2 去除INDEX和接頭

一般測序，每個(gè)樣本有獨(dú)特的INDEX，還有通用的接頭。需要與公司確認(rèn)好具體的建庫方式，INDEX序列，兩端接頭序列(注意方向），不然一不小心切錯(cuò)了都不知道...

#[待檢測]

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV --pair-filter=both -o sample1_cut_1.fq -p sample1_cut_2.fq sample1_1.fq sample1_2.fq

#注意更改INDEX序列，adapter方向