iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)——用科學(xué)解釋“孫行者”的蟠桃內(nèi)部褐變機(jī)制
前言
“玉露”蟠桃為冷敏感型果實(shí),長(zhǎng)期的低溫冷藏易使果實(shí)出現(xiàn)果肉褐變、絮敗、糖酸比失調(diào)、芳香物質(zhì)喪失等品質(zhì)劣變癥狀,嚴(yán)重影響了果實(shí)的食用和商品價(jià)值,其中果肉褐變是制約桃果實(shí)流通及產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要瓶頸。氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制果肉褐變,但作用機(jī)理仍需解析。
2022年7月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院林木果樹研究所葉正文團(tuán)隊(duì)在Plant Physiology and Biochemistry發(fā)表了題為 “Controlled atmosphere storage alleviates internal browning in flat peach fruit by regulating energy and sugar metabolisms ”的研究成果,基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)氣調(diào)貯藏(CA)可顯著抑制蟠桃果實(shí)果肉褐變(IB)和能量損耗,增強(qiáng)果實(shí)的抗冷性,延長(zhǎng)保鮮期。探討能量代謝與果肉褐變作用機(jī)制,為解析桃果實(shí)抗低溫逆境原理及貯藏保鮮和冷鏈物流技術(shù)的研發(fā)提供理論支撐。
基本信息
中文標(biāo)題:氣調(diào)貯藏調(diào)控能量和糖代謝延緩果實(shí)褐變的機(jī)理機(jī)制解析
研究對(duì)象:蟠桃果實(shí)
發(fā)表期刊:Plant Physiology and Biochemistry
影響因子:5.473
發(fā)表時(shí)間:2022年7月
運(yùn)用組學(xué)技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)
研究背景
本研究以冷敏感型“玉露”蟠桃果實(shí)為試材,研究氣調(diào)貯藏(3–3.5%氧氣、3–3.5%二氧化碳和93–94%氮?dú)猓?duì)果實(shí)褐變、糖含量和ATP、ADP、AMP及能荷的影響;基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),對(duì)氧化磷酸化途徑、糖酵解途徑和蔗糖-淀粉途徑代謝通路及關(guān)鍵蛋白進(jìn)行研究,探討能量代謝與果肉褐變作用機(jī)制。
技術(shù)流程
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研究結(jié)果
1、褐變(IB)指數(shù)
冷藏25+3d和30+3d,對(duì)照組果實(shí)的褐變指數(shù)分別為22.5% 和 90% ,氣調(diào)貯藏可顯著抑制果實(shí)褐變的發(fā)生。
圖1 | CA貯藏對(duì)蟠桃果實(shí)IB指數(shù)的影響
2.糖含量
冷藏期間,CK果實(shí)的蔗糖、葡萄糖和果糖含量持續(xù)下降,氣調(diào)貯藏可顯著抑制冷藏和貨架期間果實(shí)蔗糖、葡萄糖和果糖含量的降低,且顯著高于對(duì)照組果實(shí)糖含量。
圖2?|?CA貯藏對(duì)冷藏和貨架期間含量的影響
蔗糖(A)、果糖(B)、葡萄糖(C)和山梨醇(D)
3.ATP、ADP、AMP含量和能荷
冷藏期間,CK組果實(shí)ATP含量和能荷均呈急劇下降趨勢(shì),氣調(diào)貯藏可顯著抑制ATP含量和能荷的下降。CK組和氣調(diào)貯藏組果實(shí)ADP含量呈先上升后下降的趨勢(shì),貯藏后期氣調(diào)組果實(shí)ADP含量顯著高于CK組果實(shí);CK組和氣調(diào)組果實(shí)AMP含量呈先下降后上升再下降的趨勢(shì),貯藏20-30d的氣調(diào)組果實(shí)AMP含量顯著高于CK組果實(shí)。貨架第3d,氣調(diào)組果實(shí)ATP和ADP含量及能荷均顯著高于CK組果實(shí)。
圖3 | CA貯藏對(duì)冷藏和貨架期間的變化
ATP(A)、ADP(B)、AMP(C)含量和能荷(D)
4.冷藏和貨架期間與能量代謝相關(guān)的DEPs的鑒定
