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七千字經(jīng)驗(yàn)總結(jié)!組織樣本處理成單細(xì)胞懸浮液

2023-11-03 16:52 作者:南京福麥斯生物  | 我要投稿

一、摘要

原代組織是目前生物醫(yī)學(xué)相關(guān)科研領(lǐng)域重要的樣本來(lái)源,對(duì)其需進(jìn)行細(xì)胞外基質(zhì)降解和單細(xì)胞分離,包括組織解剖、機(jī)械解離和酶消化三個(gè)重要步驟,并希望得到更高的回收率和活力,以應(yīng)用于后續(xù)的流式或單細(xì)胞測(cè)序等分析。

1>>制備單細(xì)胞懸浮液的要求

1)快速

2)高活力

3)最少細(xì)胞碎片或聚集體

4)最大程度保持細(xì)胞表面抗原不被破壞

2>>制備單細(xì)胞懸浮液的基本步驟包括

A.切碎增加起始固體組織材料的表面積,以使組織和消化酶之間的接觸最大化

B.通過(guò)酶來(lái)消化細(xì)胞外基質(zhì)

C.切割細(xì)胞 - 細(xì)胞連接


二、組織的組成

一個(gè)完整的組織包括胞外基質(zhì),細(xì)胞和細(xì)胞膜表面的連接物將細(xì)胞和細(xì)胞之間互相鉚定。

1>>細(xì)胞外基質(zhì)

在整個(gè)生物體中,所有組織和器官都由被稱為細(xì)胞外基質(zhì)的非細(xì)胞成分包圍的細(xì)胞組成。細(xì)胞外基質(zhì)的功能是為組織提供支架和結(jié)構(gòu)支持,同時(shí)還在每個(gè)特定組織內(nèi)啟動(dòng)生物化學(xué)和生物力學(xué)提示。細(xì)胞外基質(zhì)由屬于三大類生物分子的成分組成:膠原蛋白,蛋白多糖和糖蛋白。

1)膠原蛋白是細(xì)胞外基質(zhì)中最豐富的纖維蛋白。因此,膠原蛋白是該基質(zhì)的主要結(jié)構(gòu)元素,提供拉伸強(qiáng)度和調(diào)節(jié)細(xì)胞粘附。膠原蛋白還通過(guò)支持趨化性和遷移同時(shí)指導(dǎo)組織發(fā)育來(lái)響應(yīng)細(xì)胞外基質(zhì)中的生化信號(hào)。

2)蛋白多糖是由與糖胺聚糖鏈結(jié)合的以蛋白質(zhì)為核心組成的生物分子。蛋白多糖在細(xì)胞外基質(zhì)中的作用包括組織基質(zhì)組裝,調(diào)節(jié)組織中細(xì)胞因子和生長(zhǎng)因子的信號(hào)傳導(dǎo),以及激活細(xì)胞表面受體以影響細(xì)胞和整個(gè)器官的功能和發(fā)育。在組織中發(fā)現(xiàn)的常見(jiàn)類型的蛋白多糖包括核心蛋白聚糖,多功能蛋白聚糖和透明質(zhì)酸。核心蛋白聚糖和多功能蛋白聚糖存在于整個(gè)生物體的所有組織中。在大多數(shù)組織中發(fā)現(xiàn)透明質(zhì)酸作為結(jié)構(gòu)組分和信號(hào)分子,但缺乏通常指示蛋白多糖的蛋白質(zhì)核心。許多其他類型的蛋白聚糖僅存在于整個(gè)生物體的特定組織類型中,本文不再進(jìn)行評(píng)述。

