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機(jī)器學(xué)習(xí)模型被廣泛使用，并且在分類或回歸任務(wù)中有各種應(yīng)用。由于計(jì)算能力的提高、新數(shù)據(jù)源和新方法的可用性，ML?模型越來越復(fù)雜。使用增強(qiáng)、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)裝袋等技術(shù)創(chuàng)建的模型是真正的黑匣子。很難追蹤輸入變量和模型結(jié)果之間的聯(lián)系。它們因高性能而被使用，但缺乏可解釋性是它們最弱的方面之一。DALEX是R語言通用機(jī)器學(xué)習(xí)包之一，就是為了解決分類和回歸問題的數(shù)據(jù)訓(xùn)練而創(chuàng)建的一個(gè)綜合工具包。是一系列函數(shù)的集合，它試圖對(duì)創(chuàng)建預(yù)測(cè)模型的過程進(jìn)行流程化。它是一個(gè)包含了數(shù)據(jù)分割、預(yù)處理、特征選擇、用重抽樣進(jìn)行模型調(diào)參和變量重要性估計(jì)等分析的強(qiáng)大工具。

使用方法：

Rscript?DALEX.R????-input=?

參數(shù)說明：

USAGE:

DALEX.R?-input=<input>

PARAMETERS:

-input???the?expression?data,the?first?column?is?sample?name,the?second??column?is?group,the?third?column?is?gene?symbol,input?txt?format.

操作步驟：

1、打開命令行界面，輸入“Rscript?DALEX.R”調(diào)閱幫助文檔，確定該程序所需的輸入文件。

2、用戶根據(jù)幫助文檔中的參數(shù)說明內(nèi)容，對(duì)參數(shù)進(jìn)行設(shè)置。這里，必須輸入參數(shù)有1個(gè)，分別是-input，表示表達(dá)數(shù)據(jù)，第一列是樣本名稱，第二列是分組，第三列是基因符號(hào)，輸入txt格式。

3、完成參數(shù)提交后，按下回車鍵，整個(gè)程序即正式開始進(jìn)入執(zhí)行。每步執(zhí)行內(nèi)容都會(huì)給出提示。程序執(zhí)行完畢后，界面會(huì)顯示”Program?execution?is?completed<span data-raw-text="" "="" data-textnode-index-1662356065774="13" data-index-1662356065774="720" class="character" style="margin: 0px; padding: 0px;">"結(jié)束語。

流程圖：

結(jié)果展示：

1.?ft1.pdf

2.?ft2.pdf

3.?ft3.pdf

4.?ft4.pdf

特別說明：本代碼經(jīng)申請(qǐng)軟件著作權(quán)，僅轉(zhuǎn)讓使用權(quán)，不轉(zhuǎn)讓所有權(quán)

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寫在文末：

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