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最新研究:新型冠狀病毒人傳人平均間隔時間為7.5天

2020-03-27 12:36 作者:財經(jīng)涂鴉  | 我要投稿



平均潛伏期為5.2天,潛伏期分布情況的第95百分位數(shù)為12.5天?!?/strong>


編譯:步搖

編輯:tuya

出品:財經(jīng)涂鴉

本文來自《新英格蘭醫(yī)學雜志》3月26號發(fā)布的文章。

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摘要


2019年12月和2020年1月,在中國湖北省武漢市出現(xiàn)了新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染肺炎(NCIP)的最初病例。我們分析了武漢最早的425例確診病例的數(shù)據(jù),以確定NCIP的流行病學特征。我們收集了截至2020年1月22日已報告的,經(jīng)實驗室確診的NCIP病例的人口統(tǒng)計學特征、暴露史和疾病時間線的信息。我們描述了病例特征,并估計了關(guān)鍵流行病學延遲時間分布情況。在呈指數(shù)增長的初期,我們估計了傳染病倍增時間和基本再生數(shù)。在最早的425例NCIP確診患者中,中位年齡為59歲,56%為男性。

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在2020年1月1日前發(fā)病的病例中,大部分(55%)與華南海鮮批發(fā)市場相關(guān),而在此后發(fā)病的病例中,僅8.6%與華南海鮮批發(fā)市場相關(guān)。平均潛伏期為5.2天(95%置信區(qū)間[CI],4.1~7.0),潛伏期分布情況的第95百分位數(shù)為12.5天。在初期,倍增時間為7.4天。由一人傳至另一人的平均間隔時間(serial interval)為7.5天(95% CI,5.3~19),基本再生數(shù)估計為2.2(95% CI,1.4~3.9)。

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根據(jù)這一信息,有證據(jù)表明,自2019年12月中旬以來,密切接觸者之間已發(fā)生人際傳播。如果其他地區(qū)的傳播動力學也相似,我們將需要付出相當大的努力來減少傳播,從而控制疫情,應(yīng)在高危人群中采取預(yù)防或減少傳播的措施。

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自2019年12月以來,華中地區(qū)擁有1100萬人口的大城市武漢發(fā)現(xiàn)了越來越多的新型冠狀病毒(2019-nCoV)感染肺炎(NCIP)病例。2019年12月29日,當?shù)蒯t(yī)院運用“不明原因肺炎”監(jiān)測機制,發(fā)現(xiàn)了最早報告的4個病例,這4例均與華南海鮮批發(fā)市場相關(guān);上述監(jiān)測機制是在2003年暴發(fā)嚴重急性呼吸系統(tǒng)綜合征(SARS)疫情后建立,目的是盡早發(fā)現(xiàn)新型病原體(例如2019-nCoV)。最近幾天,中國其他城市和全世界十幾個國家都發(fā)現(xiàn)了感染病例。我們在本文中對武漢市最早的425例實驗室確診病例的數(shù)據(jù)進行了分析,從而描述NCIP的流行病學特征和傳播動力學。

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結(jié)果

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在新型冠狀病毒疫情發(fā)展過程中,病例數(shù)量呈指數(shù)增長,最近幾天的曲線下降可能是由于近期發(fā)病的病例未得到充分確認,以及病例識別和報告時間的延遲,而非發(fā)病率的真正拐點(圖1)。具體而言,曲線后半部分并不表示新發(fā)病例數(shù)量減少,而是由于截止日期前的病例確認有所延遲。隨著時間的推移,檢測試劑盒的供應(yīng)和使用增多,因此1月份的病例數(shù)量增長速度應(yīng)謹慎解讀。大多數(shù)最早的病例均報告了華南海鮮批發(fā)市場暴露史,但從12月底開始,與該市場不相關(guān)的病例數(shù)量呈指數(shù)增長。

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患者的中位年齡為59歲(范圍,15~89歲),425例患者中有240例(56%)為男性。沒有任何病例是15歲以下兒童。我們分析了三個時間段的病例特征:第一個時間段是1月1日(關(guān)閉華南海鮮批發(fā)市場的日期)前發(fā)病的患者;第二階段是1月1日至1月11日(向武漢提供RT-PCR試劑的日期)期間發(fā)病的患者;第3個時間段是1月12日或之后發(fā)病的患者(表1)。發(fā)病較早的患者年齡略輕,男性比例較高,報告華南海鮮批發(fā)市場暴露史的比例明顯較高。醫(yī)務(wù)人員在病例中所占的比例在三個時間段逐步增加(表1)。

