生物化學(xué)名詞解釋
1.酶的酸堿催化和共價催化
酸堿催化:通過瞬時的向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物中接受質(zhì)子以穩(wěn)定過渡態(tài),加速反應(yīng)的一類催化機制。
共價催化:又稱親核催化或親電子催化,在催化時,親和催化劑或親電子催化劑能分別放出電子或汲取電子并作用于底物的缺電子中心或負電中心,迅速形成不穩(wěn)定的共價中間復(fù)合物,降低反應(yīng)活化能,加速反應(yīng)。
2.鹽溶與鹽析
鹽溶:在蛋白質(zhì)水溶液中,加入少量的中性鹽,如硫酸鈉、氯化鈉等,會增加蛋白質(zhì)分子表面的電荷,增強蛋白質(zhì)分子與水分子的作用,從而使蛋白質(zhì)在水溶液中的溶解度增大。這種現(xiàn)象稱為鹽溶。
鹽析:是指在蛋白質(zhì)水溶液中加入中性鹽,隨著鹽濃度增大而使蛋白質(zhì)沉淀出來的現(xiàn)象。
3.肽鍵與酰胺平面
肽鍵:蛋白質(zhì)中前一氨基酸的α-羧基與后一氨基酸的α-氨基脫水形成的酰胺鍵。
酰胺平面:不能自由旋轉(zhuǎn),與肽鍵相關(guān)的六個原子共處于一個平面,此平面結(jié)構(gòu)被稱為酰氨平面或肽平面。
4.酶的專一性與立體異構(gòu)專一性
酶的專一性:是指酶對催化的反應(yīng)和反應(yīng)物有嚴(yán)格的選擇性。一種酶只能催化一種或一類十分相似的反應(yīng)。
立體異構(gòu)專一性:酶除了對底物分子的化學(xué)結(jié)構(gòu)有要求外,對其立體異構(gòu)也有一定的要求。
5.酶活力與酶比活力
酶活力:一個溶液中酶的總單位數(shù),代表酶量的多少
酶比活力:每毫克總蛋白中酶的單位數(shù)代表酶的純度。
6.抗體酶與核酶
抗體酶:又稱催化抗體,是一類具有催化能力的免疫球蛋白,即通過一系列化學(xué)與生物技術(shù)方法制備出的具有催化活性的抗體,它既具有相應(yīng)的免疫活性,又能像酶那樣催化某種化學(xué)反應(yīng)。
核酶:是具有催化功能的小分子RNA? ,屬于生物催化劑,可降解特異的mRNA序列。
7.基因組印記
基因組印記(Genomic imprinting):又稱遺傳印記,是通過生化途徑,在一個基因或基因組域上標(biāo)記其雙親來源信息的遺傳學(xué)過程
8.基因家族和基因簇
基因家族:是來源于同一個祖先,由一個基因通過基因重復(fù)而產(chǎn)生兩個或更多的拷貝而構(gòu)成的一組基因,它們在結(jié)構(gòu)和功能上具有明顯的相似性,編碼相似的蛋白質(zhì)產(chǎn)物, 同一家族基因可以緊密排列在一起,形成一個基因簇,但多數(shù)時候,它們是分散在同一染色體的不同位置,或者存在于不同的染色體上的,各自具有不同的表達調(diào)控模式。
基因簇:指基因家族中的各成員緊密成簇排列成大串的重復(fù)單位,位于染色體的特殊區(qū)域。
9.紅皇后假說
紅皇后假說:”由美國芝加哥大學(xué)進化生物學(xué)家范瓦倫(L. van Valen)于1973年根據(jù)《愛麗絲鏡中奇遇記》的故事提出的假說?!凹t皇后假說”描述了物種之間持續(xù)的演化競爭,其由美國芝加哥大學(xué)進化生物學(xué)家利·范·瓦倫提出,用以解釋他所觀察到的物種恒定滅絕風(fēng)險定律,即一個分類群的滅絕可能性,與其存在的時間長度沒有關(guān)系。?
