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【引文選集】看基因敲除細(xì)胞如何帶你披荊斬“疾”!

2023-08-02 14:48 作者:源井生物  | 我要投稿

源井生物專注于細(xì)胞基因編輯研發(fā)與生產(chǎn),擁有近3000平方的基因編輯技術(shù)平臺(tái)、細(xì)胞生物學(xué)平臺(tái)以及抗體驗(yàn)證平臺(tái),目前已為全球超30個(gè)國(guó)家的科研單位和工業(yè)客戶提供技術(shù)服務(wù)與產(chǎn)品。

憑借獨(dú)家CRISPR-U?專利技術(shù),源井生物將傳統(tǒng)的CRISPR/Cas9編輯效率提高至10倍以上,并以此為基礎(chǔ)開展了紅棉基因敲除計(jì)劃,建成擁有3500多例基因敲除細(xì)胞的基因編輯細(xì)胞庫(kù),并計(jì)劃于2024年擴(kuò)增至5000例。

源井基因敲除細(xì)胞庫(kù)擁有覆蓋26條信號(hào)通路、5大類藥物靶點(diǎn),27種疾病類型等3500+ko現(xiàn)貨,1周交付純合克隆,還可提供基因敲除細(xì)胞定制服務(wù)!

KO細(xì)胞通常被應(yīng)用于研究基因功能、疾病發(fā)生機(jī)制和藥物篩選等方面。以下精選了9篇采用源井生物所提供的基因敲除細(xì)胞系助力疾病研究的相關(guān)文章,希望對(duì)您的研究有所啟發(fā)。

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目錄

① Hep G2細(xì)胞敲除SNORD17基因——肝細(xì)胞癌IF=15.8

② L-02肝細(xì)胞系敲除TFEB——自噬IF=13.30

③ RAW264.7細(xì)胞敲除Pik3r1——骨質(zhì)疏松IF=11.4

④ 小鼠MC38和CT26細(xì)胞敲除TNFR2——結(jié)腸癌IF=10.75

⑤ THP-1敲除PPIA——炎癥IF=8.8

⑥ Hela敲除astrin——銀屑病IF=7.36

⑦ 293T敲除AM122A、PP5、DNA-PK——癌癥治療IF=5.0

⑧ RAW264.7敲除HIF-1α——骨質(zhì)疏松IF=4.63

⑨ NIH-3T3敲除TSC2——結(jié)節(jié)性硬化癥IF=2.99

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① Hep G2細(xì)胞敲除SNORD17基因——肝細(xì)胞癌

期刊:cell death & differentiation,IF=15.8

標(biāo)題:Non-coding small nucleolar RNA SNORD17 promotes the progression of hepatocellular carcinoma through a positive feedback loop upon p53 inactivation

單位:同濟(jì)醫(yī)院肝臟外科中心

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摘要:該研究構(gòu)揭示了小核仁RNA SNORD17和p53信號(hào)通路在肝細(xì)胞癌的中的調(diào)控作用,為肝細(xì)胞癌的治療提供了一個(gè)新的潛在靶點(diǎn)。源井生物為本研究提供關(guān)鍵細(xì)胞模型:SNORD17基因敲除的Hep G2細(xì)胞,通過(guò)體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明,在HCC細(xì)胞系敲除SNORD17基因可顯著抑制細(xì)胞增殖、克隆形成和G1/S期轉(zhuǎn)變[1]。

圖1 p53介導(dǎo)SNORD17對(duì)HCC細(xì)胞生長(zhǎng)的影響

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② L-02肝細(xì)胞系敲除TFEB——自噬

期刊:Small,IF=13.30

標(biāo)題:Silica Nanoparticles Trigger Chaperone HSPB8-Assisted Selective Autophagy via TFEB Activation in Hepatocytes

單位:首都醫(yī)科大學(xué)

摘要:二氧化硅納米顆粒(SiNPs)是最常見的無(wú)機(jī)納米材料之一,自噬是對(duì)納米顆粒的主要生物反應(yīng)。該文章利用源井生物構(gòu)建的TFEB敲除的L-02肝細(xì)胞系,驗(yàn)證TFEB參與SiNPs誘導(dǎo)的自噬,通過(guò)RNA測(cè)序比較野生型和TFEB 基因敲除細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組,證明(SiNPs) 是通過(guò)TFEB激活肝細(xì)胞觸發(fā)Hspb8輔助的選擇性自噬[2]。

