更多實(shí)用功能 更少使用障礙

?ASReml-R 4.2?

備受期待的ASReml-R新版本4.2 現(xiàn)在可以下載了。

ASReml-R 4.2將允許您在不影響準(zhǔn)確性的情況下更快地?cái)M合復(fù)雜模型。我們相信ASReml-R 4.2將顯著提高您的分析能力，作為我們的主要客戶(hù)之一，我們誠(chéng)邀您下載體驗(yàn)！

以下是您可以期待的一些令人興奮的新功能：

• 分析速度更快：ASReml-R 4.2使您能夠更快地?cái)M合具有更大數(shù)據(jù)集的復(fù)雜模型。優(yōu)化和線(xiàn)程化數(shù)學(xué)例程的顯著提升了計(jì)算速度。

• 使用ASReml-R 4.2進(jìn)行因子分析MET分析的速度快40倍。

• 使用消費(fèi)級(jí)的新版本ASReml-R 4.2，預(yù)測(cè)模型的速度提高了85倍。

• 更高的資源利用率：ASReml-R 4.2結(jié)合了改進(jìn)的處理速度、例程增強(qiáng)和優(yōu)化內(nèi)存訪問(wèn)：以更好地利用服務(wù)器和云服務(wù)。輕松完成復(fù)雜的分析，最大限度地提高資源效率，更快地完成任務(wù)。

• 文檔的改進(jìn)：增強(qiáng)和擴(kuò)展的文檔為您提供了必要的命令行、技術(shù)細(xì)節(jié)和代碼示例。確保您可以使用ASReml-R4.2的全部功能來(lái)有效地運(yùn)行您的模型。

01 ASReml 4.2的主要新功能和優(yōu)點(diǎn)

并行處理

在多核機(jī)器上，您的分析可以分為更小的部分，全部同時(shí)運(yùn)行，使您能夠更快地獲得結(jié)果。ASReml-R 4.2針對(duì)多線(xiàn)程處理進(jìn)行了優(yōu)化，使您可以使用多個(gè)線(xiàn)程。這大大提高了處理速度，有時(shí)甚至可以快70倍。（這些收益取決于多種因素，包括：微處理器、機(jī)器功率、數(shù)據(jù)集大小和分析類(lèi)型等。例如，在ASReml-R 4.1中，18144項(xiàng)創(chuàng)紀(jì)錄的MET試驗(yàn)在一臺(tái)配有16 GB RAM和CPU Intel?Core的機(jī)器上花費(fèi)了21個(gè)多小時(shí)進(jìn)行處理? i7-3770K。ASReml-R 4.2在2.9小時(shí)內(nèi)完成了同樣的工作。使用8線(xiàn)程多處理，時(shí)間再次減少到26分鐘：速度幾乎提高了50倍。

系譜修剪/吸收父母

譜系修剪和吸收沒(méi)有數(shù)據(jù)的父母可以節(jié)省計(jì)算時(shí)間。這種譜系預(yù)處理從譜系中去除了不必要的個(gè)體，加快了可能性評(píng)估，同時(shí)保持了核心成員之間的適當(dāng)關(guān)系。

內(nèi)存訪問(wèn)（工作區(qū)）

內(nèi)存訪問(wèn)已增加到最大96 GB，使您能夠在更短的時(shí)間內(nèi)分析更大的問(wèn)題。在多用戶(hù)系統(tǒng)上，通過(guò)允許每個(gè)用戶(hù)指定其當(dāng)前會(huì)話(huà)所需的內(nèi)存量，可以最大限度地提高內(nèi)存效率。（最大分配取決于您電腦上的可用空間。我們建議請(qǐng)求的工作空間不要超過(guò)您電腦上可用的RAM。）

優(yōu)化內(nèi)部程序

ASReml-R 4.2的許多核心例程都經(jīng)過(guò)了重新設(shè)計(jì)，使其比以前的版本快得多。在具有相對(duì)密集的G矩陣的作業(yè)中，計(jì)算時(shí)間通常減少40%以上。

擬合二元GLM（M）模型

以前版本的ASReml R允許對(duì)二元分布變量和線(xiàn)性模型變量進(jìn)行二元分析。ASReml-R 4.2擴(kuò)展了廣義線(xiàn)性模型的二元分析。現(xiàn)在，這兩個(gè)變量都可以用正態(tài)、二項(xiàng)式、泊松、伽馬或負(fù)二項(xiàng)式分布進(jìn)行分布。

02 ASReml-R 4.2 vs ASReml-R 4.1

VSNi公司于2023年6月發(fā)布了ASReml-R4.2,?這里我們用同樣的數(shù)據(jù)，分析GBLUP和ssGBLUP，看一下ASReml-R4.1和ASReml-R4.2運(yùn)行的時(shí)間以及結(jié)果。

ASReml-R4.1版本：

ASReml-R4.2版本：

數(shù)據(jù)描述

基因型數(shù)據(jù)：1500

系譜數(shù)據(jù)：2560

表型數(shù)據(jù)：2560

分析模型：GBLUP，ssGBLUP單性狀模型

電腦配置：windows系統(tǒng)，內(nèi)存16Gb

ASReml-R 4.1運(yùn)行時(shí)間和結(jié)果

GBLUP運(yùn)行：66.66s

ssGBLUP運(yùn)行：131.17s

ASReml-R 4.2運(yùn)行時(shí)間和結(jié)果

GBLUP運(yùn)行：4.84s

ssGBLUP運(yùn)行：23.46s

對(duì)比測(cè)試結(jié)果如下：

ASReml-R 4.1

GBLUP運(yùn)行：66.66s

ssGBLUP運(yùn)行：131.17s

ASReml-R 4.2

GBLUP運(yùn)行：4.84s

ssGBLUP運(yùn)行：23.46s

主要結(jié)論：

我們針對(duì)新版本ASReml-R 4.2和舊版本ASReml-R 4.1進(jìn)行了對(duì)比測(cè)試。就GS的分析而言，兩者結(jié)果方差組分和遺傳力以及育種值完全一樣，4.2相對(duì)于比4.1，單性狀GBLUP分析速度提升了16倍，單性狀ssGBLUP分析速度提升了6倍。如果是多線(xiàn)程的服務(wù)器，提升效果更明顯。

03 ASReml-R 4.2 體驗(yàn)與下載

最新版本ASReml-R 4.2公測(cè)上線(xiàn)，歡迎下載體驗(yàn)！

為了方便大家下載與體驗(yàn)，最新版本ASReml-R 4.2 的（Window,Linux,Mac版本）安裝包已經(jīng)放置于QQ群文件，新老客戶(hù)可以進(jìn)行體驗(yàn)使用，沒(méi)有激活碼的老師可以聯(lián)系我們申請(qǐng)短期的免費(fèi)試用。