黑暗浮士德，突然出現(xiàn)于姬矢準(zhǔn)面前并且說“自己是奈克賽斯的影子，吞噬光明的無止境的黑暗”的黑暗奧特巨人。

就像自己所說的那樣，黑暗浮士德有著與奈克賽斯相同的能力，戰(zhàn)斗能力與奈克賽斯互角，但防御力相對(duì)較弱，如果在戰(zhàn)斗中遭到意外攻擊時(shí)就會(huì)立即撤退。另外，黑暗浮士德胸口的計(jì)時(shí)器和奈克賽斯的「核心計(jì)時(shí)器」有相同的功能，平時(shí)是黑色狀態(tài)，在受到重傷就會(huì)變?yōu)榧t色并閃爍警報(bào)。

黑暗浮士德的真身是孤門一輝的戀人的齋田莉子。她和孤門相遇后，當(dāng)晚就被溝呂木真也操縱的諾斯菲爾所殺害，她被認(rèn)為是“他操縱的人偶”，在無意識(shí)的時(shí)候變身成浮士德和奈克賽斯進(jìn)行戰(zhàn)斗。

黑暗浮士德和奈克賽斯一樣，適能者/人間體在變身前受傷的地方，對(duì)傷害抵抗特別弱；變身成黑暗巨人后所受的傷，在變身解除后也殘存在適能者/人間體身上。第9話中，黑暗浮士德就曾因被奈克賽斯擊中齋田莉子在變身前受的腿傷處，疼痛難忍而立即撤退。

第12話的最后一戰(zhàn)中，異生獸諾斯菲爾的利爪即將擊中孤門時(shí)，莉子的意識(shí)因?yàn)楣麻T的呼喚恢復(fù)，黑暗浮士德為了保護(hù)孤門而挺身為他擋住了這一擊，被諾斯菲爾的攻擊刺穿了后背原本被十字光線·風(fēng)暴打傷的部位，從而受到致命的重創(chuàng)，莉子變回人形后化作光粒子消散死亡。

第一個(gè)出現(xiàn)的黑暗適能者。

在孤門一輝加入夜襲隊(duì)的半年前被溝呂木真也（黑暗梅菲斯特）殺死，然后被溝呂木以黑暗力量做成了一個(gè)受他操縱的人偶，成為了黑暗浮士德。

莉子在保留有自我意識(shí)的情況下是莉子，失去意識(shí)后就會(huì)變成浮士德。

在第12話，黑暗浮士德和奈克賽斯展開了最后的決戰(zhàn)，在奈克賽斯即將落敗、異生獸諾斯菲爾的利爪快打中孤門時(shí)，莉子的意識(shí)因?yàn)楣麻T的呼喚覺醒，莉子為了保護(hù)孤門而挺身為他擋住了這一擊，被諾斯菲爾的利爪貫穿后背（原設(shè)定是直接攻擊），莉子變回人形之后以光的形式消失了。

黑暗梅菲斯特（Dark Mephisto），在黑暗浮士德之后出現(xiàn)在奈克賽斯和夜襲隊(duì)面前的黑暗巨人，也是浮士德的指揮者。能從雙手手腕的梅菲斯特腕部發(fā)射各種各樣的光線技能遠(yuǎn)程射擊敵人，也擅長近身格斗戰(zhàn)；右手的梅菲斯特武裝還能伸出梅菲斯特爪在近身格斗戰(zhàn)中發(fā)揮出更加強(qiáng)大的戰(zhàn)斗力。黑暗梅菲斯特對(duì)奈克賽斯抱有異常的敵對(duì)心，第14話格斗對(duì)戰(zhàn)奈克賽斯·奧特曼幼年形態(tài)互角。戰(zhàn)斗力黑暗浮士德以上、同等奈克賽斯青年形態(tài)。

與溝呂木真也合體的時(shí)候，黑暗梅菲斯特自稱是“溝呂木期待的自己”。黑暗梅菲斯特使用各種手段，不斷折磨已經(jīng)遍體鱗傷的奈克賽斯。第24話與姬矢準(zhǔn)的最后一戰(zhàn)中，奈克賽斯被超級(jí)百萬切斯特補(bǔ)充了能量以后，自己就被奈克賽斯逐漸壓制，之后雙方用必殺技進(jìn)行激烈對(duì)拼，最后被奈克賽斯使出全力的青年拳擊徹底打敗。

第32話登場(chǎng)的時(shí)候，取回人心的溝呂木真也用意志力吸收周圍的光進(jìn)行變身成為黑暗梅菲斯特。與黑暗梅菲斯特二代的戰(zhàn)斗中一邊承受致命傷的痛苦，一邊封鎖其行動(dòng)，要求奈克賽斯攻擊自己和黑暗梅菲斯特二代。黑暗梅菲斯特最終被弓箭光線·風(fēng)暴的攻擊波及而消失。

瀕死狀態(tài)的溝呂木找回原來的自己，在與西條凪敞開心扉對(duì)話后死亡。用意志力變身的時(shí)候，溝呂木臉部裂開飛出梅菲斯特，不是平時(shí)的紫色漩渦，成為接近奈克賽斯的金色漩渦。