3)糖蛋白是由與碳水化合物基團(tuán)連接的多肽鏈組成的任何蛋白質(zhì)。在細(xì)胞外基質(zhì)中發(fā)現(xiàn)的一種常見(jiàn)糖蛋白是纖連蛋白,其通過(guò)與膠原蛋白,血小板反應(yīng)蛋白,整聯(lián)蛋白,纖維蛋白和糖胺聚糖結(jié)合而發(fā)揮結(jié)構(gòu)作用。通過(guò)積極調(diào)節(jié)相關(guān)細(xì)胞在粘附,分化,遷移,表型穩(wěn)定性和細(xì)胞凋亡抗性方面的行為,層粘連蛋白也有助于細(xì)胞外基質(zhì)的結(jié)構(gòu)。彈性蛋白是組織細(xì)胞外基質(zhì)中彈性纖維的主要成分,是這些纖維彈性的主要貢獻(xiàn)者。彈性蛋白通常存在于皮膚,肺,韌帶,肌腱和血管組織中。通常在細(xì)胞外基質(zhì)中發(fā)現(xiàn)的其他糖蛋白包括纖維蛋白原,原纖蛋白,纖維蛋白,肌腱蛋白,血小板反應(yīng)蛋白和軟骨寡聚復(fù)合蛋白。

2>>細(xì)胞膜

細(xì)胞膜是磷脂雙層,其作為圍繞細(xì)胞的疏水屏障,保護(hù)細(xì)胞內(nèi)部及其細(xì)胞器。細(xì)胞膜含有各種膜蛋白,這些蛋白在細(xì)胞的發(fā)育和存活中至關(guān)重要。受體蛋白促進(jìn)信號(hào)穿過(guò)細(xì)胞膜的傳遞,使細(xì)胞能夠響應(yīng)其環(huán)境中的線索,而嵌入細(xì)胞膜的通道和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白能夠通過(guò)主動(dòng)和被動(dòng)過(guò)程使特定離子進(jìn)入或離開(kāi)細(xì)胞。

酶蛋白也存在于整個(gè)細(xì)胞膜中,催化細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞周圍的化學(xué)反應(yīng)。消化酶的選擇和濃度對(duì)于從固體組織制備單細(xì)胞懸液進(jìn)行流式分析至關(guān)重要,因?yàn)榧?xì)胞表面受體或膜蛋白可被酶(如胰蛋白酶)的蛋白水解活性切割,在免疫表型分析實(shí)驗(yàn)中可能導(dǎo)致錯(cuò)誤的陰性結(jié)果。

3>>細(xì)胞 - 細(xì)胞連接

細(xì)胞 - 細(xì)胞連接是組織的主要結(jié)構(gòu)和功能組分,必須將其切割以制備單細(xì)胞懸液,用于流式分析。與制備單細(xì)胞懸浮液相關(guān)的三種主要類型的細(xì)胞 - 細(xì)胞連接是(i)封閉連接,(ii)連通連接,和(iii)錨定連接。封閉連接,通常稱為緊密連接,在內(nèi)皮細(xì)胞和上皮細(xì)胞的頂點(diǎn)附近保持連續(xù)的周向密封。這些連接點(diǎn)表現(xiàn)為與鄰近細(xì)胞的細(xì)胞膜明顯融合的一系列離散位點(diǎn)。緊密連接存在結(jié)構(gòu)變異,由跨膜蛋白組成,包括密蛋白,連接粘附分子家族蛋白,閉合蛋白,粘連蛋白和內(nèi)皮細(xì)胞選擇性粘附分子。緊密連接的功能是形成屏障,該屏障可以控制水和溶質(zhì)在細(xì)胞旁空間的運(yùn)動(dòng),同時(shí)還保持整個(gè)細(xì)胞膜中存在的離子通道,泵和載體蛋白的分布。通信連接通常稱為間隙連接,其功能是允許相鄰細(xì)胞之間的代謝物和離子的細(xì)胞質(zhì)交換。這些間隙連接由無(wú)脊椎動(dòng)物中的無(wú)脊椎連接蛋白和脊椎動(dòng)物中的連接蛋白組成,其中六種連接蛋白結(jié)合形成一個(gè)連接子。錨定連接包括粘附連接,橋粒和半橋粒,其作用是介導(dǎo)相鄰細(xì)胞之間的細(xì)胞粘附并轉(zhuǎn)移細(xì)胞內(nèi)信號(hào)。錨定連接由鈣粘蛋白組成,形成拉鏈狀結(jié)構(gòu),使相鄰細(xì)胞在組織內(nèi)穩(wěn)定粘附。


