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百螢 ATTO 647N 馬來酰亞胺實(shí)驗(yàn)方案

2023-09-07 10:16 作者:百螢生物  | 我要投稿

一.百螢 ATTO 647N 馬來酰亞胺工作原理

?基于羅丹明的 ATTO 647N 是一種紅色熒光標(biāo)記,具有與 Cy5 相似的光譜特性。它具有強(qiáng)吸收、高熒光量子產(chǎn)率以及出色的熱穩(wěn)定性和光穩(wěn)定性。值得注意的是,其吸收和熒光不受 2 至 11 的 pH 值變化的影響。與花青染料不同,ATTO 647N 在大氣臭氧存在下表現(xiàn)出出色的穩(wěn)定性,這使其對(duì)于微陣列應(yīng)用特別有價(jià)值。 ATTO 647N 非常適合一系列科學(xué)應(yīng)用,包括單分子檢測(cè)、SIM 和 STED 等高分辨率顯微鏡技術(shù),以及流式細(xì)胞術(shù) (FACS) 和熒光原位雜交 (FISH)。 ATTO 647N 馬來酰亞胺用于標(biāo)記含硫醇的分子,例如蛋白質(zhì)、抗體、配體和寡核苷酸硫代磷酸鹽。

圖1.熒光染料馬來酰亞胺是通過 SH 基團(tuán)將染料與肽、蛋白質(zhì)、抗體、硫醇修飾的寡核苷酸或核酸結(jié)合的最常用工具。馬來酰亞胺在中性條件下很容易與蛋白質(zhì)的硫醇基團(tuán)、硫醇修飾的寡核苷酸和其他含硫醇的分子發(fā)生反應(yīng)。所得的染料綴合物相當(dāng)穩(wěn)定。

二.百螢 ATTO 647N 馬來酰亞胺參數(shù)

Ex(nm)? ? ? 318

Em(nm)? ? ??663

分 子 量? ?? ?N/A

溶? ? ? 劑 ?????DMSO

存儲(chǔ)條件? ? ?在-15℃以下保存,避光防潮

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三.百螢 ATTO 647N 馬來酰亞胺實(shí)驗(yàn)方案

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溶液配制方案

除非另有說明,所有未使用的儲(chǔ)備溶液應(yīng)分成一次性等份,并在制備后儲(chǔ)存在-20°C。避免反復(fù)凍融循環(huán)。

1.ATTO 647N 馬來酰亞胺儲(chǔ)備溶液(溶液 B) :

將無水 DMSO 添加到 ATTO 647N 馬來酰亞胺小瓶中,制成 10 mM 儲(chǔ)備溶液。通過移液或渦旋充分混合。

注意

開始綴合前準(zhǔn)備染料儲(chǔ)備溶液(溶液 B)。及時(shí)使用。延長儲(chǔ)存染料原液可能會(huì)降低染料活性。避光防潮時(shí),溶液 B 可在冰箱中保存長達(dá) 4 周。避免凍融循環(huán)。

2. 蛋白原液(A液)

將 100 μL 反應(yīng)緩沖液(例如,pH ~6.0 的 100 mM MES 緩沖液)與 900 μL 目標(biāo)蛋白溶液(例如抗體,蛋白濃度 > 2 mg/mL 如果可能)混合,得到 1 mL 蛋白標(biāo)記庫存溶液。

注1:蛋白質(zhì)溶液(溶液 A)的 pH 應(yīng)為 6.5 ± 0.5。

注2:不純的抗體、穩(wěn)定的牛血清蛋白(BSA)抗體或明膠不會(huì)被很好的標(biāo)記。疊氮化鈉或硫柳汞的存在也可能干擾綴合反應(yīng)??梢酝ㄟ^透析或旋轉(zhuǎn)柱除去疊氮化鈉或硫柳汞,以獲得標(biāo)記結(jié)果。

注3:如果蛋白質(zhì)濃度低于 2 mg/mL,結(jié)合效率會(huì)顯著降低。為了獲得最佳標(biāo)記效率,建議最終蛋白質(zhì)濃度范圍為 2-10 mg/mL。