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我們分析了10例確診病例的暴露數(shù)據(jù),估計平均潛伏期為5.2天(95%置信區(qū)間[CI],4.1~7.0);分布情況的第95百分位數(shù)為12.5天(95% CI,9.2~18)(圖2A)。我們獲得了5個病例集群的信息,見圖3。根據(jù)這些集群中6對病例的發(fā)病日期,我們估計由一人傳至另一人的平均(±SD)間隔時間分布情況為7.5±3.4天(95% CI,5.3~19)(圖2B)。

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在截至2020年1月4日的流行曲線中,傳染病增長率為每天0.10(95% CI,0.050~0.16),倍增時間為7.4天(95% CI,4.2~14)。應(yīng)用上述由一人傳至另一人的間隔時間分布情況,我們估計R0為2.2(95% CI,1.4~3.9)。

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在1月1日之前發(fā)病的45例患者中,從發(fā)病至首次就診的平均間隔期估計為5.8天(95% CI,4.3~7.5),與1月1日至1月11日期間發(fā)病的207例患者的數(shù)據(jù)相似,后者的平均間隔期為4.6天(95% CI,4.1~5.1)(圖2C)。在1月1日之前發(fā)病的44例患者中,從發(fā)病至住院的平均間隔期估計為12.5天(95% CI,10.3到~14.8),這一間隔期超過1月1日至1月11日期間發(fā)病的189例患者(均值,9.1天;95% CI,8.6~9.7)(圖2D)。我們未繪制1月12日或之后發(fā)病患者的分布曲線,因為近期發(fā)病和發(fā)病與就診之間的間隔期較長的患者尚未檢測出。

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討論

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我們估計R0約為2.2,這意味著每例患者平均將感染傳給了另外2.2人。一般而言,只要R0大于1,疫情就會不斷加劇,而疾病控制措施的目標是將再生數(shù)降低至1以下。SARS的R0估計為3,我們通過隔離患者和嚴格控制感染的方式成功控制了SARS疫情。控制NCIP疫情是面臨的挑戰(zhàn)包括明顯存在許多輕度感染,以及可用于隔離病例和隔離觀察密切接觸者的資源有限。我們對R0的估計僅限于1月4日之前,因為近幾周以來人們對疫情認識的增加及檢測試劑盒供應(yīng)和使用的增多將增加得到確認的感染比例。武漢隨后采取的控制措施,以及近期中國其他地區(qū)和國外采取的控制措施有可能已經(jīng)降低了傳播率,但中國其他地區(qū)和全球檢出病例數(shù)量的增多提示疫情規(guī)模繼續(xù)擴大。武漢及周邊城市從1月23日以來采取的封城措施應(yīng)該可以減少病例向中國其他地區(qū)和國外的輸出,而目前的當務(wù)之急是確定其他地區(qū)是否也發(fā)生了類似強度的本地傳播。

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值得關(guān)注的是,早期病例中兒童極少,425個病例中有近一半的年齡≥60歲,但我們的病例定義中規(guī)定病情嚴重到需要醫(yī)療,而病情可能因是否有并發(fā)癥而存在差異。此外,兒童可能不易受到感染,而且即使感染,其癥狀也較輕,上述兩種情況均可解釋確診病例中兒童比例較低的情況。第一波疫情后的血清學調(diào)查將闡明這一問題。已經(jīng)有醫(yī)務(wù)人員發(fā)生感染,其比例低于SARS和MERS疫情時的情況。

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盡管發(fā)病與就診之間的間隔期一般較短,有27%的患者在發(fā)病后2天內(nèi)就診,但發(fā)病與住院之間的間隔期卻要長得多,有89%的患者至少要到發(fā)病第5日才住院(圖2)。這表明在疾病早期很難識別和隔離病例。為了積極主動追查病例,可能有必要在門診和急診科投入大量資源檢測患者,這既是在尚未發(fā)生本地傳播的地區(qū)所采取的疾病遏制策略,也是為了更早地對病例采取臨床治療。該方法還將提供關(guān)于亞臨床感染的重要信息,以便更好地評估嚴重程度。

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總之,我們發(fā)現(xiàn)武漢現(xiàn)階段的NCIP病例倍增時間約為7.4天。密切接觸者之間的人際傳播從12月中旬開始已經(jīng)發(fā)生,并在此后一個月內(nèi)逐漸播散。接下來的緊急工作包括確定可減少社區(qū)內(nèi)傳播的最有效控制措施。





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