三、組織解離

1>>切碎組織

在從生物體中解剖出固體組織后,在引入消化酶之前,應(yīng)沖洗組織以清除任何血液或其他不需要的物質(zhì)。然后將組織切碎并用剪刀,手術(shù)刀或刀片分散,以增加總表面積。這增加了酶與組織表面之間的接觸,導(dǎo)致更有效和完全的消化,同時(shí)縮短了消化所需的時(shí)間。

2>>酶

組織將細(xì)胞保持在一起,由細(xì)胞外基質(zhì)和細(xì)胞 - 細(xì)胞連接點(diǎn)支持,這些細(xì)胞連接由多種蛋白質(zhì)和其他生物分子組成,這些分子需要特定的酶來(lái)適當(dāng)消化并從細(xì)胞懸浮液中除去。


第一類酶:分解細(xì)胞外基質(zhì)的酶1)分散酶(Dispase)是從細(xì)菌中分離的常用中性蛋白酶,對(duì)膠原蛋白IV和纖連蛋白具有高水平的酶特異性。分散酶可用于細(xì)胞集落的分離和組織塊分解成小塊細(xì)胞,因?yàn)樗梢郧懈罴?xì)胞和細(xì)胞外基質(zhì)之間的附著物,而不會(huì)影響細(xì)胞 - 細(xì)胞連接。然而,在用分散酶消化組織時(shí)應(yīng)該小心,因?yàn)樗軌蚯懈钐囟ǖ南嚓P(guān)表面分子或抗原,例如與T細(xì)胞分析相關(guān)的標(biāo)記。因此,如果觀察到表位缺失,則從消化緩沖液中省略分散可能是有幫助的。
2)膠原酶能夠破壞膠原蛋白中存在的肽鍵,有助于消化細(xì)胞外基質(zhì),使細(xì)胞釋放到懸浮液中。重要的是要注意純化的膠原酶比天然來(lái)自細(xì)菌的傳統(tǒng)膠原酶更有效,因?yàn)榧兓傅慕M成變化較小,增加了整個(gè)組織消化過(guò)程中細(xì)胞的穩(wěn)定性。
3)透明質(zhì)酸酶,細(xì)胞外基質(zhì)中的結(jié)構(gòu)蛋白多糖,可被在細(xì)菌和脊椎動(dòng)物生物體中產(chǎn)生的透明質(zhì)酸酶酶家族降解。這些透明質(zhì)酸酶切割透明質(zhì)酸的糖胺聚糖部分中存在的β1,4-糖苷鍵,有助于細(xì)胞外基質(zhì)的消化。
第二類酶:破壞細(xì)胞 - 細(xì)胞連接的酶1)胰蛋白酶是在脊椎動(dòng)物有機(jī)體的消化系統(tǒng)中合成的天然蛋白酶??捎糜诮到饧?xì)胞 - 細(xì)胞連接中存在的某些蛋白質(zhì),但缺點(diǎn)是破壞細(xì)胞膜蛋白;也會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞裂解,從而出現(xiàn)游離DNA誘導(dǎo)的細(xì)胞聚集。常不用胰蛋白酶制備來(lái)自固體組織的單細(xì)胞懸液用于流式細(xì)胞術(shù)實(shí)驗(yàn)。
2)木瓜蛋白酶是來(lái)自木瓜植物的替代蛋白酶。已知木瓜蛋白酶降解構(gòu)成細(xì)胞間緊密連接的蛋白質(zhì)。然而,與胰蛋白酶一樣,也會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞裂解,從而出現(xiàn)游離DNA誘導(dǎo)的細(xì)胞聚集。
第三類酶:脫氧核糖核酸酶(DNase),用于切割DNA骨架的磷酸二酯鍵
1)DNase的兩種主要類型是DNase-1和DNase-II,它們具有略微不同的酶功能。DNase-II不適合制備單細(xì)胞懸液,因?yàn)樗诘蛲鲋袇⑴c吞噬介導(dǎo)的DNA降解途徑。2)DNase-I適用于組織消化和單細(xì)胞懸浮液的制備,降解由死細(xì)胞裂解釋放的游離DNA而不引發(fā)凋亡,來(lái)防止細(xì)胞聚集。氯化鈣(CaCl2)充當(dāng)DNase-1的酶活化劑,因此在酶消化過(guò)程中被引入消化混合物中。鈣離子(Ca2 +)與DNase-I酶緊密結(jié)合,以穩(wěn)定其活性構(gòu)象,并允許游離DNA的正常降解。
第四類:開(kāi)發(fā)并優(yōu)化的商品化產(chǎn)品1)Accutase是一種蛋白酶和膠原酶混合物,模仿胰蛋白酶和膠原酶的作用,但其濃度遠(yuǎn)低于使用標(biāo)準(zhǔn)酶時(shí)所需的濃度。Accutase含有具有蛋白水解,膠原水解和DNase活性的酶的混合物,與使用類似酶的混合物進(jìn)行組織消化相比,產(chǎn)生更高的總細(xì)胞產(chǎn)量和改善的總抗原保存。2)TrypLE是另一種酶混合物,含有純化的重組酶,模擬胰蛋白酶的活性而不改變細(xì)胞表面抗原的表達(dá)。該產(chǎn)品避免了胰蛋白酶在組織消化中使用時(shí)出現(xiàn)的問(wèn)題,并且改善細(xì)胞存活和更有效的單細(xì)胞懸浮液制備。