10.構(gòu)型與構(gòu)象
構(gòu)型:是指分子中由化學(xué)鍵所固定的原子在空間的排列,這種排列是穩(wěn)定的。
構(gòu)象:是由分子內(nèi)單鍵的內(nèi)旋轉(zhuǎn)而產(chǎn)生的結(jié)構(gòu)異構(gòu)體。
11.底物的水平磷酸化與氧化磷酸化
底物水平磷酸化:底物分子中高能鍵斷裂釋放的自由能轉(zhuǎn)移到ATP中。
氧化磷酸化:伴隨著電子傳遞,同時氫離子進入內(nèi)外膜間隙,內(nèi)外膜間隙積累的氫離子通過F1F2-ATP合酶返回到線粒體基質(zhì),氫離子的轉(zhuǎn)移能夠驅(qū)動ATP的合成。
12.等電點與等離子點
等電點:等電點是兩性電解質(zhì)所帶電荷因溶液的PH值不同而改變,當(dāng)兩性電解質(zhì)正負電荷數(shù)值相等時,溶液的PH值既稱為該物質(zhì)的等電點。
等離子點:蛋白質(zhì)在純水中的帶電狀態(tài),沒有其他離子干擾完全由氫離子的解離和結(jié)合來決定,這種條件下的等電點稱為等離子點。
13.蛋白質(zhì)降解與 DNA 降解
蛋白質(zhì)降解:指食物中的蛋白質(zhì)要經(jīng)過蛋白質(zhì)降解酶的作用降解為多肽和氨基酸然后被人體吸收的過程。
DNA 降解:是DNA 分子中的堿基和戊糖間的氮糖苷鍵發(fā)生水解, 使DNA鏈發(fā)生斷裂。
14.蛋白質(zhì)變性與 DNA 變性
蛋白質(zhì)變性:受物理或化學(xué)因素的影響,改變其分子內(nèi)部結(jié)構(gòu)和性質(zhì)的作用。
DNA變性:指核酸雙螺旋堿基對的氫鍵斷裂,堿基間的堆積力遭到破壞,雙鏈變成單鏈,使核酸的天然構(gòu)象和性質(zhì)發(fā)生改變,但不涉及其一級結(jié)構(gòu)的改變。
15.蛋白質(zhì)功能域和結(jié)構(gòu)域
結(jié)構(gòu)域:介于超二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)之間,多肽鏈在超二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進一步盤繞折疊,形成緊密的近乎于球狀的結(jié)構(gòu),稱為結(jié)構(gòu)域。
功能域:是蛋白質(zhì)分子中能獨立存在的功能單位。功能域可以是一個結(jié)構(gòu)域,也可是由兩個結(jié)構(gòu)域或兩個以上的結(jié)構(gòu)域組成。
16.蛋白質(zhì)變性與蛋白質(zhì)降解
蛋白質(zhì)變性:蛋白質(zhì)在受到物理、化學(xué)因素影響時,生物活性喪失,溶解度降低,不對稱性增多以及其他物理化學(xué)常數(shù)的變化。
蛋白質(zhì)降解:指食物中蛋白質(zhì)經(jīng)過蛋白質(zhì)降解酶的作用,降解為多肽和氨基酸,然后被人體吸收的過程。
17.蛋白酶、核酸酶和抗體酶
蛋白酶:可以水解蛋白質(zhì)肽鍵的酶。
核酸酶:催化核酸酯鍵水解的酶。
抗體酶:具有酶活性的抗體。
18.單克隆抗體與多克隆抗體
單克隆抗體:有同一B淋巴細胞在應(yīng)答同一種抗原時合成并分泌的抗體,均一,只識別抗原的同一表位。
多克隆抗體:多個不同的B淋巴細胞在應(yīng)答同一種抗原時,產(chǎn)生的可特異性結(jié)合該抗原不同表位的抗體混合物,這些抗體分子的組成之間存在一定差異。
19.單一蛋白質(zhì)和綴合蛋白質(zhì)
單一蛋白質(zhì):簡單蛋白質(zhì)是水解后只產(chǎn)生氨基酸而不產(chǎn)生其他物質(zhì)的蛋白質(zhì)。
綴合蛋白質(zhì): 結(jié)合蛋白質(zhì)的分子中除氨基酸組分之外,還含有非氨基酸物質(zhì),后者稱為輔因子,二者以共價或非共價形式結(jié)合,往往作為一個整體從生物材料中被分離出來。
20.RNA世界假說
RNA世界假說:是科學(xué)依據(jù)多年的科學(xué)研究而提出的一條關(guān)于生命科學(xué)的理論。
21.DNA 主帶與衛(wèi)星帶
DNA主帶:密度離心中由一個寬峰度組成,不包括可見的衛(wèi)星DNA組成的分離條帶。
衛(wèi)星帶:真核生物基因組DNA含有大量重復(fù)序列,在CsCl2密度梯度離心時,除主帶外還得到量較少的次帶,即衛(wèi)星帶。它由一些短的高度重復(fù)序列組成,因其堿基組成與DNA的主要部分不同,浮力密度也就不同。
22.抗體酶和核酶
抗體酶:又稱催化抗體,是一類具有催化能力的免疫球蛋白,即通過一系列化學(xué)與生物技術(shù)方法制備出的具有催化活性的抗體,它既具有相應(yīng)的免疫活性,又能像酶那樣催化某種化學(xué)反應(yīng)。
核酶:是具有催化功能的小分子RNA? ,屬于生物催化劑,可降解特異的mRNA序列。
23.別構(gòu)酶的 S 形曲線與表觀雙曲線
別構(gòu)酶的 S 形曲線:正協(xié)同效應(yīng)中酶結(jié)合底物或調(diào)節(jié)物后,酶構(gòu)象改變,親和力增加,速度變快,呈現(xiàn)S型曲線。
別構(gòu)酶的表觀雙曲線:負協(xié)同效應(yīng)中在底物濃度較低的范圍內(nèi),酶活力上升快,隨后底物濃度上升,但速率上升很低,呈現(xiàn)表觀雙曲線。
24.Km 、Ks、Tm 、 Ta 與Cot1/2?
