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【R語(yǔ)言】如何用R語(yǔ)言計(jì)算cox回歸模型的riskscore?

2023-04-08 20:03 作者:大雯的男朋友  | 我要投稿


在R中計(jì)算cox回歸模型的風(fēng)險(xiǎn)得分,需要以下幾個(gè)步驟:

  1. 安裝并加載 `survival` 包,該包提供了 Cox 回歸模型的函數(shù) `coxph()`。


2. 導(dǎo)入數(shù)據(jù),準(zhǔn)備用于 Cox 回歸模型擬合和風(fēng)險(xiǎn)得分計(jì)算的數(shù)據(jù)。例如,我們使用內(nèi)置的肝炎數(shù)據(jù)集 `hepatitis`。

3. 擬合 Cox 回歸模型,并得到模型的系數(shù)。在這個(gè)例子中,我們假設(shè)年齡、性別、疾病嚴(yán)重度、肝硬化等因素是與患者死亡風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)的因素。

4. 對(duì)每個(gè)個(gè)體,根據(jù)其基線危險(xiǎn)率和模型系數(shù)計(jì)算風(fēng)險(xiǎn)得分。根據(jù) Cox 回歸模型公式,風(fēng)險(xiǎn)得分可以通過(guò)以下公式計(jì)算:

其中,baselineHazard是基線危險(xiǎn)率, beta1 - betap是 Cox 回歸模型的系數(shù), x1 - xp是個(gè)體的協(xié)變量。


5. 最后,我們可以看一下風(fēng)險(xiǎn)得分的分布情況。

完整的代碼如下:

希望對(duì)你有所幫助!


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