圖2 SiNPs誘導(dǎo)CASA機(jī)制圖解

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③ RAW264.7細(xì)胞敲除Pik3r1——骨質(zhì)疏松

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期刊:Redox Biology,IF=11.4

標(biāo)題:GSTP1-mediated S-glutathionylation of Pik3r1 is a redox hub that inhibits osteoclastogenesis through regulating autophagic flux

單位:浙江大學(xué)附屬醫(yī)院骨科研究中心

該文章通過(guò)源井生物構(gòu)建的Pik3r1基因RAW264.7細(xì)胞敲除模型,結(jié)合大量的體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)探索了GSTP1重塑破骨細(xì)胞相關(guān)骨穩(wěn)態(tài)的一種全新機(jī)制,第一次詮釋了破骨細(xì)胞的細(xì)胞命運(yùn)是由GSTP1介導(dǎo)的氧化還原相關(guān)的翻譯后修飾-自噬流級(jí)聯(lián)軸來(lái)決定的[3]。

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④ 小鼠MC38和CT26細(xì)胞敲除TNFR2——結(jié)腸癌

期刊:Int. J. Biol. Sci.,IF=10.75

標(biāo)題:TNFR2 deficiency impairs the growth of mouse colon cancer

單位:澳門大學(xué)

摘要:該研究采用由源井生物提供的TNFR2基因敲除的MC38和CT26結(jié)腸癌細(xì)胞,證明了TNFR2缺失會(huì)抑制AKT信號(hào)通路,提供了進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)證據(jù)來(lái)支持阻斷TNFR2可能代表癌癥免疫治療新策略的觀點(diǎn),為開發(fā)TNFR2拮抗劑治療癌癥提供了進(jìn)一步的證據(jù)[4]。

圖3使用CRISPR/Cas9構(gòu)建和鑒定TNFR2基因敲除的MC38和CT26結(jié)腸癌細(xì)胞。(A) 流式細(xì)胞術(shù)分析(B)實(shí)時(shí)熒光定量分析

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⑤ THP-1敲除PPIA——炎癥

期刊:Cell Reports,IF=8.8

標(biāo)題:Delicate regulation of IL-1β-mediated inflammation by cyclophilin A

單位:中國(guó)科學(xué)院

摘要:該文章就CypA在炎癥激活、消退以及組織修復(fù)過(guò)程中的作用及機(jī)制進(jìn)行了深入探討,實(shí)驗(yàn)采用源井生物構(gòu)建的PPIA敲除的THP-1模型,通過(guò)LPS、免疫印跡,磷酸化等實(shí)驗(yàn),證明在LPS誘導(dǎo)的炎癥小鼠模型中,CypA主要通過(guò)調(diào)節(jié)IL-1β的表達(dá)量來(lái)控制其在炎癥不同階段中的作用[5]。

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⑥ Hela敲除astrin——銀屑病

期刊:BMC Biology,IF=7.36

標(biāo)題:CCHCR1-astrin interaction promotes centriole duplication through recruitment of CEP72

單位:深圳大學(xué)

摘要:為了驗(yàn)證HCR蛋白與中心體和有絲分裂相關(guān)蛋白互作之間的關(guān)系,該文章以HCR和astrin分別敲除的Hela細(xì)胞系作為研究材料(astrin敲除的Hela細(xì)胞系由源井生物提供),HCR或astrin的缺失將顯著降低CEP72和隨后的MCPH蛋白的中心體定位;而HCR的缺失將導(dǎo)致中心粒復(fù)制缺陷、有絲分裂錯(cuò)誤,以及多極紡錘體形成、基因組不穩(wěn)定和DNA損傷等。由此揭示出HCR通過(guò)與astrin互作,可確保有效的中心體復(fù)制和其他中心體相關(guān)功能穩(wěn)定(見圖4)。該發(fā)現(xiàn)為HCR的分子功能提供了更深入的了解,有助于更好地探索HCR在銀屑病和其他疾病中的作用[6]。

圖4 HCR及其相關(guān)蛋白在中心體上的定位及調(diào)控關(guān)系

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⑦ 293T敲除AM122A、PP5、DNA-PK——癌癥治療

期刊:Journal of Biological Chemistry,IF=5.0

標(biāo)題:Phosphatases maintain low catalytic activity of SGK1: DNA damage resets the balance in favor of phosphorylation?