Km:是酶的一個特征性常數(shù),是當(dāng)酶反應(yīng)速率達到最大反應(yīng)速率一半時的底物濃度。只與酶的性質(zhì)有關(guān),與酶濃度無關(guān)。
Ks:指不透明物質(zhì)的深度值,它是一個經(jīng)驗值,也是一個相對值。是酶和底物所形成中間產(chǎn)物ES的解離平衡常數(shù)。
Tm:溶解溫度,在DNA熱變性過程中,引起DNA物化性質(zhì)改變一半時的溫度。不同序列的DNA,Tm值不同。DNA中G-C含量越高,Tm值越高,成正比關(guān)系。
Ta:退火溫度,是指引物和模板結(jié)合時候的溫度參數(shù),當(dāng)50%的引物和互補序列表現(xiàn)為雙鏈DNA分子時的溫度。
Cot1/2(半變Cot值):DNA初始濃度(Co)與復(fù)性完成一半時的時間的答乘積。反應(yīng)完內(nèi)成一半時所需的Cot值,它直接與復(fù)性DNA 成正比容。
25.DNA 的二級結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)
DNA的二級結(jié)構(gòu):DNA的二級結(jié)構(gòu)是指兩條多核苷酸鏈反向平行盤繞所生成的雙螺旋結(jié)構(gòu)。
蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)是指蛋白質(zhì)多肽鏈中主鏈原子的局部空間排列即構(gòu)象,不涉及側(cè)鏈部分的構(gòu)象。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的基本形式:α—螺旋結(jié)構(gòu)和β—片層結(jié)構(gòu)。
26.茚三酮反應(yīng)和雙縮脲反應(yīng)
茚三酮反應(yīng):茚三酮在弱堿性溶液中與氨基酸共熱,引起氨基酸脫氨、脫羧反應(yīng),最后于還原茚三酮發(fā)生作用,生成紫色物質(zhì)。
雙縮脲反應(yīng):雙縮脲是由兩分子尿素縮合而成的化合物,將尿素加熱到180度,則兩分子尿素縮合成一分子雙縮脲,并放出一分子氨.雙縮脲在堿性溶液中能與硫酸銅反應(yīng)產(chǎn)生紅紫色絡(luò)合物,此反應(yīng)稱為雙縮脲反應(yīng)。
27.輔酶與輔基
輔酶:是一大類有機輔助因子的總稱,是酶催化氧化還原反應(yīng)、基團轉(zhuǎn)移和異構(gòu)反應(yīng)的必須因子。它們在酶催化反應(yīng)中承擔(dān)傳遞電子、原子或基團的功能。輔酶也可以被視為第二底物,因為在催化反應(yīng)發(fā)生時,輔酶發(fā)生的化學(xué)變化與底物正好相反。
輔基:酶的輔因子或結(jié)合蛋白質(zhì)的非蛋白部分,與酶或蛋白質(zhì)結(jié)合的非常緊密,用透析法不能除去。按照化學(xué)組成,酶可以分為簡單蛋白質(zhì)和結(jié)合蛋白質(zhì)兩大類。
28.酶的活性中心和別構(gòu)效應(yīng)
酶的活動中心:是指酶分子中結(jié)合底物并起催化作用的少數(shù)氨基酸殘基形成的一定空間結(jié)構(gòu),包括底物結(jié)合部位和催化部位。
酶的別構(gòu)效應(yīng):酶分子的費催化部位(調(diào)節(jié)部位)與某些化合物產(chǎn)生非共價可遞結(jié)合,導(dǎo)致酶分子構(gòu)想發(fā)生改變,從而改變酶的活性狀態(tài)的現(xiàn)象。
29.親和層析與疏水相互作用層析
親和層析:利用生物分子與配基建具有轉(zhuǎn)義而不可逆的親和力使生物分子分離純化的方法。
疏水相互作用層析:是利用表面偶聯(lián)弱疏水性基團(疏水性配基)的疏水性吸附劑為固定相,根據(jù)蛋白質(zhì)與疏水性吸附劑之間的弱疏水性相互作用的差別進行蛋白質(zhì)類生物大分子分離純化的一種層析法。