3>>酶和機(jī)械解離基于所使用的酶混合物,通過(guò)將消化混合物引入切碎的固體組織并在特定溫度下孵育來(lái)進(jìn)行酶解離。酶可以是溫度特異性的,因此在給定溫度下以最高速度和效率工作,通常為37℃,也可以在4℃或冰上進(jìn)行,取決于特定的酶。較低的溫度可能會(huì)降低酶的反應(yīng)速度并延長(zhǎng)酶解時(shí)間,但可以幫助減少細(xì)胞死亡。當(dāng)選擇消化混合物用于制備用于流式分析的單細(xì)胞懸液時(shí),酶強(qiáng)度和酶濃度是兩個(gè)最重要的考慮因素。具有高強(qiáng)度或高濃度的酶可能損害細(xì)胞上存在的細(xì)胞表面標(biāo)志物,這可能影響這些標(biāo)志物的可用性和細(xì)胞在進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)中的活力。因此,應(yīng)使用溫和的酶、短消化時(shí)間來(lái)分離輕度貼壁細(xì)胞如淋巴細(xì)胞。確定用于酶促解離的酶的最佳強(qiáng)度和濃度對(duì)于細(xì)胞的適當(dāng)分離和組織的成功消化是經(jīng)驗(yàn)性的和關(guān)鍵的。在整個(gè)酶促解離過(guò)程中,需機(jī)械解離輔助。在軌道振蕩器上進(jìn)行酶消化有助于細(xì)胞從細(xì)胞外基質(zhì)釋放到懸浮液中。在酶促解離后,應(yīng)過(guò)濾懸浮液以排除未消化的組織塊或聚集體。


四、評(píng)估單個(gè)細(xì)胞懸浮液

評(píng)估從固體組織獲得的單細(xì)胞懸浮液的質(zhì)量是流式細(xì)胞術(shù)實(shí)驗(yàn)之前需采取的重要步驟。評(píng)估固體組織的酶促和機(jī)械解離后的三個(gè)關(guān)鍵參數(shù)(i)細(xì)胞活力(ii)細(xì)胞碎片

