CADD系列與AMBER分子動力學
計算機輔助藥物設計是通過計算機模擬、計算和預算藥物與受體生物大分子之間的關系,設計和優(yōu)化先導化合物的方法;近年來,計算機輔助藥物設計已經(jīng)取得一定成就,特別是在新冠肺炎爆發(fā)后,很多研究機構和企業(yè)采用計算機輔助藥物設計方法輔助進行了很多研究工作。在新型冠狀病毒的治療方案中,通過同源建模方法發(fā)布了新冠病毒的三維結構,通過藥物靶標預測、篩選出針對新型冠狀病毒的藥物,通過一系列計算機輔助藥物生物計算的方法發(fā)現(xiàn)一大類藥物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染,為治療新冠提供了新機理和新思路。
分子動力學模擬軟件應用廣泛、功能強大、用戶友好,能夠滿足幾乎所有常見的原子體系模擬需要。生物分子的結構動力學決定其生物學功能,而分子動力學模擬是研究其結構動力學的有效手段,因此采用分子模擬進行動力學計算分析從而指導進一步的實驗工作,預測理論結果。不論你從事生物學、藥學、生物醫(yī)學、計算化學或其他領域研究, 理解并實踐分子模擬都能給你一些新的的思考方式,增強你對新問題的分析力
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