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看看差距有多大,R語言edgeR差異表達分析

2023-04-21 09:48 作者:小云愛生信  | 我要投稿

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小伙伴們大家好啊,小果今天給大家?guī)淼氖遣町惐磉_分析,小果覺得,雖然差異表達分析的方法已經(jīng)很多了,但多掌握一項總是好的,今天小果給大家?guī)淼氖莈dgeR的用法。


#關(guān)于exactTest的pair參數(shù),兩個組的順序決定了logFC的正負,按照這個順序,計算時middle組除以big,再求log2的值,如果是正的,就說明相對于big組,middle組發(fā)生了上調(diào)。

exactTest的幫助文檔原文如下


這樣就能得到我們的結(jié)果了,包括log2FC,P值等,這些都是篩選關(guān)鍵基因的重要指標。

好了,今天的內(nèi)容就是這樣了,小伙伴們有什么問題歡迎來和小果討論。


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