孟德爾隨機(jī)化丨IF=38.64,沒有因果關(guān)系也能發(fā)高分文章!
2023年以來浙中醫(yī)大學(xué)鄭老師開設(shè)了一系列醫(yī)學(xué)科研統(tǒng)計(jì)課程,零基礎(chǔ)入門醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)包括R語言、meta分析、臨床預(yù)測模型、真實(shí)世界臨床研究、問卷與量表分析、醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)與SPSS、臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)分析、重復(fù)測量資料分析、結(jié)構(gòu)方程模型、孟德爾隨機(jī)化等10門課,如果您有需求,不妨點(diǎn)擊下方跳轉(zhuǎn)查看:
2023年鄭老師多門科研統(tǒng)計(jì)課程:多次直播,含孟德爾隨機(jī)化方法

2023年4月,安徽醫(yī)科大學(xué)杜憶南教授指導(dǎo)其本科生團(tuán)隊(duì)在傳染病學(xué)著名期刊《Journal of Infection》發(fā)表題為:Non-causal association of COVID-19 with systemic lupus erythematosus: Evidence from a bidirectional Mendelian randomization的研究論文(IF=38.64)。
這項(xiàng)雙向孟德爾隨機(jī)化研究表明基因預(yù)測的易感性、住院率和COVID-19的嚴(yán)重程度與系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)的風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。

摘要與主要結(jié)果
一、摘要
背景:?使用雙向的MR來揭示COVID-19和系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)之間的因果關(guān)系,即分別評(píng)估COVID-19對(duì)SLE和SLE對(duì)COVID-19的影響。
方法:?采用逆方差加權(quán)(IVW)模型作為主要的分析方法,并應(yīng)用額外的敏感性分析方法,即MR-Egger、加權(quán)中位數(shù)和加權(quán)模式,以確保結(jié)果的穩(wěn)健性。多重性是通過MR-Egger回歸的截距估計(jì)的,異質(zhì)性是通過IVW方法中的Cochran's Q檢驗(yàn)評(píng)估的。我們還通過留一法評(píng)估了個(gè)別SNP是否存在獨(dú)立影響結(jié)果的偏差。
結(jié)果:?COVID-19與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的風(fēng)險(xiǎn)之間存在非因果關(guān)系。COVID-19對(duì)系統(tǒng)性紅斑狼瘡(IVW法:OR=0.89,95%CI 0.54-1.45,P=0.63;OR=0.94,95%CI 0.75-1.18,P=0.60;OR=1.06,95%CI 0.97-1.15,P=0.18),以及SLE對(duì)COVID-19的易感性、住院和嚴(yán)重性(IVW法:OR = 0.99,95% CI 0.99-1.00,P = 0.09;OR = 0.99,95% CI 0.98-1.01,P = 0.49;OR = 0.99,95% CI 0.96-1.02,P = 0.43)有遺傳關(guān)系。MR-Egger、加權(quán)中位數(shù)和加權(quán)模式方法的結(jié)果與IVW分析一致?;跇颖玖亢徒忉尫讲钣?jì)算的MR分析的統(tǒng)計(jì)能力是足夠的(90%)。在敏感性測試中沒有發(fā)現(xiàn)多態(tài)性,也沒有SNPs獨(dú)立地推動(dòng)了撇開敏感性的結(jié)果,表明因果效應(yīng)估計(jì)的可靠性。
結(jié)論:?基因預(yù)測的易感性、住院率和COVID-19的嚴(yán)重程度與SLE的風(fēng)險(xiǎn)無關(guān)。
設(shè)計(jì)與統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
一、數(shù)據(jù)來源
在歐洲人群中使用全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)的匯總統(tǒng)計(jì)進(jìn)行了MR研究,并在東亞裔個(gè)體中復(fù)制了結(jié)果。COVID-19最大的GWAS數(shù)據(jù)來自基于COVID-19宿主遺傳學(xué)倡議的最新r7版本。于SLE的結(jié)果,meta-GWAS產(chǎn)生了迄今為止最大的GWAS匯總統(tǒng)計(jì),由14267人組成。
二、統(tǒng)計(jì)方法
1.為了避免混雜因素引起的潛在多效性效應(yīng),我們通過PhenoScanner網(wǎng)站(http://www.phenoscanner.medschl.cam.ac.uk/)刪除了與COVID-19和SLE的這些混雜因素相關(guān)的潛在混雜SNP。
2.逆方差加權(quán)(IVW)模型、MR-Egger、加權(quán)中位數(shù)、加權(quán)模式
COVID-19與系統(tǒng)性紅斑狼瘡的風(fēng)險(xiǎn)之間存在非因果關(guān)系。COVID-19對(duì)系統(tǒng)性紅斑狼瘡(IVW法:OR=0.89,95%CI 0.54-1.45,P=0.63;OR=0.94,95%CI 0.75-1.18,P=0.60;OR=1.06,95%CI 0.97-1.15,P=0.18),以及SLE對(duì)COVID-19的易感性、住院和嚴(yán)重性(IVW法:OR = 0.99,95% CI 0.99-1.00,P = 0.09;OR = 0.99,95% CI 0.98-1.01,P = 0.49;OR = 0.99,95% CI 0.96-1.02,P = 0.43)有遺傳關(guān)系。MR-Egger、加權(quán)中位數(shù)和加權(quán)模式方法的結(jié)果與IVW分析一致。

詳情請(qǐng)點(diǎn)擊下方:
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAwOTYyMDY3OQ==&mid=2650405111&idx=4&sn=d5a4f5991d7835811522d50cf6954e98&chksm=8351855fb4260c49bcb7130ec5f767d75b157322fc410bf5cdc044926139f201cb6b8032d5fc&token=482467525&lang=zh_CN#rd


2023年統(tǒng)計(jì)服務(wù)
2023年,我們將開展從科研設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)分析、統(tǒng)計(jì)學(xué)報(bào)告等醫(yī)學(xué)科研研究方法咨詢與服務(wù)多項(xiàng)服務(wù),若您有課題經(jīng)費(fèi)可以支持,歡迎您提前和我們聯(lián)系,2022底前采用預(yù)付方式與我們開展合作。
2023年統(tǒng)計(jì)服務(wù)開啟!歡迎提前洽談數(shù)據(jù)分析、科研合作服務(wù)