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美國新藥研發(fā)專家的抗疫日記(II)

2020-04-05 10:07 作者:返樸科普  | 我要投稿

撰文?| 史雋



3月25日周三MA累計確診?1838例

昨晚睡覺前聽到哥倫比亞大學著名流行病學家W. Ian Lipkin感染了新冠病毒的消息,非常震驚。

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?來源:NBC news

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Lipkin教授被稱為世界領(lǐng)先的“病毒獵人?(virus hunter)”。他還是史蒂文·索德伯格(Steven?Soderbergh)2011年的電影《傳染病》(Contagion)的首席科學顧問。

在2003年非典時期,他受中國科學家和政府官員的邀請來到中國,幫助制定了控制病毒傳播和減少感染的策略。2003年4月,他直接從患者的肺組織中測序出一段SARS冠狀病毒?(SARS-CoV-1)?的序列并且研發(fā)出了首個針對SARS冠狀病毒的敏感診斷測試。鐘南山院士就是在他的建議下,把非典定義為病毒感染,改變了國內(nèi)按細菌來治療的政策。


非典過后,他與中國的科學家和政府官員緊密合作,幫助中國加強公共衛(wèi)生體系。他幫助建立了上海的巴斯德研究所、北京的新國家疾病控制中心和廣州市生物醫(yī)學與健康研究所。


這次1月底2月初,他也去了中國。雖然不能去武漢,還是在廣州和北京呆了一段時間。


鐘南山院士和Lipkin教授在廣州機場 (來源:哥倫比亞大學官網(wǎng))

我記得很清楚,2月17日下班開車回家,聽到了美國電臺NPR對他的采訪。那是他回到紐約,在家隔離的最后一天。采訪里他說:新冠病毒和SARS病毒一樣,起源于野生動物;測序結(jié)果表明它可能來自蝙蝠,通過某種中間宿主,可能是小型哺乳動物,傳染到人。他還強調(diào)了,目前沒有證據(jù)證明這種病毒可能起源于生物實驗室或者是某種生物武器。


他認為當前最重要的事情是研發(fā)一個靈敏的檢測方法,可以找出無癥狀感染者,而不是用輻射很大的CT來檢測病人。這樣才能有效的控制擴散。


現(xiàn)在的大多數(shù)測試只能用于已經(jīng)生病并出現(xiàn)癥狀的患者,只有這類患者才能測得準確結(jié)果。


就在3月19日,Lipkin教授的團隊宣布研發(fā)出了一個敏感的測試方法,可以檢測到無癥狀或者輕癥狀COVID-19患者體內(nèi)的少量病毒。重要的是,這種被稱為C3?(CII COVID-19Coronavirus Assay)?的新測試可以減少假陰性和假陽性率,不僅減少了不知不覺傳播病毒的人的數(shù)量?(假陰性),而且減少了不必要的醫(yī)療資源浪費?(假陽性,即隔離或治療因其他原因生病的人)??上г摐y試雖然靈敏,但目前僅限于研究使用,還沒有大規(guī)模用于排查。


最小化假陰性率對于控制疾病傳播至關(guān)重要。這個新檢測法對新冠病毒的特異性很高,不會與其他病毒發(fā)生交叉反應,從而導致假陽性,導致不必要地隔離患者。


他認為目前控制疫情最好的工具是隔離?(isolation)?和限制?(confinement)。

來源:China Daily

Lipkin教授在接受采訪的時候說:“如果我會感染新冠病毒,那么誰都有可能會感染?!?br/>


If it can hit me, it can hit?anybody.?That’s the message I want to convey.


1952年出生的Lipkin教授已經(jīng)68歲,希望他能早日康復。

馬薩諸塞州的確診人數(shù)突然增加了很多,似乎已經(jīng)進入指數(shù)增長期。州長宣布學校將一直關(guān)閉到5月4日。


FDA又緊急批準使用了兩個COVID-19診斷測試:


1)??由Mesa Biotech公司開發(fā)的手持式儀器 (見下圖)

2)??由BioMérieux的子公司BioFire與美國國防部合作開發(fā)的全自動檢測法,可以在約一個小時內(nèi)提供結(jié)果。


來源:FierceBiotech

https://www.fiercebiotech.com/medtech/fda-authorizes-hand-held-covid-19-diagnostic-test



同時,F(xiàn)DA也發(fā)警告提醒大家:

  • 消費者應謹慎購買或使用賣方聲稱有助于診斷、治療、治愈或預防COVID-19的產(chǎn)品。

  • 目前尚無FDA批準的預防或治療COVID-19的疫苗和藥物。

  • 使用欺詐性的產(chǎn)品可能會導致人們延遲或停止適當?shù)闹委?,并可能危及生命?/p>


來源:CNBChttps://www.cnbc.com/2020/03/25/fda-warns-consumers-against-fraudulent-coronavirus-tests-vaccines-and-treatments.html