(iii)聚集體

使用臺(tái)盼藍(lán)細(xì)胞活力排除測(cè)定法可以輕松測(cè)定單細(xì)胞懸浮液中的細(xì)胞活力,其中死細(xì)胞將臺(tái)盼藍(lán)吸收到其細(xì)胞質(zhì)中,而活細(xì)胞保留其選擇性滲透膜并防止臺(tái)盼藍(lán)進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)。然后可以使用光學(xué)顯微鏡評(píng)估單細(xì)胞懸浮液中活細(xì)胞和死細(xì)胞的相對(duì)量。還可以使用光學(xué)顯微鏡快速評(píng)估細(xì)胞碎片和細(xì)胞聚集體。也強(qiáng)烈建議在流式細(xì)胞儀上評(píng)估單細(xì)胞制備質(zhì)量,核染色DRAQ5將區(qū)分完整細(xì)胞與細(xì)胞碎片,活力染料PI將允許定量死細(xì)胞的百分比。


五、去除細(xì)胞碎片和死細(xì)胞

將組織處理成單細(xì)胞懸浮液的過(guò)程中,有些細(xì)胞會(huì)自然死亡或由酶促和機(jī)械解離引起的損傷而死亡。高細(xì)胞活力應(yīng)該是每次組織消化的重要目標(biāo),可使用商品化試劑盒來(lái)去除細(xì)胞碎片和死細(xì)胞。這些試劑盒可從Miltenyi Biotec Inc.(Auburn,CA)和STEMCELL Technologies Inc.(Cambridge,MA)等供應(yīng)商處獲得,是使用磁珠和特異性結(jié)合緩沖液來(lái)標(biāo)記細(xì)胞碎片,死細(xì)胞或垂死細(xì)胞,通過(guò)磁分離負(fù)選的方式僅保留活細(xì)胞。


六、單細(xì)胞懸浮液的冷凍保存

涉及功能測(cè)定的流式細(xì)胞術(shù)實(shí)驗(yàn)應(yīng)在制備單細(xì)胞懸液后不久或在冷凍保存的活細(xì)胞上進(jìn)行。
1>>應(yīng)測(cè)試?yán)鋬霰4鎸?duì)細(xì)胞活力和功能的潛在影響

2>>多聚甲醛的溫和固定:

? a.對(duì)一定時(shí)間后分析的樣品,避免在冷凍保存期間改變抗原的表達(dá)或存在。? b.固定可能會(huì)改變蛋白質(zhì)構(gòu)象影響抗原性,需評(píng)估抗體識(shí)別是否會(huì)改變。? c.固定保持細(xì)胞的物理穩(wěn)定,同時(shí)防止新死細(xì)胞的碎裂。? d.保留異質(zhì)細(xì)胞群重要的光散射特性,并有助于防止細(xì)胞粘在一起或粘在染色時(shí)使用的板或管壁上。對(duì)脆性/異質(zhì)性群體如肺單細(xì)胞尤其重要。? e.應(yīng)在固定前對(duì)細(xì)胞染色如FVS系列的活/死染料,以便在數(shù)據(jù)分析過(guò)程中區(qū)分這兩種群體。


七、總結(jié)影響因素

相關(guān)處理過(guò)程:

1)與從新鮮組織中分離細(xì)胞相比,冷凍組織會(huì)降低總細(xì)胞回收率。表3中肺組織在解剖后和消化之前在-80℃下儲(chǔ)存72小時(shí),顯示細(xì)胞回收率降低和細(xì)胞活力降低。因此,在可能的情況下,從新鮮組織中分離和處理細(xì)胞是最佳實(shí)踐。

2)使用組織勻漿器的強(qiáng)力機(jī)械解離不適合制備單細(xì)胞懸浮液,因?yàn)樗炊a(chǎn)生細(xì)胞和組織成分的肉湯,可用于分離蛋白質(zhì)用于其他分析方法。當(dāng)使用該方法時(shí),細(xì)胞活力或完整性遭到破壞,應(yīng)避免使用組織勻漿器獲得單細(xì)胞懸浮液。表3中的數(shù)據(jù)顯示使用組織勻漿器代替切碎組織導(dǎo)致細(xì)胞產(chǎn)量和活力降低。

3)細(xì)胞碎片在離心過(guò)程中會(huì)因?yàn)閼腋≡谏锨逡褐斜晃邅G棄,和實(shí)際含量產(chǎn)生有較大偏差,尤其是針對(duì)組織勻漿的樣本。

