宏蛋白質(zhì)組學(xué)是大規(guī)模的定性和定量分析蛋白質(zhì)以分析環(huán)境中的微生物群落的一門(mén)學(xué)科。百泰派克生物科技提供基于質(zhì)譜的宏蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。

宏蛋白質(zhì)組學(xué)

宏蛋白質(zhì)組學(xué)也稱(chēng)為環(huán)境蛋白質(zhì)組學(xué)，是通過(guò)對(duì)環(huán)境菌群中某一時(shí)刻的所有蛋白的詳盡描述，從而揭示微生物表型信息的一門(mén)學(xué)科。宏蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集的分析提供了有關(guān)微生物群落的結(jié)構(gòu)、功能和動(dòng)態(tài)的信息，這對(duì)于提高對(duì)微生物的招募、營(yíng)養(yǎng)資源競(jìng)爭(zhēng)、代謝活動(dòng)和整個(gè)群落的防御系統(tǒng)分布的理解至關(guān)重要。例如，針對(duì)人類(lèi)口腔微生物組的宏蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)人類(lèi)口腔中有50個(gè)細(xì)菌屬，該結(jié)果與人類(lèi)微生物組計(jì)劃的結(jié)果一致。宏蛋白質(zhì)組學(xué)可以用于分析微生物的共生關(guān)系、宿主-病原體的關(guān)系和宿主之間的關(guān)系。

宏蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

成功的宏蛋白質(zhì)組學(xué)測(cè)量取決于三個(gè)要素：從環(huán)境樣品中有效提取蛋白質(zhì)，在檢測(cè)之前分離蛋白質(zhì)或多肽，最后是對(duì)蛋白質(zhì)和多肽進(jìn)行高通量的清晰鑒定。當(dāng)前，宏蛋白質(zhì)組學(xué)分析常常使用基于液相色譜的分離技術(shù)以及基于質(zhì)譜的肽段鑒定技術(shù)進(jìn)行。采用自下而上的策略，首先使用胰蛋白酶將蛋白質(zhì)消化成肽，然后進(jìn)行色譜分離，并隨后通過(guò)質(zhì)譜或串聯(lián)質(zhì)譜進(jìn)行分析。該方法可以對(duì)建立了基因組的環(huán)境微生物群落進(jìn)行研究。

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蛋白組學(xué)