3月26日周四

MA累計確診 2417例

Trump昨天發(fā)了一條twitter,說:“到目前為止,美國做的‘新冠病毒測試’已經(jīng)遠遠超過任何其他國家!實際上,在過去八天的時間里,美國進行的測試要比韓國(過去被認為是非常成功的測試的國家)在八周的時間內(nèi)做的測試更多?!?/p>


在之后的新聞發(fā)布會上,他又把這點說了好幾遍。


然而,總統(tǒng)做的比較并不科學。流行病學家做比較通常使用的是人均檢測率,測試的絕對數(shù)量不是很有意義。


盡管美國在冠狀病毒檢測的總數(shù)上超過了韓國,但鑒于美國人口是韓國的六倍多,因此美國的人均檢測量卻少得多。


截至昨天?(3月25日),根據(jù)韓國CDC的報告, 5100萬人口的韓國進行了357,896項新冠病毒測試。(數(shù)據(jù)來源:https://www.cdc.go.kr/board/board.es?mid=a20501000000&bid=0015)


相比之下,美國基本屬于各州自治,每個州單獨統(tǒng)計匯報自己的測試數(shù)據(jù),有幾個州不報告陰性結(jié)果數(shù)量或結(jié)果待定的測試數(shù)量,所以很難準確地統(tǒng)計美國到底有多少人接受了新冠病毒測試。


《大西洋》(The Atlantic)雜志的撰稿人Alexis Madrigal領(lǐng)導了一個有100多名成員的義工小組,匯總了各州政府網(wǎng)站和政府官員提供的數(shù)據(jù),匯報在Covid Tracking Project上。根據(jù)他們的統(tǒng)計,截至昨天?(3月25日), 3.29億人口的美國進行了至少418,810項新冠病毒測試。(數(shù)據(jù)來源:https://covidtracking.com/data/)


根據(jù)這些數(shù)據(jù),韓國的人均檢測率是1/142,而美國只有1/786。


要達到韓國測試的覆蓋面,美國還要測很多才夠。

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師兄發(fā)來他在超市買東西的照片,排隊結(jié)賬每人間隔至少2米,落實了媒體天天嘮叨的“social distancing”。

攝影 | 安德魯魚



3月27日周五

MA累計確診 3240例

FDA又緊急批準使用了一個新的檢測方法:由雅培?(Abbott)?公司開發(fā)的、目前最快的新冠病毒測試?(Abbott ID NOWCOVID-19 test),陽性結(jié)果5分鐘可以讀出,陰性結(jié)果13分鐘可以讀出,而且體積小巧便攜,幾乎可以在任何醫(yī)療環(huán)境中使用。


該技術(shù)基于雅培的ID Now平臺。這個平臺是美國目前最常用的即時檢驗儀器,全美大約有18,000多個這樣的重量不到7磅的小機子,廣泛用于檢測流感、鏈球菌性喉炎?(strep throat)?和呼吸道合胞病毒?(respiratory syncytial virus,一種引起感冒癥狀的常見病毒)。


上周,雅培公司的m2000 RealTime系統(tǒng)也獲得了美國FDA的緊急批準使用, 用于醫(yī)院和分子實驗室診斷感染。這個系統(tǒng)每周最多可以進行100萬次測試,但是需要的時間更長。


雅培公司計劃從4月1日開始每天提供50,000個ID Now測試,兩個系統(tǒng)加起來,每月至少提供500萬次測試。

ID Now系統(tǒng)是雅培公司2016年2月份收購的Alere公司開發(fā)的。其檢測原理是:將病人的鼻或咽拭子樣本與化學溶液混合,病毒破裂從而釋放RNA;將這個混合物插入ID Now系統(tǒng)中,通過等溫核酸擴增技術(shù)結(jié)合轉(zhuǎn)錄介導,可以定性測微量的RNA,擴增大約150堿基的小段,這一小段是新冠病毒的特異序列,不同于其他病毒。如果樣本里面有新冠病毒,擴增5分鐘以后就能產(chǎn)生足夠的信號,可以判斷為陽性。而如果擴增13分鐘以后仍然沒有信號可以判斷為陰性。


和師兄們研究了一晚上這背后的黑科技,最后還是有些細節(jié)不甚明白。感覺雖然速度快,但不如傳統(tǒng)的RT-PCR方法嚴謹,沒有一個很好的control來確保取樣過程可能會有的問題,假陰性率也會高一些。


但不可否認,即時臨檢?(Point-of-care testing)?在疫情大面積暴發(fā)的時候還是有很大的優(yōu)勢的。

雅培病毒檢測機 (來源:Abbott Laboratories雅培實驗室)




未完待續(xù)

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