4)渦旋細(xì)胞是另一種強(qiáng)有力的細(xì)胞處理形式,必須避免這種形式以保持單細(xì)胞懸浮液的活力并防止細(xì)胞崩解。在表3中概述的實(shí)驗(yàn)中,渦旋細(xì)胞導(dǎo)致細(xì)胞活力降低和細(xì)胞碎片和聚集物增加。不使用渦旋,優(yōu)選輕輕吸打以重懸細(xì)胞或細(xì)胞沉淀,移液吸打時(shí)盡量避免氣泡的產(chǎn)生。

5)離心是另一個(gè)會(huì)導(dǎo)致固體組織單細(xì)胞懸液制備不良結(jié)果的因素。通常,細(xì)胞應(yīng)在300-900相對(duì)離心力(RCF)之間離心,900 RCF更適合固定細(xì)胞,較低的離心力用于活的未固定細(xì)胞。重要的是要注意,這些值以相對(duì)離心力而不是每分鐘轉(zhuǎn)數(shù)(RPM)表示,因?yàn)镽PM表示取決于每個(gè)特定離心機(jī)上的轉(zhuǎn)子半徑的可變力。以過(guò)高的速度離心細(xì)胞可導(dǎo)致聚集體的產(chǎn)生和對(duì)細(xì)胞膜的損傷,而以過(guò)低的速度離心將使細(xì)胞保持懸浮并在吸出上清液時(shí)丟失。

6)表3中,消化不夠的處理?xiàng)l件是在消化混合物中孵育20min,顯示聚集體和細(xì)胞碎片增加;過(guò)度消化是孵育5hr,導(dǎo)致細(xì)胞活力顯著降低以及懸浮液中細(xì)胞碎片增加。因此,確定每個(gè)實(shí)驗(yàn)中涉及的特定消化酶和組織的正確孵育時(shí)間至關(guān)重要。

7)如果可能,應(yīng)將未固定的細(xì)胞在冰上染色以保持活力并避免在免疫染色過(guò)程中細(xì)胞死亡。

8)在整個(gè)消化過(guò)程中,所有緩沖液都應(yīng)含有DNase-I,以降解裂解細(xì)胞釋放的游離DNA,防止細(xì)胞聚集。

9)乙二胺四乙酸(EDTA)是一種螯合劑,可螯合包括整聯(lián)蛋白介導(dǎo)的細(xì)胞與細(xì)胞外基質(zhì)粘附所必需的那些二價(jià)金屬離子。因此,在消化混合物中包括EDTA對(duì)于限制天然粘附細(xì)胞如上皮細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的粘附是重要的。

10)材料選擇也在限制粘附方面起作用。由于細(xì)胞和聚丙烯表面之間的親和力較低,聚丙烯管或板最適合于制備單細(xì)胞懸浮液,從而減少了細(xì)胞粘附到管或板上并從懸浮液中丟失的可能性。聚苯乙烯旨在促進(jìn)細(xì)胞粘附和擴(kuò)散,在流式細(xì)胞儀實(shí)驗(yàn)中應(yīng)避免使用。

11)在嘗試獲取和分析流式細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)之前,檢查細(xì)胞活力并評(píng)估單細(xì)胞懸液的總細(xì)胞產(chǎn)量以及細(xì)胞碎片和聚集體的清除是非常重要的。為此目的采用核染色(DRAQ5)和細(xì)胞活力染色(PI)。

12)如果細(xì)胞懸浮液被過(guò)量的紅細(xì)胞污染,應(yīng)使用紅細(xì)胞裂解液去除紅細(xì)胞,并確保懸浮液中保留感興趣的細(xì)胞類型用于免疫染色和流式細(xì)胞儀采集。對(duì)應(yīng)的處理流程應(yīng)應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)中的所有樣品,以保持細(xì)胞制備程序一致。

