1、在質(zhì)譜圖譜如何確定單一同位素峰和平均同位素峰？
在分辨率低的質(zhì)譜圖譜上，所顯示的峰一般是平均同位素峰。但目前常用的質(zhì)譜方法（如 MALDI-TOF）的分辨率都很高，一般的小分子（如肽段）常含有4-5個同位素峰，其中分子量最小的是單一同位素峰。當(dāng)用質(zhì)譜檢測大分子（比如完整蛋白質(zhì)）時，同位素峰的數(shù)目很多，難以在圖譜上區(qū)分。在這種情況下，使用平均同位素峰會更有意義。

2、 同位素峰之間一定是相差1Da嗎？
同位素肽段的質(zhì)量（m）一般相差1Da，但因為質(zhì)譜檢測到的峰是肽段的質(zhì)荷比（m/z），而不是質(zhì)量本身，所以在肽段帶有多個電荷的情況下，其質(zhì)荷比相差要小于 1。如果檢測到的肽段帶一個電荷，同位素峰之間就相差1；如果檢測到的肽段帶2個電荷，同位素峰之間便相差0.5；如果檢測到的肽段帶3個電荷，那同位素峰之間便差0.33；以此類推。所以從同位素峰之間的間距，可以推斷出肽段的帶電情況(z)，從而推斷出肽段的單一同位素質(zhì)量[(m/z)*z]。

3、 單一同位素峰一定是最高的峰嗎？

單一同位素峰一定是一組峰里面質(zhì)荷比最低的，但不一定是最高的。當(dāng)肽段的分子量較小時，其所含的原子總數(shù)也少，所以整個肽段含有同位素原子的幾率也比較小。這時，單一同位素峰往往是最高的峰。當(dāng)肽段的分子量增大時，其帶有同位素原子的幾率也隨之增大。在這種情況下，+1Da，甚至+2Da的同位素峰也有可能成為最高峰。統(tǒng)計結(jié)果表明，當(dāng)肽段分子量超過2500Da時，最高峰往往不是單一同位素峰。