單位:清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院Cecilia Canessa課題組

摘要:文章采用源井生物提供的FAM122A、PP5和DNA-PK基因敲除的293T細(xì)胞,實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)SGK1的活性受到S/T磷酸酶PP5和PP2A的作用的抑制,PP5和PP2A不斷使SGK1去磷酸化。該研究結(jié)果提供了一種分子途徑,它使SGK1獲得磷酸化和催化活性,并促進(jìn)細(xì)胞存活,該發(fā)現(xiàn)可能對(duì)開發(fā)靶向SGK1的新型癌癥療法具有重要意義[7]。

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⑧ RAW264.7敲除HIF-1α——骨質(zhì)疏松

期刊:Bone,IF=4.63

標(biāo)題: HIF-1α?mediates osteoclast-induced disuse osteoporosis via cytoophidia in the femur of mice

單位:同濟(jì)大學(xué)附屬口腔醫(yī)院

摘要:研究采用源井生物構(gòu)建的敲除HIF-1α基因的RAW264.7細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)敲除該基因可以改善小梁骨中的破骨細(xì)胞骨吸收,揭示了HIF-1α基因在支持破骨細(xì)胞發(fā)生和骨吸收中的新作用,并為其參與骨質(zhì)疏松癥發(fā)病中的作用提供了直接證據(jù)[8]。

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⑨ NIH-3T3敲除TSC2——結(jié)節(jié)性硬化癥

期刊:Cell Biochemistry and Biophysics,IF=2.99

標(biāo)題: Construction of TSC2 knockout cell line using CRISPR/Cas9 system and demonstration of its effects on NIH-3T3 cells

單位:北京協(xié)和醫(yī)院

摘要:TSC2基因在結(jié)節(jié)性硬化癥(TSC)的發(fā)生發(fā)展中起重要作用,該研究利用源井生物構(gòu)建的TSC2基因敲除的NIH-3T3現(xiàn)貨細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)敲除TSC2可增強(qiáng)NIH-3T3細(xì)胞的增殖和侵襲。此外,基因敲除細(xì)胞系可以模擬TSC患者的藥理學(xué)特征,可作為進(jìn)一步研究TSC的有效工具[9]。

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源井生物致力于為全球科研人員提供更多基因編輯細(xì)胞模型,助力疾病機(jī)制、疾病診斷、藥物研發(fā)和基因治療等研究,為人類醫(yī)學(xué)發(fā)展添磚加瓦!

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參考文獻(xiàn):

[1]Liang, J., Li, G., Liao, J. et al. Non-coding small nucleolar RNA SNORD17 promotes the progression of hepatocellular carcinoma through a positive feedback loop upon p53 inactivation. Cell Death Differ 29, 988–1003 (2022).

[2]Zhu Y, Zhang Y, Fan Z, et al. Silica Nanoparticles Trigger Chaperone HSPB8‐Assisted Selective Autophagy via TFEB Activation in Hepatocytes[J]. Small, 2023, 19(5): 2204310.

[3]Ji X, Hong J, Yang W, et al. GSTP1-mediated S-glutathionylation of Pik3r1 is a redox hub that inhibits osteoclastogenesis through regulating autophagic flux[J]. Redox Biology, 2023, 61: 102635.

[4]Li P, Yang Y, Yang X, et al. TNFR2 deficiency impairs the growth of mouse colon cancer[J]. International Journal of Biological Sciences, 2023, 19(4): 1024.

[5]Yang W, Bai X, Luan X, et al. Delicate regulation of IL-1β-mediated inflammation by cyclophilin A[J]. Cell reports, 2022, 38(11).

[6]Ying Z, Wang K, Wu J, et al. CCHCR1-astrin interaction promotes centriole duplication through recruitment of CEP72[J]. BMC biology, 2022, 20(1): 1-21.

[7]Gu W, Zheng H, Canessa C M. Phosphatases maintain low catalytic activity of SGK1: DNA damage resets the balance in favor of phosphorylation[J]. Journal of Biological Chemistry, 2023: 104941.

[8]Bie M, Tang Y, Xia Y, et al. HIF-1α mediates osteoclast-induced disuse osteoporosis via cytoophidia in the femur of mice[J]. Bone, 2023, 168: 116648.

[9]Wang X, Zhao Y, Wang Z, et al. Construction of TSC2 knockout cell line using CRISPR/Cas9 system and demonstration of its effects on NIH-3T3 cells[J]. Cell Biochemistry and Biophysics, 2022, 80(4): 681-687.


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