.?RETSAT部分通過視黃酸受體途徑發(fā)揮其促鐵死亡作用

研究發(fā)現(xiàn)RETSAT的缺失顯著激活了RAR(視黃酸受體)信號通路。RAR顯著降低細胞的脂質(zhì)過氧化和鐵死亡細胞的敏感性,而RAR拮抗劑則不能,因為細胞系中的基礎(chǔ)RAR激活水平較低。通過外源性補充RAR激動劑來提高RAR活性,揭示了載體和細胞間鐵死亡敏感性差異。RETSAT通過消除類視黃醇的自由基捕獲特性和抑制RAR途徑調(diào)節(jié)鐵死亡性貧血,而RAR激動劑和拮抗劑只能部分消除RETSAT的影響(圖4)。

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圖4 RETSAT部分通過視黃酸受體途徑促進鐵死亡性貧血

8.?擬靶向脂質(zhì)組學顯示RETSAT的耗竭可促進單不飽和脂肪酸的生成

靶向脂質(zhì)組學發(fā)現(xiàn)在攜帶RETSAT-KO的A549細胞中脂肪酸和磷脂顯著增加。脂質(zhì)組學研究結(jié)果與RETSAT-KO細胞系對脫鐵性貧血的耐藥性增加一致,說明RETSAT-RAR通路通過促進單不飽和脂肪酸(或酰基)(MUFA)的產(chǎn)生介導(dǎo)鐵死亡性貧血(圖5A-C)。

9.?RETSAT-RAR通路通過SCD介導(dǎo)的MUFA使細胞對鐵死亡性貧血敏感

通過靶向脂質(zhì)組學發(fā)現(xiàn)RETSAT-KO和RAR的激活誘導(dǎo)了SCD的表達和MUFA的產(chǎn)生。RARα結(jié)合位點(RARE)、RETSAT耗竭及RAR激動劑激活轉(zhuǎn)錄,證實RAR通過與其啟動子結(jié)合直接激活SCD轉(zhuǎn)錄。RETSAT抑制RAR信號通路的活性,延緩RAR靶向SCD的轉(zhuǎn)錄,而導(dǎo)致MUFA生成減少(圖5D-P)。

?圖5 RETSAT-RAR通路通過SCD介導(dǎo)的MUFA生成促進鐵死亡性貧血

10.?體內(nèi)類視黃醇代謝改變腫瘤鐵下垂

通過動物實驗發(fā)現(xiàn),RETSAT缺失沒有顯著抑制或促進腫瘤的生長。在腫瘤樣本中,RETSAT缺失和類視黃醇補充均減輕了脂質(zhì)過氧化標記物。研究結(jié)果證實,RETSAT-KO或外源性補充劑引起的類視黃醇水平升高使體內(nèi)腫瘤對鐵下垂脫敏,并提高了腫瘤治療中靶向類視黃醇代謝的可能性(圖6A-B)。

11.?類視黃醇代謝與LUAD患者預(yù)后的關(guān)系

通過類視黃醇臨床相關(guān)研究,LUAD(肺腺癌)患者中較低的RETSAT表達水平與較短的總生存期相關(guān),而STRA相反。免疫組化分析了具有臨床病理特征的LUAD患者中RETSAT和STRA6的蛋白水平,發(fā)現(xiàn)RETSAT在正常肺組織中大量表達,但在LUAD組織中弱表達,而STRA6呈現(xiàn)相反的趨勢。研究結(jié)果表明,腫瘤細胞中類視黃醇的合成增強產(chǎn)生過量的ROS,導(dǎo)致了惡性腫瘤的增加(圖6C-H)。

圖6視黃醇代謝改變體內(nèi)腫瘤鐵死亡性貧血并與LUAD患者預(yù)后相關(guān)

06研究結(jié)論

研究發(fā)現(xiàn)類視黃醇對鐵死亡的調(diào)控作用與脂質(zhì)代謝有關(guān)。類視黃醇類物質(zhì)具有抗氧化能力,可防止脂質(zhì)過氧化導(dǎo)致的細胞膜碎裂,從而終止鐵死亡。通過擬靶向脂質(zhì)組學等研究發(fā)現(xiàn),類視黃醇還可促進單不飽和脂肪酸的生成。而體內(nèi)類視黃醇代謝可改變腫瘤鐵下垂,并與LUAD患者預(yù)后相關(guān)。

本研究通過靶向代謝組學、免疫組學等方法揭示了類視黃醇拮抗腫瘤細胞鐵死亡機制。這一發(fā)現(xiàn)有助于探尋靶向腫瘤細胞視黃醇代謝誘導(dǎo)腫瘤細胞鐵死亡的治療方案,為進一步探索腫瘤靶向治療提供的新方法、新思路。

上海鹿明生物科技有限公司是歐易生物旗下從事蛋白質(zhì)組代謝組質(zhì)譜檢測專業(yè)質(zhì)譜組學服務(wù)公司。公司建有國內(nèi)第一個空間代謝組商業(yè)服務(wù)平臺,深耕質(zhì)譜組學檢測分析,具體包括空間代謝組、雙平臺代謝組、靶向代謝組、TMT標記定量蛋白組、翻譯后修飾蛋白組、4D-DIA蛋白組、單細胞及超微量蛋白組、空間蛋白組等。創(chuàng)新質(zhì)譜組學平臺廣泛應(yīng)用于機制解析、分型診斷、標志物篩選、藥靶發(fā)掘等多個領(lǐng)域。公司并先后獲得高新技術(shù)企業(yè)、上海市專精特新企業(yè)并建有院士專家工作站,自有包括tims tof pro2在內(nèi)的各類大型質(zhì)譜近二十臺套,年服務(wù)項目超2000項。鹿明生物協(xié)助合作伙伴發(fā)表SCI論文近千篇,成功打造以硬數(shù)據(jù)、好服務(wù)為基礎(chǔ),以空間代謝組為特色的質(zhì)譜組學檢測服務(wù)公司品牌。


本文系鹿明生物原創(chuàng)解讀

轉(zhuǎn)載請注明本文轉(zhuǎn)自鹿明生物

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