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穩(wěn)中求勝 | 迪贏升級(jí)版iQuars 50工作站開啟NGS建庫(kù)捕獲一體化新篇章

2023-03-13 15:52 作者:上海迪贏生物  | 我要投稿

在精準(zhǔn)醫(yī)療時(shí)代,NGS技術(shù)不斷突破,快速發(fā)展,讓人們對(duì)疾病與基因之間的關(guān)聯(lián)性有了更深入的了解。但要實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療卻不是一件容易的事情,實(shí)驗(yàn)過程繁瑣,測(cè)序結(jié)果高度依賴技術(shù)人員的操作,數(shù)據(jù)的不穩(wěn)定性等因素往往使獲得的結(jié)果最終無法滿足客戶需求。因此,需要將NGS文庫(kù)及靶向捕獲制備過程化繁為簡(jiǎn),減少人工干預(yù),實(shí)現(xiàn)操作標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化。

隨著自動(dòng)化需求的不斷增多,不同廠家都推出了自動(dòng)化工作站,但多數(shù)占地面積大,比較笨重;在樣本通量上的選擇不靈活,無法做到隨時(shí)上機(jī);編輯軟件復(fù)雜;捕獲測(cè)序結(jié)果不穩(wěn)定等,這些缺點(diǎn)使得這一類自動(dòng)化工作站很難在客戶端靈活使用。

迪贏生物為此進(jìn)行著不斷的探索與嘗試,升級(jí)了iQuars 50全自動(dòng)NGS樣本建庫(kù)捕獲工作站,實(shí)現(xiàn)移液高度精準(zhǔn),測(cè)序結(jié)果穩(wěn)定,可為客戶提供建庫(kù)加捕獲一體化的解決方案。


產(chǎn)品介紹


產(chǎn)品特色

01.功能一體:功能集成化設(shè)計(jì),建庫(kù)捕獲一體。

02.吸液精準(zhǔn):實(shí)時(shí)通道自檢,確保吸液準(zhǔn)確性;液位檢測(cè),進(jìn)行可用性檢查和優(yōu)先非接觸式分配。

03.操作便捷:中文界面,隨時(shí)掌握實(shí)驗(yàn)流程進(jìn)展,人性化安排實(shí)驗(yàn)進(jìn)度。

04.耗材開放:不需要昂貴的專用耗材,客戶可以自由選擇使用通用槍頭或是可做電容式探測(cè)液面的槍頭。

05.高度潔凈:外置式PCR,避免自動(dòng)化工作站內(nèi)交叉污染,配置紫外通風(fēng)處理功能,潔凈度達(dá)百級(jí),最大化防止污染。

06.兼容性強(qiáng):通過更改程序腳本,iQuars可以支持多樣化建庫(kù)雜交方法,兼容不同的試劑盒。


數(shù)據(jù)展示

建庫(kù)捕獲產(chǎn)出與手工相當(dāng)

圖1. iQuars 50與手工建庫(kù)捕獲文庫(kù)比較

注:實(shí)驗(yàn)采用標(biāo)準(zhǔn)品 NA12878,Input 100ng,酶切建庫(kù)( QuarPrep EZ DNA Library Kit 1.0,Dynegene,NL1002),捕獲使用panel 為QuarXeq Human All Exon Probes 1.0( Dynegene,NY1001),捕獲試劑為QuarHyb One Reagent Kit( Dynegene,NC1003)自動(dòng)化流程使用儀器內(nèi)置應(yīng)用,每樣本取750ng 捕獲前文庫(kù)進(jìn)行單雜實(shí)驗(yàn),手動(dòng)實(shí)驗(yàn)操作均按照產(chǎn)品說明書進(jìn)行。


文庫(kù)片段大小穩(wěn)定

圖2.使用iQuars 50捕獲文庫(kù)片段大小,CV 1.53%,峰型穩(wěn)定

單雜捕獲數(shù)據(jù)優(yōu)異

圖3. iQuars 50與手工建庫(kù)捕獲數(shù)據(jù)比較

注:實(shí)驗(yàn)采用標(biāo)準(zhǔn)品 NA12878,Input 100ng,酶切建庫(kù)( QuarPrep EZ DNA Library Kit 1.0,Dynegene,NL1002),捕獲使用panel 為QuarXeq Human All Exon Probes 1.0( Dynegene,NY1001),捕獲試劑為QuarHyb One Reagent Kit( Dynegene,NC1003)自動(dòng)化流程使用儀器內(nèi)置應(yīng)用,每樣本取750ng 捕獲前文庫(kù)進(jìn)行單雜實(shí)驗(yàn),手動(dòng)實(shí)驗(yàn)操作均按照產(chǎn)品說明書進(jìn)行。


多雜捕獲結(jié)果穩(wěn)定

圖4. iQuars 50混捕下機(jī)數(shù)據(jù)情況

注:實(shí)驗(yàn)采用標(biāo)準(zhǔn)品 NA12878,Input 100ng,酶切建庫(kù)( QuarPrep EZ DNA Library Kit 1.0,Dynegene,NL1002),捕獲使用panel 為QuarXeq Human All Exon Probes 1.0( Dynegene,NY1001),捕獲試劑為QuarHyb One Reagent Kit( Dynegene,NC1003)自動(dòng)化流程使用儀器內(nèi)置應(yīng)用,分別進(jìn)行4混1、6混1、8混1操作,手動(dòng)實(shí)驗(yàn)均按照產(chǎn)品說明書進(jìn)行


完整解決方案

迪贏可為客戶提供建庫(kù)加捕獲一體化的解決方案,搭配迪贏的試劑盒產(chǎn)品,通過更改程序腳本,iQuars可以支持多樣化建庫(kù)雜交方法。


配套試劑


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