所有實(shí)驗(yàn)均使用年齡和性別匹配的小鼠的左肺葉進(jìn)行。針對(duì)每種條件顯示三次實(shí)驗(yàn)的平均標(biāo)準(zhǔn)誤差。(*)表示與Best Practice相比p <0.05(t-檢驗(yàn))。將聚集物定量為每100nl體積的計(jì)數(shù)(1平方英寸的血細(xì)胞計(jì)數(shù)器室,0.1mm深度)?;厥章实挠?jì)算為(完整細(xì)胞數(shù))/(最佳實(shí)踐完整細(xì)胞數(shù))* 100%。


應(yīng)用相關(guān)注意點(diǎn):
1.表型分析時(shí),應(yīng)檢驗(yàn)研究關(guān)注的抗原是否會(huì)被機(jī)械和酶解所破壞,因?yàn)橐恍┟缚梢愿淖兣c表型分析相關(guān)的一些標(biāo)志物的表達(dá)。2. 對(duì)于涉及細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞因子檢測(cè)的實(shí)驗(yàn),建議蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)抑制劑阻斷細(xì)胞因子的分泌。3.組織解離也已經(jīng)顯示出對(duì)RNA表達(dá)的影響,部分原因是microRNA的上調(diào),當(dāng)細(xì)胞從其周圍組織中分離時(shí),microRNA在限制細(xì)胞活性中發(fā)揮作用。在評(píng)估RNA表達(dá)之前,應(yīng)考慮這種變化,還應(yīng)在各緩沖液中包括RNase抑制劑以避免感興趣的RNA轉(zhuǎn)錄物的降解。4.流式磷酸化研究旨在通過(guò)研究激酶信號(hào)通路來(lái)測(cè)量細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的磷酸化狀態(tài)。對(duì)于這些研究,磷酸酶抑制劑應(yīng)包括在酶解混合物中,以保持磷酸化信號(hào)并確保準(zhǔn)確的結(jié)果。5.最后,受損細(xì)胞可釋放能夠切割目的表位的蛋白酶。當(dāng)添加到消化混合物中時(shí),蛋白酶抑制劑能夠減輕這種表位缺失。


附:小鼠肺單細(xì)胞懸液制備最佳實(shí)踐

1. ?從C57BL/6小鼠收獲肺并從周圍組織中分離。

2. ?用PBS沖洗肺并用剪刀切碎機(jī)械分散,增加酶解面積。

3. ?每個(gè)肺加入2.5ml消化緩沖液,包含100mg/ml Dispase II(Roche Diagnostics,Indianapolis,IN,Cat#04942078001),10mg/ml膠原酶A(Roche Diagnostics,Indianapolis,IN,Cat#10103578001),1500kU/ml DNase I(Sigma-Aldrich,St.Louis,MO,Cat#D5025-150KU)和0.025M CaCl2。

4. ?在軌道振蕩器上于37℃溫育1hr。

5. ?使用移液管輕輕混合懸浮液,并進(jìn)一步溫育30min。

6. ?40μm過(guò)濾器過(guò)濾到50ml Falcon管中。

7. ?使用Beckman Coulter,Allegra X-12R離心機(jī)將懸浮液以900g離心5min,并吸出上清液。

8. ?將沉淀重懸浮于UV活/死染料(Invitrogen,Waltham,MA,Cat#L23105)中,并在室溫下避光孵育30min。

9. ?將PBS加入懸浮液中,以900g離心5min,吸出上清液。

10.將細(xì)胞在含4%多聚甲醛(Polysciences,Warrington,PA,Cat#18814-10)的PBS中的中固定10min(10ml 16%PFA稀釋于30ml PBS中)。

11.直接免疫染色或冷凍保存用于以后的抗體染色。


Reference:?Andrew Reichard,1 Kewal Asosingh1,2* Best Practices for Preparing a Single Cell Suspension from Solid Tissues for Flow Cytometry ? Cytometry Part A 2018



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七千字經(jīng)驗(yàn)總結(jié)!組織樣本處理成單細(xì)胞懸浮液的評(píng)論 (共 條)

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