33個(gè)差異表達(dá)蛋白與果實(shí)褐變和能量代謝相關(guān)?;?3個(gè)差異蛋白的變化,兩個(gè)處理組和五個(gè)時(shí)間點(diǎn)的果品被聚為4類。類群Ⅰ包含冷藏0 d,15 d,20 d的對(duì)照組和氣調(diào)組果實(shí);類群Ⅱ包含冷藏30d的對(duì)照組果實(shí);類群Ⅲ包含30+3 d的對(duì)照組果實(shí);類群Ⅳ包含30d和30+3d的氣調(diào)組果實(shí)。氣調(diào)處理對(duì)貯藏后期果品的能荷及褐變調(diào)控作用較大,冷藏20-30d和30+3d為褐變調(diào)控的關(guān)鍵時(shí)間點(diǎn)(圖 4)。
33個(gè)差異蛋白分布在3個(gè)代謝途徑,氧化磷酸化途徑中M5XYZ4,M5WJV0,M5WMW6 等25個(gè)差異表達(dá)蛋白被調(diào)控;蔗糖-淀粉途徑中M5VVU6、M5VWQ6等6個(gè)差異表達(dá)蛋白被調(diào)控;糖酵解途徑中M5XC37 等6個(gè)差異表達(dá)蛋白被調(diào)控,其中4個(gè)差異表達(dá)蛋白為兩個(gè)途徑共有(圖 4和表2)。
五個(gè)關(guān)鍵貯藏時(shí)間點(diǎn)中,4633個(gè)可信蛋白和2253個(gè)差異表達(dá)蛋白被檢測(cè)出。對(duì)照組果實(shí)差異蛋白表達(dá)量持續(xù)左移,氣調(diào)貯藏的果實(shí)差異蛋白表達(dá)量持續(xù)上移,說(shuō)明氣調(diào)對(duì)差異蛋白的調(diào)控較明顯(圖5)。(對(duì)照組果實(shí)中有180個(gè)差異表達(dá)蛋白持續(xù)下調(diào);140個(gè)差異表達(dá)蛋白持續(xù)上調(diào);氣調(diào)貯藏的果實(shí)中有112個(gè)差異表達(dá)蛋白持續(xù)下調(diào),54個(gè)差異表達(dá)蛋白持續(xù)上調(diào)。)
冷藏15d,20d,30d及貨架期間:對(duì)照組果實(shí)分別有34,92,374,440個(gè)差異表達(dá)蛋白;氣調(diào)貯藏組果實(shí)分別有50,46,159,237個(gè)差異表達(dá)蛋白。對(duì)照組果實(shí)分別有13,1,64,123特異的差異表達(dá)蛋白;氣調(diào)貯藏組果實(shí)分別有9,2,39,121特異的差異表達(dá)蛋白。整個(gè)期間,對(duì)照組果實(shí)有13個(gè)共有的差異表達(dá)蛋白;氣調(diào)貯藏組果實(shí)有22個(gè)共有的差異表達(dá)蛋白。其中,33個(gè)差異表達(dá)蛋白與果實(shí)能量代謝和膜完整性相關(guān)(圖4和6)。
圖4 | 熱圖
圖5 | 差異蛋白的主成分分析
圖6 | 能量代謝相關(guān)的差異表達(dá)蛋白數(shù)量
5.CA 貯藏對(duì)關(guān)鍵蛋白表達(dá)量及蛋白互作的影響
糖酵解、淀粉-蔗糖和氧化磷酸化途徑三個(gè)代謝途徑的33個(gè)差異表達(dá)蛋白呈復(fù)雜的互作關(guān)系,共同調(diào)控果實(shí)的褐變和能量代謝。其中,β-淀粉酶1,2、α-淀粉酶和蔗糖合成酶呈線性互作關(guān)系;氧化磷酸化途徑中的25個(gè)差異表達(dá)蛋白呈復(fù)雜的線形和環(huán)形互作關(guān)系,其中磷酸果糖激酶1,2(PFK1,2)為氧化磷酸化途徑和糖酵解途徑共同擁有。氣調(diào)貯藏通過(guò)調(diào)控酮酸脫羧酶1,2(PDC1, 2)、the V-type proton ATPase、β-淀粉酶1的表達(dá)量抑制軟溶質(zhì)桃果實(shí)褐變和能量損耗,PDC1, 2和β-淀粉酶可能是厭氧條件下能量供給的一種途徑。
圖7 | 蛋白互作圖
附錄:(文章中所提到的表1和表2)
研究討論
該研究基于iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),對(duì)氧化磷酸化途徑、糖酵解途徑和蔗糖-淀粉途徑代謝通路及關(guān)鍵蛋白進(jìn)行研究,探討能量代謝與果肉褐變作用機(jī)制,這表明,蟠桃果實(shí)IB指數(shù)與ATP、AMP、蔗糖和果糖含量顯著相關(guān)。CA貯藏可通過(guò)調(diào)控糖酵解/糖異生、淀粉-蔗糖和OPP代謝途徑中的關(guān)鍵蛋白質(zhì)的表達(dá)量而抑制果實(shí)褐變的發(fā)生及能量的損耗,較好地保持果實(shí)固有品質(zhì)和風(fēng)味,延長(zhǎng)果實(shí)保鮮期。其中磷酸果糖激酶1,2(PFK1,2)為氧化磷酸化途徑和糖酵解途徑共同擁有。
氣調(diào)貯藏通過(guò)調(diào)控酮酸脫羧酶1,2(PDC1, 2)、the V-type proton ATPase 、β-淀粉酶1的表達(dá)量抑制軟溶質(zhì)桃果實(shí)褐變和能量損耗,PDC1, 2和β-淀粉酶可能是厭氧條件下能量供給的一種途徑。該研究成果為解析桃果實(shí)抗低溫逆境原理及貯藏保鮮和冷鏈物流技術(shù)的研發(fā)提供理論支撐。
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