從黑暗梅菲斯特右手的「梅菲斯特武裝」中延伸出的鉤爪武器，除了用于近戰(zhàn)攻擊外，還能發(fā)射出「梅菲斯特射擊」等破壞光線技。

原夜襲隊(duì)副隊(duì)長，當(dāng)時(shí)是夜襲隊(duì)最優(yōu)秀的異生獸獵手。曾在夢(mèng)中見到了奈克賽斯的遺跡，在故事開始的1年前和黑暗梅菲斯特合體。進(jìn)行殘忍的死亡游戲，折磨著夜襲隊(duì)和奧特曼，企圖奪取奈克賽斯·奧特曼的光使自己更強(qiáng)進(jìn)而支配世界。

在終焉之地被奈克賽斯青年形態(tài)擊敗后，溝呂木失去了記憶，恢復(fù)記憶后也知道自己只是未知之手的一個(gè)棋子，為了贖罪使用光明的力量變身成黑暗梅菲斯特一代，舍身支援奈克賽斯消滅了黑暗梅菲斯特二代，但因?yàn)閭麆?shì)過重，溝呂木真也和西條凪敞開心扉對(duì)話后死亡。

黑暗梅菲斯特二代（Dark Mephisto Zwei），是記憶警察三澤廣之被黑暗扎基（石堀光彥）拖入了黑暗后變身的黑暗巨人，和溝呂木變身的黑暗梅菲斯特有相同的能力，飛行能力和奈克賽斯奧特曼藍(lán)色青年形態(tài)同等，實(shí)力在奈克賽斯藍(lán)色青年形態(tài)和黑暗梅菲斯特一代之上。

黑暗梅菲斯特二代的外貌與黑暗梅菲斯特一代相同，不過在情緒高漲的時(shí)候眼睛會(huì)突然變成紅色。

第32話登場(chǎng)，被未知之手（石堀光彥）的黑暗力量操縱的MP的三澤廣之用黑暗進(jìn)化者變身出現(xiàn)的身姿。讓藍(lán)色青年形態(tài)奈克賽斯陷入苦戰(zhàn)，不過被取回人心的溝呂木變身的黑暗梅菲斯特一代支援（雖然二代強(qiáng)于一代，但一代的戰(zhàn)斗經(jīng)驗(yàn)和格斗技術(shù)穩(wěn)壓二代，因而二代處于下風(fēng)），但二代戰(zhàn)術(shù)頭腦很厲害，在針對(duì)黑暗梅菲斯特一代變身前受的兩處致命傷進(jìn)行攻擊后使形勢(shì)逆轉(zhuǎn)，更以梅菲斯特爪給梅菲斯特一代造成致命傷害，但是他的攻擊行動(dòng)也被黑暗梅菲斯特一代舍命控制住，最后被奈克賽斯·奧特曼用弓箭光線·風(fēng)暴消滅。

從黑暗梅菲斯特右手的「梅菲斯特武裝」中延伸出的鉤爪武器，除了用于近戰(zhàn)攻擊外，還能發(fā)射出「梅菲斯特射擊」等破壞光線技。

黑暗梅菲斯特的第二位適能者，原是MP（記憶警察）的一員。在溝呂木真也被姬矢準(zhǔn)擊敗后，三澤廣之被未知之手（石堀光彥）選中并拖入黑暗，得到了溝呂木被剝奪的黑暗力量，代替溝呂木成為新的黑暗梅菲斯特，稱作黑暗梅菲斯特二代。三澤廣之偷襲打傷了溝呂木真也，并在和奈克賽斯戰(zhàn)斗壓制了對(duì)方的藍(lán)色青年形態(tài)，欲將奈克賽斯的光能量吸收殆盡，但被黑暗梅菲斯特一代牽制，最后遭到奈克賽斯的弓箭光束·風(fēng)暴擊殺，作為黑暗適能者的三澤廣之也一同被消滅。

身高：50米

體重：5萬5千噸

“未知的手”的原形，邪惡的黑暗破壞神。來到地球以后，以石崛的身體為掩飾，等待著復(fù)活的時(shí)機(jī)。陸續(xù)發(fā)出“扎基來托寧古”等光線技能，和諾亞正相反的特征，也有“黑暗的諾亞”別名。是原始的“來訪者”們，模仿解救了他們的光之巨人的樣子制作的對(duì)付異生獸的終極兵器“扎基”?？墒?，由于邪惡思想的覺醒造成失控，自行進(jìn)化，還改造和復(fù)活了本該被消滅的異生獸?！皝碓L者”們?yōu)榱说钟耐{，最終決定親自炸毀自己的母星。那就是M80天蝎座球狀星云超新星爆炸的真相。

黑暗扎基的黑暗適能者。原名山岡一，是一名人類科學(xué)家。十八年前被來到地球的黑暗扎基使用憑依能力強(qiáng)行附身，并且連思想也被控制，更殺害了西條凪的父母。之后，黑暗扎基篡改了山岡一的所有相關(guān)資料，改名為“石堀光彥”，進(jìn)入夜襲隊(duì)內(nèi)臥底潛伏，等待自己復(fù)活的時(shí)機(jī)。

期間，制造了黑暗浮士德和黑暗梅菲斯特以及黑暗梅菲斯特二世。并引發(fā)了一系列的事件，利用了齋田莉子和溝呂木真也使齋田莉子和溝呂木真也成為了黑暗浮士德和黑暗梅菲斯特，在溝呂木真也戰(zhàn)敗后，把三澤廣之拖入了黑暗使三澤廣之成為了黑暗梅菲斯特二世，以及用12尊異生獸尸體進(jìn)行了融合成依組麥儒。吸收了西條凪的光重新并復(fù)活為黑暗扎基，最后被諾亞奧特曼徹底消滅，化作宇宙的塵埃。