可選:如果您的蛋白質(zhì)不含游離半胱氨酸,則必須用 DTT 或 TCEP 處理蛋白質(zhì)以生成硫醇基團(tuán)。 DTT 或 TCEP 用于將二硫鍵轉(zhuǎn)化為兩個(gè)游離硫醇基團(tuán)。如果使用 DTT,則必須在將馬來酰亞胺染料與蛋白質(zhì)結(jié)合之前通過透析或凝膠過濾除去游離 DTT。以下是生成游離硫醇基團(tuán)的示例方案:

1.在蒸餾水中制備 1 M DTT (15.4 mg/100 μL) 的新鮮溶液。

2.在 20 mM DTT 中制備 IgG 溶液:混合時(shí)每 ml IgG 溶液添加 20 μL DTT 庫存。在室溫下靜置 30 分鐘,無需額外混合(以盡量減少半胱氨酸再氧化為胱氨酸)。

3.將還原的 IgG 通過用“交換緩沖液”預(yù)平衡的過濾柱。從柱中收集 0.25 mL 餾分。

4.確定蛋白質(zhì)濃度并將大部分 IgG 的級(jí)分合并。這可以通過分光光度法或比色法來完成。

5.此步驟后盡快進(jìn)行綴合(請(qǐng)參閱示例實(shí)驗(yàn)方案)。

注意:為了獲得最佳結(jié)果,IgG 溶液應(yīng) >4 mg/mL。如果抗體低于 2 mg/mL,則應(yīng)濃縮。額外包括 10% 的緩沖液交換柱損失。

注意:幾乎可以在 pH 7-7.5 的任何緩沖液中進(jìn)行還原,例如 MES、磷酸鹽或 TRIS 緩沖液。

注意:步驟 3 和 4 可以用透析代替。

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樣品實(shí)驗(yàn)方案:

該標(biāo)記方案是針對(duì)山羊抗小鼠 IgG 與 ATTO 647N 馬來酰亞胺的綴合物而開發(fā)的。請(qǐng)您根據(jù)您的實(shí)際情況,進(jìn)行操作。

注意:每種蛋白質(zhì)都需要不同的染料/蛋白質(zhì)比例,這也取決于染料的特性。蛋白質(zhì)的過度標(biāo)記可能會(huì)對(duì)其結(jié)合親和力產(chǎn)生不利影響,而低染料/蛋白質(zhì)比率的蛋白質(zhì)綴合物會(huì)降低靈敏度。

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運(yùn)行綴合反應(yīng):

1.使用 10:1 摩爾比的溶液 B(染料)/溶液 A(蛋白質(zhì))作為起點(diǎn):將 5 μL 染料儲(chǔ)備溶液(溶液 B,假設(shè)染料儲(chǔ)備溶液為 10 mM)添加到蛋白質(zhì)小瓶中溶液(95 μL 溶液 A)并有效搖動(dòng)。假設(shè)蛋白質(zhì)濃度為 10 mg/mL,蛋白質(zhì)的分子量為 ~200KD,則蛋白質(zhì)濃度為 ~0.05 mM。

注意:我們建議使用溶液 B(染料)/溶液 A(蛋白質(zhì))摩爾比為 10:1 的溶液。如果太少或太高,則分別確定最佳染料/蛋白質(zhì)比例為 5:1、15:1 和 20:1。

2.繼續(xù)在室溫下旋轉(zhuǎn)或搖動(dòng)反應(yīng)混合物30-60分鐘。

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純化綴合:

以下方案是使用 Sephadex G-25 柱純化染料-蛋白質(zhì)綴合物的示例。

1.根據(jù)制造說明準(zhǔn)備 Sephadex G-25 柱。

2.將反應(yīng)混合物(來自“運(yùn)行綴合反應(yīng)”)加載到 Sephadex G-25 柱的頂部。

3.當(dāng)樣品剛好流到頂部樹脂表面下方時(shí),立即添加 PBS(pH 7.2-7.4)。

4.向所需樣品中添加更多 PBS (pH 7.2-7.4) 以完成柱純化。合并含有所需染料-蛋白質(zhì)綴合物的級(jí)分。

注意:如需立即使用,染料-蛋白質(zhì)綴合物需要用染色緩沖液稀釋,并等分多次使用。

注意:為了長期儲(chǔ)存,染料-蛋白質(zhì)綴合物溶液需要濃縮或冷凍干燥。


百螢 ATTO 647N 馬來酰亞胺實(shí)驗(yàn)方案的評(píng)論 (共 條)

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